उच्च गुणवत्ता के अलगाव, शाही सेना बरकरार कई प्रयोगशाला प्रोटोकॉल में एक आवश्यक कदम है. यहाँ, हम पूरे zebrafish भ्रूण और बाद में जीन की अभिव्यक्ति माइक्रोएरे विश्लेषण सहित विभिन्न प्रयोगात्मक प्रक्रियाओं में आवेदन के लिए सीडीएनए संश्लेषण से शाही सेना निकासी प्रदर्शित करता है.
Abstract
कई महत्वपूर्ण और जटिल प्रयोगशाला प्रक्रिया उच्च गुणवत्ता बरकरार शाही सेना के एक इनपुट की आवश्यकता है. एक अपमानित नमूना या अशुद्धियों की उपस्थिति बहाव प्रयोगात्मक अनुप्रयोगों में विनाशकारी परिणाम के लिए नेतृत्व कर सकते हैं. इसलिए यह अत्यंत महत्व के कई रक्षोपायों और गुणवत्ता नियंत्रण की जाँच के साथ ठोस तकनीक का उपयोग करने के लिए एक बेहतर नमूना सुनिश्चित है. इस के साथ साथ, हम विस्तार करने के लिए एक पूरे zebrafish भ्रूण से एक व्यावसायिक रूप से उपलब्ध रासायनिक denaturant और बाद में सफाई का उपयोग करने के लिए डीएनए और दोष एक वाणिज्यिक आरएनए अलगाव किट का उपयोग कर के निशान हटाने कुल शाही सेना को अलग प्रोटोकॉल. के रूप में शाही सेना अपेक्षाकृत अस्थिर है और आसानी से RNAses द्वारा दरार करने के लिए प्रवण है, सबसे प्रोटोकॉल परख जीन अभिव्यक्ति का उपयोग कर एक सीडीएनए उत्पाद है कि सीधे एक शाही सेना टेम्पलेट से संश्लेषित है. हम एक प्रक्रिया विस्तार आरएनए अधिक स्थिर सीडीएनए उत्पाद में एक व्यावसायिक रूप से उपलब्ध किट का उपयोग कर कन्वर्ट. इन प्रक्रियाओं के दौरान वहाँ कई गुणवत्ता नियंत्रण चेक करने के लिए सुनिश्चित करें कि नमूना अपमानित या दूषित नहीं है. इन प्रोटोकॉल के अंत उत्पाद सीडीएनए कि माइक्रोएरे विश्लेषण, RT-पीसीआर या लंबी अवधि के भंडारण के लिए उपयुक्त है.
Protocol
भाग 1: कुल शाही सेना के निष्कर्षण TRIzol अभिकर्मक का उपयोग जब शाही सेना के साथ काम कर रहे यह बहुत महत्वपूर्ण है के लिए एक वातावरण है कि RNAses से मुक्त है में काम. शाही सेना प्रक्रियाओं के साथ केवल उपयोग …
Discussion
शाही सेना अणु की कमजोरी सबसे महत्वपूर्ण विचार है कि इस प्रोटोकॉल भर में याद किया जाना चाहिए है. बाँझ उपकरण है कि RNase मुक्त है हमेशा प्रयोगशाला के एक RNase मुक्त क्षेत्र में किया जाना चाहिए. यह केवल शाही सेना ?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
Glycogen (5 mg/ml)
Ambion
9510
NanoDrop ND-100
Thermo Scientific
ND-1000
Pellet Pestles with Microfuge Tube
VWR
KT749520-0090
Phase Lock Gel Light, 1.5 ml
Eppendorf
2302800
Phenol, Tris-saturated
Roche Diagnostics
3117944001
RNAse Away
VWR
17810-491
RNAse-Free DNase Set
Qiagen
79254
RNEasy Mini Kit
Qiagen
74104
SuperScript® First-Strand Synthesis System for RT-PCR
Peterson, S. M., Freeman, J. L. RNA Isolation from Embryonic Zebrafish and cDNA Synthesis for Gene Expression Analysis. J. Vis. Exp. (30), e1470, doi:10.3791/1470 (2009).