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Mappatura delle relazioni struttura-funzione dei fattori di trascrizione oncogenica disordinati utilizzando l'analisi trascrittomica
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1Center for Childhood Cancer and Blood Diseases,Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children’s Hospital, 2Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program,The Ohio State University, 3Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant,The Ohio State University, 4Department of Pediatrics,The Ohio State University
Capítulos
- 00:04Introduction
- 00:55In Vitro Construct Panel Setup
- 02:07Cell Collection
- 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
- 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
- 05:32Differential Expression
- 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
- 09:31Conclusion
I domini intrinsecamente disordinati sono importanti per la funzione del fattore di trascrizione di fusione oncogenica. Per indirizzare terapeuticamente queste proteine, è necessaria una comprensione più dettagliata dei meccanismi di regolazione impiegati da questi domini. Qui, usiamo la trascrittomica per mappare importanti caratteristiche strutturali del dominio EWS intrinsecamente disordinato nel sarcoma di Ewing.
