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Exploration heuristique des génotypes hiérarchiques et des loci du génome accessoire dans les populations bactériennes
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Genética
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JoVE Journal Genética
Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Bacterial Populations
DOI:

08:03 min

December 07, 2021

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Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
  • 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
  • 06:58Conclusion

Summary

Tadução automática

Cette plate-forme informatique analytique fournit des conseils pratiques aux microbiologistes, aux écologistes et aux épidémiologistes intéressés par la génomique des populations bactériennes. Plus précisément, les travaux présentés ici ont démontré comment effectuer: i) une cartographie guidée par la phylogénie des génotypes hiérarchiques; ii) l’analyse des génotypes fondée sur la fréquence; iii) analyses de la parenté et de la clonalité; iv) l’identification des loci accessoires différenciant la lignée.

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