Kryo-STEM-tomografi gir et middel til å visualisere organeller av intakte celler uten innebygging, seksjonering eller andre invasive preparater. Den oppnådde 3D-oppløsningen ligger for tiden i området noen få nanometer, med et synsfelt på flere mikrometer og en tilgjengelig tykkelse i størrelsesorden 1 μm.