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V3的HIV - 1取向的基因型推理使用人口为基础的测序

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Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

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V3的HIV - 1取向的基因型推理使用人口为基础的测序

DOI:

•

11:10 min

•

December 27, 2010

•

Rachel A. McGovern, P. Richard Harrigan, Luke C. Swenson

¹Laboratory Program,BC Centre for Excellence in HIV/AIDS

Chapters

00:05Title
01:25Amplification of HIV cDNA from Blood Plasma
03:37Gel Electrophoresis
04:29Sequencing
07:18Data Analysis with Base Calling Software
08:18The Geno2pheno Co-receptor Algorithm
09:37Interpreting the Geno2pheno FPR
10:37Conclusion

Summary

Automatic Translation

可以推断出艾滋病毒嗜性病毒包膜V3区。 V3是一式三份，采用巢式RT - PCR扩增，测序，PCR扩增，并解释使用生物信息学软件。被列为非R5病毒与G2P分数低1个或多个序列（S）的样品。

Tags

HIV-1 Tropism Genotypic Inference Population-based Sequencing V3 Region CCR5-antagonist Viral Population Coreceptor Tropism Testing Viral RNA Reverse Transcriptase-PCR Software Analysis RE Call Bioinformatic Algorithm Geno2pheno False Positive Rate

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