हम जीवित कोशिकाओं में व्यक्तिगत मैक्रोपिनोसोम्स में पीएच, ऑक्सीडेटिव घटनाओं और प्रोटीन पाचन को मापने के लिए प्रोटोकॉल का वर्णन करते हैं। दोहरी फ्लोरोफोर रेशियोमेट्रिक माइक्रोस्कोपी और जनसंख्या आधारित तकनीकों पर यह लाभ प्रदान करने पर जोर दिया जाता है।