Global Level Quantification of Histone Post-Translational Modifications in a 3D Cell Culture Model of Hepatic Tissue

Jazmine-Saskya N. Joseph-Chowdhury; Stephanie Stransky; Sarah Graff; Ronald Cutler; Dejauwne Young; Julie S. Kim; Carlos Madrid-Aliste; Jennifer T. Aguilan; Edward Nieves; Yan Sun; Edwin J. Yoo; Simone Sidoli

doi:10.3791/63606

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हेपेटिक ऊतक के 3 डी सेल संस्कृति मॉडल में हिस्टोन पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों का वैश्विक स्तर का परिमाणीकरण

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Global Level Quantification of Histone Post-Translational Modifications in a 3D Cell Culture Model of Hepatic Tissue

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हेपेटिक ऊतक के 3 डी सेल संस्कृति मॉडल में हिस्टोन पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों का वैश्विक स्तर का परिमाणीकरण

DOI:

10.3791/63606-v

•

08:12 min

•

May 05, 2022

•

Jazmine-Saskya N. Joseph-Chowdhury, Stephanie Stransky, Sarah Graff, Ronald Cutler, Dejauwne Young, Julie S. Kim, Carlos Madrid-Aliste, Jennifer T. Aguilan, Edward Nieves, Yan Sun, Edwin J. Yoo, Simone Sidoli

¹Department of Biochemistry,Albert Einstein College of Medicine

Capítulos

00:04Introduction
00:53Preparation of the 3D Culture System
02:20Growth of Spheroids in the Bioreactor
03:15Histone Extraction
04:27The First Round of Derivatization
05:03Desalting, Sample Cleanup, and Sample Preparation for LC-MS/MS
06:08Results: Identification and Quantification of Histone Post-Translational Modifications
07:37Conclusion

Summary

Tadução automática

यह प्रोटोकॉल रेखांकित करता है कि कैसे एक त्रि-आयामी सेल संस्कृति प्रणाली का उपयोग निकट-शारीरिक स्थिति में क्रोमैटिन संशोधनों को मॉडल, इलाज और विश्लेषण करने के लिए किया जा सकता है।

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समारोह का अध्ययन है, सहभागिता, और बाद translational संशोधनों के लिए नवोदित खमीर प्रोटीन निष्कर्षण और शोधन

संयंत्र प्रोटीन परिसरों के बाद translational संशोधनों की पहचान

Hypoxia निम्नलिखित एकल कोशिका के स्तर पर ग्लोबल शाही सेना संश्लेषण का विश्लेषण

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Histone बाद translational संशोधनों के विश्लेषण के लिए पूरा कार्यप्रवाह नीचे अप मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग: Histone निकासी से डेटा विश्लेषण करने के लिए

हेपेटिक ऊतक के 3 डी सेल संस्कृति मॉडल में हिस्टोन पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों का वैश्विक स्तर का परिमाणीकरण

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