In vitro transkripsjonsanalyser kan tyde mekanismene for transkripsjonsregulering i Borreliella burgdorferi. Denne protokollen beskriver trinnene for å rense B. burgdorferi RNA-polymerase og utføre in vitro transkripsjonsreaksjoner. Eksperimentelle tilnærminger ved bruk av in vitro transkripsjonsanalyser krever pålitelig rensing og lagring av aktiv RNA-polymerase.