Här beskriver vi en enkel metod som kombinerar RNA fluorescens in situ hybridisering (RNA-FISH) med immunofluorescens för att visualisera allvarliga akut respiratoriska syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA. Detta protokoll kan öka förståelsen för de molekylära egenskaperna hos SARS-CoV-2 RNA-värd interaktioner på en cell nivå.