Journal
/
Bioquímica
/
Sondering av RNA-struktur med dimetylsulfatmutationsprofilering med sekvensering in vitro och i celler
JoVE Journal
Bioquímica
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioquímica
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Sondering av RNA-struktur med dimetylsulfatmutationsprofilering med sekvensering in vitro och i celler

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Protokollet ger instruktioner för modifiering av RNA med dimetylsulfat för mutationsprofileringsexperiment. Den inkluderar in vitro - och in vivo-sondering med två alternativa biblioteksberedningsmetoder.

Tags

Keywords: RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/64820?article_type=v

Tidsupplöst elektrosprayjonisering Väte-deuterium Exchange-masspektrometri för att studera Protein Structure and Dynamics
check_url/pt/64820?article_type=v

Undersökande Proteinsekvens-struktur-dynamik Förhållanden med Bio3D-webben
check_url/pt/64820?article_type=v

Polysome profilering i Leishmania, mänskliga celler och mus Testis
check_url/pt/64820?article_type=v

Karakterisering av glykoproteiner med immunglobulin luckan av röntgenkristallografi och biofysiska tekniker
check_url/pt/64820?article_type=v

Sondera strukturen och dynamiken i Nucleosomes med hjälp av Atomic Force Microscopy Imaging
check_url/pt/64820?article_type=v

Webbplats riktad mutagenes för In Vitro och i Vivo experiment exemplifieras med RNA interaktioner i Escherichia Coli
check_url/pt/64820?article_type=v

Interaktioner med och membran permeabilisering av hjärnans Mitokona av amyloid fibriller
check_url/pt/64820?article_type=v

Extremt snabb och specifik metabolisk märkning av RNA in vivo med 4-Thiouracil (Ers4tU)
check_url/pt/64820?article_type=v

Snabb och kostnadseffektiv RNA-utvinning av råtta bukspottskörteln vävnad
check_url/pt/64820?article_type=v

Fosfoproteomisk strategi för profilering av osmotisk stresssignalering i Arabidopsis

Read Article