Journal
/
Bioquímica
/
Shotgun Proteomics prøvebehandling automatiseret af en open source lab robot
JoVE Journal
Bioquímica
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Bioquímica
Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot

Shotgun Proteomics prøvebehandling automatiseret af en open source lab robot

DOI:
10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

, , , ,
1Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 2Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 3Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
  • 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
  • 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
  • 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
  • 09:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Detaljeret protokol og tre Python scripts er fastsat for drift af en open source robot væske håndtering system til at udføre semi-automatiseret protein prøve forberedelse til massespektrometri eksperimenter, der dækker fjernelse af vaskemiddel, protein fordøjelse, og peptid afsaltning trin.

Tags

Shotgun ProteomicsAutomated Sample ProcessingOpen-source Lab RobotLiquid Handling SystemMass SpectrometryProtein BiochemistryProteomic StudiesAmmonium BicarbonateDTTTemperature ControlAutomationOpen-source Python Scripts

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/63092?article_type=v

Automatiseret Akustisk Udlevering til seriel fortynding af peptid agonister i Potens Bestemmelse assays
check_url/pt/63092?article_type=v

LERLIC-MS / MS for Indgående Karakterisering og Kvantificering af glutamin og asparagin deamidering i Shotgun Proteomics
check_url/pt/63092?article_type=v

Kalibrering-fri In Vitro kvantificering af Protein Homo-oligomerisering ved hjælp af kommercielle instrumentering og gratis, Open Source lysstyrke analyse Software
check_url/pt/63092?article_type=v

Forberedelse af grønkorn sub rum fra Arabidopsis til analyse af Protein lokalisering af Immunoblotting eller Proteomics
check_url/pt/63092?article_type=v

Påvisning af proteinubiquitinationssteder ved peptidberigelse og massespektrometri
check_url/pt/63092?article_type=v

Brug af open source-MALDI TOF-MS IDBac-rørledningen til analyse af mikrobiel protein og specialiserede metabolit data
check_url/pt/63092?article_type=v

En all-in-One-prøve holder til makromolekylær røntgenkrystallografi med minimal baggrunds spredning
check_url/pt/63092?article_type=v

En forberedelse til plasmaprøve til massespektrometri ved hjælp af en automatiseret arbejdsstation
check_url/pt/63092?article_type=v

TMT Prøve forberedelse til Proteomics Facility Indsendelse og efterfølgende dataanalyse
check_url/pt/63092?article_type=v

Præcis og præcis enkeltmolekyle FRET-målinger ved hjælp af Open Source smfBox

Read Article