दो फ्लोरोफोर अणुओं के बीच फॉस्टर रेजोनेंस एनर्जी ट्रांसफर (फ्रेट) का उपयोग जीवित कोशिका में प्रोटीन इंटरैक्शन का अध्ययन करने के लिए किया जा सकता है। यहां, एक प्रोटोकॉल प्रदान किया जाता है कि कॉनफोकल लेजर स्कैनिंग माइक्रोस्कोपी का उपयोग करके स्वीकर्ता के संवेदनशील उत्सर्जन का पता लगाकर और दाता अणु के शमन द्वारा जीवित कोशिकाओं में फ्रेट को कैसे मापा जाए।