Genome-wide Analysis of Histone Modifications Distribution using the Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method in <em>Magnaporthe oryzae</em>

Zechi Wu; Wanyu Sun; Sida Zhou; Li Zhang; Xinyu Zhao; Yang Xu; Weixiang Wang

doi:10.3791/62423

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Análise em todo o genoma da distribuição de modificações de histona usando o Método de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Chromatina em Magnaporthe oryzae

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Genética

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Genome-wide Analysis of Histone Modifications Distribution using the Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method in Magnaporthe oryzae

Análise em todo o genoma da distribuição de modificações de histona usando o Método de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Chromatina em Magnaporthe oryzae

DOI:

10.3791/62423-v

•

09:25 min

•

June 02, 2021

•

Zechi Wu*¹, Wanyu Sun*¹, Sida Zhou, Li Zhang, Xinyu Zhao, Yang Xu, Weixiang Wang

¹Beijing Key Laboratory of New Technology in Agricultural Application, National Demonstration Center for Experimental Plant Production Education, Department of Agronomy,Beijing University of Agriculture

Capítulos

00:04Introduction
00:39Preparation of Protoplasts from M. oryzae
01:48In Vivo Crosslinking and Sonication
03:22IP of Crosslinked Protein/DNA
04:23Collecting and Rinsing the IP Products
05:04Elution and Reverse Crosslinking of Protein/DNA Complexes
05:56Purification and Recovery of DNA
06:51DNA Repair and Solexa Library Construction
08:23Results: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Method for Genome-wide Histone Modification Analysi
08:53Conclusion

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Tadução automática

Aqui, apresentamos um protocolo para analisar a distribuição em todo o genoma das modificações de histona, que podem identificar novos genes-alvo na patogênese de M. oryzae e outros fungos filamentosos.

Análise em todo o genoma da distribuição de modificações de histona usando o Método de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Chromatina em Magnaporthe oryzae

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