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가중 상관 관계 네트워크에 따라 다른 서식지에서 루트 미생물의 발산
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Biologia
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JoVE Journal Biologia
Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks
DOI:

09:49 min

September 25, 2021

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Capítulos

  • 00:06Introduction
  • 00:46I. Data Download
  • 01:05II. Optimal Power Value Determination
  • 02:38III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification
  • 04:25IV. Preservation Test
  • 05:44V. Correlation Analysis of the Module Membership
  • 06:55VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module
  • 07:43Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network
  • 09:18Conclusion

Summary

Tadução automática

네트워크 분석은 토양, 물 및 뿌리 부와 같은 다양한 생태 미생물 공동체의 연관성을 평가하기 위해 적용되었다. 여기에 제시된 WGCNA 알고리즘을 사용하여 다양한 생태 환경으로 인해 미생물 커뮤니티에서 발생할 수 있는 상이한 동발생 네트워크를 분석하는 방법에 대한 프로토콜이 제시된다.

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