É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
Capítulos
- 00:04Introduction
- 01:05The miRNA Machine (mirMachine) Setup and Testing
- 02:23Homology-Based and Novel miRNA Identification
- 03:42Advance Parameters
- 04:35Results: Performance Evaluation of the mirMachine
- 05:34Conclusion
Häri presenterar vi en ny och helautomatisk miRNA-pipeline, mirMachine som 1) kan identifiera kända och nya miRNA mer exakt och 2) är helt automatiserad och fritt tillgänglig. Användare kan nu köra ett kort överföringsskript för att köra den helautomatiska mirMachine-pipelinen.
Tags
MirMachinePlant MiRNA AnnotationComputational IdentificationHigh SensitivityHigh SpecificityAutomatedFreely AvailableGenome-wide DistributionPreliminary DataSoftware DependenciesTest DataHairpinsMature MiRNAPre-miRNAMiRNA Star SequencesChromosomesHomology-based IdentificationSRNA-seqFASTQFASTAAdapter TrimmingAbundance Table
