Journal
/
Environment
/
Udvikling og afprøvning af artsspecifikke kvantitative PCR-analyser til miljø-DNA-applikationer
JoVE Journal
Environment
This content is Free Access.
JoVE Journal Environment
Development and Testing of Species-specific Quantitative PCR Assays for Environmental DNA Applications

Udvikling og afprøvning af artsspecifikke kvantitative PCR-analyser til miljø-DNA-applikationer

DOI:
10.3791/61825-v

•

08:54 min

•

November 05, 2020

•

, , ,
1Columbia Environmental Research Center,U.S. Geological Survey

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:18Generation of a Sequence Database of Mitochondrial DNA Sequences from Target and Non-target Species of Interest
  • 02:03Assay Design
  • 03:56Assay Screening and Optimization
  • 06:21Results: A. ligamentina qPCR Assay
  • 08:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Miljømæssige DNA-analyser kræver streng design, test, optimering og validering, før indsamlingen af feltdata kan begynde. Her præsenterer vi en protokol til at tage brugerne gennem hvert trin i udformningen af en artsspecifik, sonde-baseret qPCR analyse for påvisning og kvantificering af et mål arter DNA fra miljøprøver.

Tags

Environmental DNAEDNAQuantitative PCRQPCRSpecies-specific AssayAssay DesignSequence AlignmentNCBIGeneiousMUSCLEPrimer DesignProbe DesignContaminationConservationWildlife Management

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/61825?article_type=v

Protokoller for Robust herbicidresistens Afprøvning i forskellige ukrudtsarter
check_url/61825?article_type=v

Forberedelse og Test af Impedans-baserede strømningstekniske Biochips med RTgill-W1 Celler til hurtig evaluering af drikkevand Prøver til Toksicitet
check_url/61825?article_type=v

Anvendelse af en filterpatron til filtrering af vandprøver og Udvinding af Environmental DNA
check_url/61825?article_type=v

En Flow-through Exposure system til evaluering suspenderet sediment Virkninger på vandlevende
check_url/61825?article_type=v

Evaluering af effekten af ​​Environmental Chemicals på Honey Bee Udvikling fra den enkelte til Colony Level
check_url/61825?article_type=v

Spredning af nanomaterialer i vandige medier: mod protokollen optimering
check_url/61825?article_type=v

Forberedelse af DMMTAV og DMDTAV bruger DMAV for miljømæssige programmer: syntese, rensning og bekræftelse
check_url/61825?article_type=v

Opstandelsen af hvilende Daphnia magna: protokol og applikationer
check_url/61825?article_type=v

Protokol for akut og kronisk Økotoksicitet afprøvning af turkis Killifish Nothobranchius furzeri
check_url/61825?article_type=v

Bioindication afprøvning af Stream miljø egnethed for unge ferskvands perle muslinger med In Situ eksponering metoder

Read Article