बेंचटॉप उपकरणों का उपयोग करके पूरे जीनोम अनुक्रमण (डब्ल्यूजीएस) रणनीतियों की व्यवहार्यता ने प्रयोगशाला सेटिंग में सार्वजनिक स्वास्थ्य प्रासंगिकता के प्रत्येक माइक्रोब की जीनोम पूछताछ को सरल बना दिया है। बैक्टीरियल डब्ल्यूजीएस के लिए वर्कफ़्लो का एक पद्धतिगत अनुकूलन वर्णित है और विश्लेषण के लिए एक जैव सूचना विज्ञान पाइपलाइन भी प्रस्तुत की गई है।