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Divergence du microbiote racinaire dans différents habitats sur la base de réseaux de corrélation pondérés
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Biologia
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JoVE Journal Biologia
Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks
DOI:

09:49 min

September 25, 2021

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Capítulos

  • 00:06Introduction
  • 00:46I. Data Download
  • 01:05II. Optimal Power Value Determination
  • 02:38III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification
  • 04:25IV. Preservation Test
  • 05:44V. Correlation Analysis of the Module Membership
  • 06:55VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module
  • 07:43Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network
  • 09:18Conclusion

Summary

Tadução automática

L’analyse du réseau a été appliquée pour évaluer l’association de diverses communautés microbiennes écologiques, telles que le sol, l’eau et la rhizosphère. Présenté ici est un protocole sur la façon d’utiliser l’algorithme WGCNA pour analyser différents réseaux de co-occurrence qui peuvent se produire dans les communautés microbiennes en raison de différents environnements écologiques.

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