Journal
/
Biologia
/
التنميط على نطاق الجينوم لتفاعلات ربط عامل النسخ والحمض النووي في المبيضات البيضاء: طريقة CUT & RUN شاملة وسير عمل تحليل البيانات
JoVE Journal
Biologia
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
Genome-wide Profiling of Transcription Factor-DNA Binding Interactions in Candida albicans: A Comprehensive CUT&RUN Method and Data Analysis Workflow
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

التنميط على نطاق الجينوم لتفاعلات ربط عامل النسخ والحمض النووي في المبيضات البيضاء: طريقة CUT & RUN شاملة وسير عمل تحليل البيانات

DOI:
10.3791/63655-v

•

07:48 min

•

April 01, 2022

•

, , , , , ,
1Department of Molecular and Cell Biology,University of California, Merced, 2Quantitative and Systems Biology Graduate Program,University of California, Merced, 3Department of Applied Mathematics,University of California, Merced, 4Health Sciences Research Institute,University of California, Merced

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:49Isolation of Nuclei and Primary Antibody Binding
  • 02:40Binding of pAG-MNase to Antibody
  • 03:36Library Preparation for Sequencing
  • 05:22CUT&RUN Sequence Analysis
  • 05:54Results: Quality Control Steps and Evaluation of Ndt80 and Efg1 Enriched Peaks Using CUT&RUN Protocol
  • 07:22Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

يصف هذا البروتوكول طريقة تجريبية وسير عمل تحليل البيانات للانقسام تحت الأهداف والإطلاق باستخدام nuclease (CUT & RUN) في مسببات الأمراض الفطرية البشرية المبيضات البيضاء.

Tags

Genome-wide ProfilingTranscription Factor-DNA BindingCandida AlbicansCUT&RUNChIP-chipChIP-seqEpitope TaggingNuclei IsolationFluorescence MicroscopyAntibody IncubationProtein AG-MNaseData Analysis Workflow

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

الجينوم على نطاق تحليل المستويات (شحن) من الحمض الريبي النووي النقال باستخدام Aminoacylation ميكروأرس]

الجينوم على نطاق التحليل باستخدام رقاقة لتحديد أهداف محددة الجينات شكل الإسوي

تحليل كمي لياقة سير العمل

رواية النظرية الافتراضية تغيير نقطة حسابي لتحليل الجينوم-اسعة من أنواع البيانات المتنوعة ChIPseq

حذوفات الجينات في الجينوم على نطاق<em> العقدية الدم</em> من جانب PCR إنتاجية عالية

Polysome تجزئة وتحليل الثدييات Translatomes على مقياس الجينوم على نطاق

على صعيد رسم الخرائط الجينوم من المخدرات-DNA التفاعلات في الخلايا مع COSMIC (يشابك من الجزيئات الصغيرة لعزل لونين)

سير العمل كاملا لتحليل هيستون التعديلات بعد متعدية عن طريق أسفل إلى أعلى الطيف الكتلي: من هيستون استخراج لتحليل البيانات

سير عمل شامل للتعرف على نطاق الجينوم والتحليل التلوي التعبير الأسرة الجينات ATL E3 Ubiquitin ليجاسى في الكرمة

سير عمل شامل من Mass Spectrometry القائم على بروتيوميات بندقية من عينات الأنسجة

Read Article