Journal
/
Pesquisa do Câncer
/
Отображение структурно-функциональных отношений неупорядоченных онкогенных факторов транскрипции с использованием транскриптомного анализа
JoVE Journal
Pesquisa do Câncer
This content is Free Access.
JoVE Journal Pesquisa do Câncer
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Отображение структурно-функциональных отношений неупорядоченных онкогенных факторов транскрипции с использованием транскриптомного анализа

DOI:
10.3791/61564-v

•

09:58 min

•

June 27, 2020

•

, , , , ,
1Center for Childhood Cancer and Blood Diseases,Abigail Wexner Research Institute at Nationwide Children’s Hospital, 2Molecular, Cellular, and Developmental Biology Program,The Ohio State University, 3Division of Pediatric Hematology/Oncology/Blood & Marrow Transplant,The Ohio State University, 4Department of Pediatrics,The Ohio State University

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Внутренне неупорядоченные домены важны для функции фактора транскрипции онкогенного слияния. Чтобы терапевтически нацелиться на эти белки, требуется более подробное понимание регуляторных механизмов, используемых этими доменами. Здесь мы используем транскриптомику для отображения важных структурных особенностей внутренне неупорядоченного домена EWS в саркоме Юинга.

Tags

Keywords: TranscriptomicsStructure-function AnalysisDisordered Transcription FactorsOncogenic Fusion ProteinsEWS/FLIPartial Function DetectionRNA SequencingCDNA ExpressionVirus TransductionCell CultureSelectionProtein Extraction

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/61564?article_type=v

Определение и характеристика метастатическим факторов путем переноса генов в романе RIP-тег; РИП tva мышиных модель
check_url/pt/61564?article_type=v

С помощью ТРИФОСФАТЫ/Cas9 гена, редактирования для изучения онкогенных активность мутантов Calreticulin в зависимых Cytokine гемопоэтических клеток
check_url/pt/61564?article_type=v

Простой и быстрый метод для получения высокого качества опухоли ДНК от клинических патологических образцов с помощью касания отпечаток цитологии
check_url/pt/61564?article_type=v

Интегрированная платформа для картирования генома общесистемной Chromatin государств с использованием высокопроизводительный чип последовательности в тканях опухоли
check_url/pt/61564?article_type=v

Двойное воздействие на дифференциации адипоциты костного факторов клеток меланомы
check_url/pt/61564?article_type=v

Онкогенный гепатоцит индуцированной ортотопической мыши Модель гепатоцеллюлярного рака, возникающих в настройке воспаления печеночного и фиброза
check_url/pt/61564?article_type=v

Онкогенный ген Fusion Обнаружение Использование якорный мультиплекс полимеразы Цепная реакция после следующего поколения секвенирования
check_url/pt/61564?article_type=v

Анализ факторов экспрессии генов опухоли с веб-порталом CorExplorer
check_url/pt/61564?article_type=v

Идентификация регуляторов транскрипционных факторов с использованием средне-пролимчатого скрининга архиерейных библиотек и репортера на основе двойной люциферазы
check_url/pt/61564?article_type=v

Оценка гибели клеток с использованием бесклеточного супернатанта пробиотиков в трехмерных сфероидных культурах колоректальных раковых клеток

Read Article