É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
Capítulos
- 00:04Introduction
- 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
- 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
- 06:58Conclusion
Denne analytiske beregningsplatform giver praktisk vejledning til mikrobiologer, økologer og epidemiologer, der er interesseret i bakteriel populationsgenomik. Specifikt demonstrerede det arbejde, der blev præsenteret her, hvordan man udfører: i) fylogeni-guidet kortlægning af hierarkiske genotyper; ii) frekvensbaseret analyse af genotyper iii) slægtskabs- og klonalitetsanalyser iv) identifikation af afstamningsdifferentierende tilbehør loci.
