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오픈 소스 실험실 로봇에 의해 자동화 된 산탄총 프로테오믹스 샘플 처리

JoVE Journal
Bioquímica

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JoVE Journal Bioquímica

Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot

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오픈 소스 실험실 로봇에 의해 자동화 된 산탄총 프로테오믹스 샘플 처리

DOI:

10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

Yu Han³, Cody T. Thomas³, Sara A. Wennersten³, Edward Lau³, Maggie P. Y. Lam^2,3

¹Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, ²Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, ³Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Capítulos

00:04Introduction
00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
09:44Conclusion

Summary

Tadução automática

상세한 프로토콜과 3개의 Python 스크립트는 광원 로봇 액체 처리 시스템을 운영하여 세제 제거, 단백질 소화 및 펩타이드 탈염 단계를 포함하는 대량 분광 실험에 대한 반자동 단백질 샘플 준비를 수행하기 위해 제공됩니다.

Tags

Shotgun Proteomics Automated Sample Processing Open-source Lab Robot Liquid Handling System Mass Spectrometry Protein Biochemistry Proteomic Studies Ammonium Bicarbonate DTT Temperature Control Automation Open-source Python Scripts

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