Journal
/
Bioquímica
/
Semi-kvantitativ analyse av peptidoglykan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatikk
JoVE Journal
Bioquímica
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Bioquímica
Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Semi-kvantitativ analyse av peptidoglykan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatikk

DOI:
10.3791/61799-v

•

09:09 min

•

October 13, 2020

•

, , ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,University of Guelph, 2Mass Spectrometry Facility,University of Guelph

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 01:07Peptidoglycan Sacculi Extraction
  • 03:17Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Chromatogram Spectral Processing
  • 04:11Differential Spectral Feature Analysis
  • 05:06Muropeptide Annotation Spectral Features
  • 06:18Muropeptide Global Change Modification Assessment
  • 07:07Results: Representative Muropeptide Fragmentation and Identification and Peptidoglycan Composition Analysis
  • 08:31Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Denne protokollen dekker en detaljert analyse av peptidoglykansammensetning ved bruk av væskekromatografi massespektrometri kombinert med avansert funksjonsekstraksjon og bioinformatisk analyseprogramvare.

Tags

Keywords: PeptidoglycanMass SpectrometryBioinformaticsPeptidoglycomicsSacculi ExtractionSDS TreatmentEnzymatic DigestionLiquid Chromatography-mass Spectrometry

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/61799?article_type=v

Time-løst elektrospray-ionisering Hydrogen-deuterium Veksling massespektrometri for å studere Protein struktur og dynamikk
check_url/pt/61799?article_type=v

Løse affinitetsrenset protein komplekser av Blå Native PAGE og Protein korrelasjon Profiling
check_url/pt/61799?article_type=v

Et tandem-væskekromatografi-massespektrometri basert tilnærming for Metabolitt Analyse av<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/pt/61799?article_type=v

Lipid Droplet Isolasjon for Quantitative massespektrometri analyse
check_url/pt/61799?article_type=v

Dyp proteom profilering av isobar merking, omfattende flytende Ture, massespektrometri og Software-baserte kvantifisering
check_url/pt/61799?article_type=v

Korrekturlesing og DNA reparasjon analysen Single nukleotid forlengelse og MALDI-TOF massespektrometri analyse
check_url/pt/61799?article_type=v

Påvisning av protein ubiquitination nettsteder av peptid berikelse og masse spektrometri
check_url/pt/61799?article_type=v

Nitropeptide profilering og identifisering illustrert av angiotensin II
check_url/pt/61799?article_type=v

Identifisering av Inositol fosfat eller Fosfoinositid samspill proteiner av affinitet kromatografi koplet til Western Blot eller Mass massespektrometri
check_url/pt/61799?article_type=v

Absolutt kvantifisering av Cell-fri protein syntese metabolisme av reversert-fase flytende kromatografi-Mass massespektrometri

Read Article