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Kartierung der Struktur-Funktions-Beziehungen ungeordneter onkogener Transkriptionsfaktoren mittels Transkriptomanalyse
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1Center for Childhood Cancer and Blood Diseases,Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children’s Hospital, 2Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program,The Ohio State University, 3Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant,The Ohio State University, 4Department of Pediatrics,The Ohio State University
Capítulos
- 00:04Introduction
- 00:55In Vitro Construct Panel Setup
- 02:07Cell Collection
- 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
- 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
- 05:32Differential Expression
- 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
- 09:31Conclusion
Intrinsisch ungeordnete Domänen sind wichtig für die Funktion des onkogenen Fusionstranskriptionsfaktors. Um diese Proteine therapeutisch anzugreifen, ist ein detaillierteres Verständnis der Regulationsmechanismen dieser Domänen erforderlich. Hier verwenden wir Transkriptomik, um wichtige strukturelle Merkmale der intrinsisch gestörten EWS-Domäne im Ewing-Sarkom abzubilden.
