Journal
/
/
Kartläggning av strukturfunktionsrelationer för oordnade onkogena transkriptionsfaktorer med transkriptomisk analys
JoVE Journal
Pesquisa do Câncer
This content is Free Access.
JoVE Journal Pesquisa do Câncer
Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis
DOI:

09:58 min

June 27, 2020

, , , , ,

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:55In Vitro Construct Panel Setup
  • 02:07Cell Collection
  • 02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
  • 03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
  • 05:32Differential Expression
  • 07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
  • 09:31Conclusion

Summary

Tadução automática

Inneboende oordnade domäner är viktiga för onkogen fusion transkription faktor funktion. För att terapeutiskt rikta in sig på dessa proteiner krävs en mer detaljerad förståelse av de regleringsmekanismer som används av dessa domäner. Här använder vi transkriptomik för att kartlägga viktiga strukturella funktioner i den inneboende oordnade EWS-domänen i Ewing sarkom.

Vídeos Relacionados

Read Article