This content is Free Access.
Capítulos
- 00:04Introduction
- 01:00dsDNA Pool Cleanup and Concentration
- 03:25Sequence the Genome Library
- 05:14Long (MinION) Reads
- 06:55Generating Hybrid Genome Assembly
- 08:34Assessing Assembly Quality
- 09:34Genome Annotation
- 10:07Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria
- 11:37Conclusion
Bu protokol, üriner bakterilerin kültleme, dizileme ve de novo hibrid genom montajı için kapsamlı bir yaklaşımı detaylandırmak. İdrar kolonizasyonuna, patogeneze ve antimikrobiyal direncin yayılmasına katkıda bulunan kromozomal ve ekstrakrozomal genetik elementlerin incelenmesinde yararlı olan tam, dairesel genom dizilerinin üretimi için tekrarlanabilir bir prosedür sağlar.
