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Acquisizione della conformazione cromosomica su scale di lunghezza
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Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales
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Acquisizione della conformazione cromosomica su scale di lunghezza

DOI:
10.3791/64001-v

•

10:15 min

•

January 20, 2023

•

, , ,
1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:45Fixation by Crosslinking
  • 03:32Chromosome Conformation Capture
  • 08:22Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
  • 09:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Hi-C 3.0 è un protocollo Hi-C migliorato che combina crosslinker di formaldeide e disuccinimidil glutarato con un cocktail di enzimi di restrizione DpnII e DdeI per aumentare il rapporto segnale-rumore e la risoluzione del rilevamento dell'interazione cromatina.

Tags

Keywords: Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

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