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In-Nucleus Hi-C nelle cellule di Drosophila
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Genética
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JoVE Journal Genética
In-Nucleus Hi-C in Drosophila Cells
DOI:

11:58 min

September 15, 2021

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Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 01:13Schneiders Line 2 Plus (S2R+) Drosophila Cell Fixation
  • 02:02Lysis
  • 03:18Enzymatic Digestion, DNA End Biotinylation, and Ligation
  • 04:37Crosslink Reversal and DNA Purification
  • 05:33Hi-C Template Quality Evaluation
  • 06:26Biotin Removal/End Repair and Size Selection
  • 07:49Biotin Pulldown/A-Tailing/Adapter Ligation
  • 09:33Results: Representative In-Nucleus Hi-C Analysis
  • 11:17Conclusion

Summary

Tadução automática

Il genoma è organizzato nello spazio nucleare in diverse strutture che possono essere rivelate attraverso tecnologie di cattura della conformazione cromosomica. Il metodo Hi-C in-nucleus fornisce una raccolta a livello di genoma di interazioni cromatiniche nelle linee cellulari di Drosophila, che genera mappe di contatto che possono essere esplorate a risoluzione megabase a livello di frammento di restrizione.

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