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Inherent Dynamics Visualizer, une application interactive pour évaluer et visualiser les résultats d’un pipeline d’inférence de réseau de régulation de gènes
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Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
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Inherent Dynamics Visualizer, une application interactive pour évaluer et visualiser les résultats d’un pipeline d’inférence de réseau de régulation de gènes

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

Tadução automática

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Inherent Dynamics Visualizer est un ensemble de visualisation interactif qui se connecte à un outil d’inférence de réseau de régulation génique pour une génération améliorée et rationalisée de modèles de réseau fonctionnels. Le visualiseur peut être utilisé pour prendre des décisions plus éclairées pour paramétrer l’outil d’inférence, augmentant ainsi la confiance dans les modèles résultants.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

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