/
/
Nuclei-isolasjon fra ferske frosne hjernesvulster for single-nucleus RNA-seq og ATAC-seq
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
1Neurology Clinic and National Center for Tumor Diseases,University Hospital Heidelberg, 2Bioinformatics and Omics Data Analytics,German Cancer Research Center (DKFZ), 3Clinical Cooperation Unit Neurooncology,German Cancer Research Center (DKFZ), 4Division of Experimental Neurosurgery, Department of Neurosurgery,University of Heidelberg, INF 400, Heidelberg, Germany
Capítulos
- 00:04Introduction
- 01:01Tissue Dissection and Dissociation
- 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
- 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
- 05:57Conclusion
Intra-tumoral heterogenitet er et iboende trekk ved svulster, inkludert gliomer. Vi utviklet en enkel og effektiv protokoll som benytter en kombinasjon av buffere og gradient sentrifugering for å isolere enkeltkjerner fra ferskfrossen gliomavev for enkeltkjerne RNA- og ATAC-sekvenseringsstudier.
