Glasullsprodukter Filter för att koncentrera Vattenburna Virus och lantbruksvetenskap zoonotiska patogener
Summary
Glasullsprodukter filter har använts för att koncentrera vattenburna virus genom ett antal forskargrupper runt om i världen. Här visar vi en enkel metod för att konstruera filter glasull och demonstrera filter också effektivt att koncentrera vattenburna virus, bakterie-och protozo patogener.
Abstract
Nyckeln första steget i utvärderingen patogener nivåer i misstänkt förorenat vatten är koncentration. Koncentration metoder tenderar att vara specifika för en viss patogen grupp, till exempel US Environmental Protection Agency Metod 1623 för Giardia och Cryptosporidium 1, vilket innebär att flera metoder krävs om provtagningen programmet riktar mer än en patogen grupp. En annan nackdel med nuvarande metoder är att utrustningen kan vara komplicerad och dyr, till exempel VIRADEL-metoden med den 1MDS patronfilter för koncentrering virus 2. I den här artikeln beskriver vi hur man konstruerar filter glasullsprodukter för att koncentrera vattenburna patogener. Efter filtret eluering är koncentratet mottaglig för en andra koncentration steg, såsom centrifugering, följt av detektion av patogener och räkning av kulturella eller molekylära metoder. Filtren har flera fördelar. Konstruktionen är lätt och filter kan byggas för att enNY storlek för att uppfylla specifika urvalskriterier. Filterdelarna är billiga, vilket gör det möjligt att samla ett stort antal prover utan att allvarligt påverka en projektbudget. Stora provvolymer (100s till 1.000 s L) kan koncentreras, beroende på graden av igensättning från prov grumlighet. Filtren är mycket portabel och med minimal utrustning, såsom en pump och flödesmätare, kan de genomföras i fältet för provtagning färdiga dricksvatten, ytvatten, grundvatten och jord avrinning. Slutligen är glasull filtrering effektiv för att koncentrera olika patogener typer så bara en metod är nödvändig. Här rapporterar vi om filter effektivitet i att koncentrera vattenburna mänskligt enterovirus, S almonella enterica, Cryptosporidium parvum, och aviär influensavirus.
Protocol
Discussion
Glasullsprodukter filter har använts av flera forskargrupper 3,5,6 att koncentrera personella enteriska virus från olika vattenkällor som druckit vatten 7, grundvatten 8,9, ytvatten 10, havsvatten 11, avloppsvatten 12 och jordbruket avrinning 13. Här rapporterar vi filtren är också effektivt att koncentrera aviär influensa samt bakterie-och protozo patogener Salmonella enterica (serovar Typhimurium) och Cryptosporidium parvu…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Vi tackar William T. Eckert för berätta videon. Utveckling av glasull protokollet var en del av Wisconsin vatten och hälsa Trial för enterisk risker (WAHTER Study), finansierat av US EPA STAR Grant R831630. Alaska togs av A. Reeves, A. Ramey och B. Meixell med ekonomiskt stöd från USGS. All användning av handel, produkt eller företag namn är beskrivande syfte och innebär inte godkännande av den amerikanska regeringen.
Materials
| Name of reagent or item | Company | Catalogue number |
| Hydrochloric acid | Fisher Scientific | A144-500 |
| Sodium hydroxide | Fisher Scientific | BP359-212 |
| Phosphate Buffered Saline Sodium chloride Potassium phosphate-dibasic Potassium phosphate-monobasic |
Fisher Scientific Fisher Scientific Fisher Scientific |
BP358-212 BP363-500 BP362-500 |
| Sodium hypochlorite i.e., household bleach | The Clorox Co. | |
| Sodium thiosulfate, anhydrous | Fisher Scientific | S 475-212 |
| Beef extract, desiccated | Becton, Dickinson and Company | 211520 |
| Glycine | Fisher Scientific | G46-500 |
| Oiled sodocalcic glass wool
Or R-11 unfaced fiberglass insulation |
Isover
Johns Manville |
Bourre 725 QN |
| Polypropylene mesh | Industrial Netting | xN4510 |
| 2″x4″ Sch 80 PVC threaded pipe nipple | Grainger | 6MW35 |
| 2″ Sch 40 PVC cap | Grainger | 5WDW3 |
| Male adapter nylon fitting (1/2″x1/2″) | US Plastic Corp. | 62178 |
| Sample bottles for eluate- 1 liter | Fisher Scientific | 03-313-4F |
| 60 mL syringe | Fisher Scientific | NC9661991 |
| pH strips | Whatman | 2614 991 |
| Prefilter, Polypropylene, 10 inch cartridge, 10 μm | McMaster-Carr | 4411K75 |
| Prefilter housing | Cole-Parmer | S-29820-10 |
References
- US Environmental Protection Agency. Method 1623: Cryptosporidium and Giardia in Water by Filtration/IMS/FA. EPA 815-R-05-002. , (2012).
- Cashdollar, J. L., Dahling, D. R. Evaluation of a method to re-use electropositive cartridge filters for concentrating viruses from tap and river water. J. Virol. Methods. 132, 13-17 (2006).
- Lambertini, E. Concentration of enteroviruses, adenoviruses, and noroviruses from drinking water by use of glass wool filters. Appl. Environ. Microbiol. 74, 2990-2996 (2008).
- Spackman, E. Development of a real-time reverse transcription PCR assay for Type A influenza virus and the avian H5 and H7 hemagglutinin subtypes. J. Clin. Microbiol. 40, 3256-3260 (2002).
- Environment Agency. Optimisation of a new method for detection of viruses in groundwater. Report No. NC/99/40. , (2000).
- Vilaginés, P., Sarrette, B., Husson, G., Vilaginés, R. Glass wool for virus concentration at ambient water pH level. Water Sci. Technol. 27, 299-306 (1993).
- Vivier, J. C., Ehlers, M. M., Grabow, W. O. Detection of enteroviruses in treated drinking water. Water Res. 38, 2699-2705 (2004).
- Powell, K. L., Sililo, O. . Enteric virus detection in groundwater using a glass wool trap. In: Groundwater: Past Achievements and Future Challenges. , 813-816 (2000).
- Hunt, R. J., Borchardt, M. A., Richards, K. D., Spencer, S. K. Assessment of sewer source contamination of drinking water wells using tracers and human enteric viruses. Environ. Sci. Technol. 44, 7956-7963 (2010).
- van Heerden, J., Ehlers, M. M., Heim, A., Grabow, W. O. Prevalence, quantification and typing of adenoviruses detected in river and treated drinking water in South Africa. J. Appl. Microbiol. 99, 234-242 (2005).
- Vilaginés, P. Round robin investigation of glass wool method for poliovirus recovery from drinking water and sea water. Water Sci. Technol. 35, 445-449 (1997).
- Gantzer, C., Senouci, S., Maul, A., Levi, Y., Schwartzbrod, L. Enterovirus genomes in wastewater: concentration on glass wool and glass powder and detection by RT-PCR. J. Virol. Methods. 65, 265-271 (1997).
- Borchardt, M. A., Jokela, W. E., Spencer, S. K. Pathogen losses in surface water runoff from dairy manure applied to corn fields. , (2011).
- Deboosere, N. Development and validation of a concentration method for the detection of influenza A viruses from large volumes of surface water. Appl. Environ. Microbiol. 77, 3802-3808 (2011).
- Lambertini, E. Virus contamination from operation and maintenance practices in small drinking water distribution systems. J. Water Health. 9, 799-812 (2011).
