Journal
/
/
جمعية الجينوم الهجين دي نوفو لتوليد الجينوم الكامل للبكتيريا البولية باستخدام تقنيات التسلسل قصيرة وطويلة القراءة
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies
DOI:

12:08 min

August 20, 2021

, , , , ,

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 01:00dsDNA Pool Cleanup and Concentration
  • 03:25Sequence the Genome Library
  • 05:14Long (MinION) Reads
  • 06:55Generating Hybrid Genome Assembly
  • 08:34Assessing Assembly Quality
  • 09:34Genome Annotation
  • 10:07Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria
  • 11:37Conclusion

Summary

Tadução automática

هذا البروتوكول تفاصيل نهج شامل لزراعة وتسلسل، ودي نوفو تجميع الجينوم الهجين من البكتيريا البولية. وهو يوفر إجراء قابل للتكرار لتوليد تسلسلات الجينوم الدائرية الكاملة المفيدة في دراسة كل من العناصر الوراثية الكروموسومية وخارج الكروموسومية التي تساهم في استعمار المسالك البولية، والتسبب في الإمراض، ونشر مقاومة مضادات الميكروبات.

Vídeos Relacionados

Read Article