Her beskriver vi en detaljeret metode til mitokondrier isolering fra musens skeletmuskulatur og den efterfølgende analyse af åndedræt ved Oxygen Consumption Rate (OCR) ved hjælp af mikropladebaserede respirometriske assays. Denne rørledning kan anvendes til at studere virkningerne af flere miljømæssige eller genetiske indgreb på mitokondriemetabolisme.