वर्तमान प्रोटोकॉल टोमो 5 का उपयोग करके उच्च-रिज़ॉल्यूशन क्रायो-इलेक्ट्रॉन टोमोग्राफी रिमोट डेटा अधिग्रहण का वर्णन करता है और बाद में डेटा प्रोसेसिंग और सबटोमोग्राम औसत का उपयोग करके ईएमक्लारिटी का उपयोग करता है। एपोफेरिटिन का उपयोग 2.86 ए रिज़ॉल्यूशन पर क्रायो-ईटी संरचना प्राप्त करने के लिए विस्तृत चरण-दर-चरण प्रक्रियाओं को चित्रित करने के लिए एक उदाहरण के रूप में किया जाता है।