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Capturando a Conformação Cromossômica Através de Escalas de Comprimento
JoVE Journal
Genética
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JoVE Journal Genética
Capturing Chromosome Conformation Across Length Scales

Capturando a Conformação Cromossômica Através de Escalas de Comprimento

DOI:
10.3791/64001-v

•

10:15 min

•

January 20, 2023

•

, , ,
1Department of Systems Biology,University of Massachusetts Medical School, 2Howard Hughes Medical Institute

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:45Fixation by Crosslinking
  • 03:32Chromosome Conformation Capture
  • 08:22Results: Three‐Dimensional Chromatin Interactions Detection
  • 09:44Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

O Hi-C 3.0 é um protocolo Hi-C aprimorado que combina reticulantes de formaldeído e glutarato de disuccinimidil com um coquetel de enzimas de restrição DpnII e DdeI para aumentar a relação sinal-ruído e a resolução da detecção da interação cromatina.

Tags

Keywords: Chromosome ConformationDNAChromatinCross-linkingRestriction EndonucleasesLigationLibrary PreparationHi-C3C4C5CSequencingGenomeProtocolDSGFormaldehydeGlycineCell CultureCentrifugationFixation

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