En protokoll for nanopartikkel sporing analyse (NTA) og high-throughput flowcytometri å vurdere polymere genet levering nanopartikler er beskrevet. NTA utnyttes for å karakterisere nanopartikkel partikkelstørrelsesfordeling og plasmidet per partikkel fordeling. High-throughput flowcytometri gjør kvantitative transfeksjon effektevalueringen for et bibliotek av genet levering biomaterialer.
Ikke-virale genet levering hjelp polymere nanopartikler har dukket opp som en attraktiv metode for genterapi for å behandle genetiske sykdommer 1 og som en teknologi for regenerativ medisin 2. Motsetning til virus, som har betydelige sikkerhetsaspekter, kan polymere nanopartikler utformes for å være ikke-giftig, ikke-immunogene, ikke-mutagent, enklere å syntetisere, kjemisk allsidig, stand til å bære større nukleinsyre last og biologisk nedbrytbare og / eller miljømessig responsive. Kationiske polymerer selv montere med negativt ladet DNA via elektrostatisk interaksjon for å danne komplekser på størrelsesorden 100 nm som ofte benevnes polymere nanopartikler. Eksempler biomaterialer brukes til å danne nanoskala polykationiske genet levering nanopartikler omfatter polylysin, polyphosphoesters, poly (amidoamines) s og polyetylenimin (PEI), som er en ikke-nedbrytbar off-the-sokkel kationisk polymer som vanligvis brukes for nukleinsyre produksjonstid 1,3. Poly (beta-aminoester) s (PBAEs) er en nyere klasse av kationiske polymerer 4 som er hydrolytisk nedbrytbare 5,6 og har vist seg å være effektive på genet levering til vanskelig å transfektere celletyper som humane retinale endotelceller (HRECs) 7, mus mammary epitelceller 8, menneskelige hjerne kreftceller 9 og makrovaskulære (human umbilical vein, HUVECs) endotelceller 10.
En ny-protokollen for å karakterisere polymere nanopartikler utnytte nanopartikkel sporing analyse (NTA), er beskrevet. I denne tilnærmingen blir både partikkelstørrelsesfordelingen og fordelingen av antall plasmider per partikkel innhentet 11. I tillegg er en high-throughput 96-brønns plate transfeksjon analysen for rask screening av transfeksjon effekten av polymere nanopartikler presentert. I denne protokollen, er poly (beta-amino-ester) s (PBAEs) brukt som modell polymerer og humane retinal endotelceller (HRECs) brukes som model menneskeceller. Denne protokollen kan lett tilpasses for å evaluere eventuelle polymert nanopartikkel og enhver celletype av interesse i en multi-brønn plate-format.
Bestemmelsen av antall plasmider kompleksbundet per nanopartikkel er viktig å utforme effektive nanopartikkel-baserte genet levering strategier, spesielt for co-levering av flere plasmider til samme celle målet, som ofte er nødvendig i stamcelleforskningen omprogrammering studier 12. Noen tilnærminger for å beregne antall plasmider forbundet med en enkelt nanopartikkel er beskrevet, og hver tilnærming har ulemper i de teknikkene som brukes for estimering 13-16. Kvante prikk (QD) merking kombinert med TEM har blitt brukt til å beregne plasmider per partikkel i kitosan-baserte nanopartikler. Estimering med dette QD teknikken er komplisert på grunn av behovet for å merke DNA, som kan endre sin selv-montering egenskaper, muligheten for at innkapslet umerket DNA ikke er direkte detektert; potensielt overlappende plasmider og QDs i 2D TEM bilder av partikler, og andre forenklende forutsetninger 13. En alternativ tilnærming som er enpplicable når bestilt microdomains finnes i partiklene har blitt brukt til å studere Lipopolyamine-DNA komplekser via Cryo-transmisjonselektronmikroskopi (Cryo-TEM), X-ray spredning, og dynamisk lysspredning (DLS) 14,15. Dessverre, materialer som de polymere nanopartikler undersøkt her er ikke aktuelt med denne metoden. I en annen studie, brukte Collins et al en flyt partikkel bildeanalyse teknikk for å studere (Lys) 16-inneholdende peptid / DNA komplekser,. Kan imidlertid deres metode bare vurdere større, mikron-størrelse partikler 16. Således vi nylig utviklet en ny og fleksibel assay å kvantifisere antallet plasmider pr nanopartikkel 11.
Protokollene over beskriver metoder for å evaluere effekten av transfeksjon nanopartikkel formuleringer, så vel som en måte å karakterisere partikkelstørrelsen og DNA lasting av nanopartikler. Antallet plasmider per partikkel er en viktig parameter som kan bidra til å forutsi effektiviteten av partikkelen, og kan også brukes for dosebestemmelse. Nanopartikkel sporing analyse kan utføres i en rekke forskjellige vandige oppløsninger, slik som de forskjellige i saltkonsentrasjonen. Ofte denne karakteristikken er u…
The authors have nothing to disclose.
Forfatterne takke TEDCO MSCRF (2009-MSCRFE-0098-00) og NIH R21CA152473 for støtte.
Reagent | |||
Phosphate Buffered Saline, 1x (PBS) | Invitrogen | 10010 | |
EGM-2MV BulletKit | Lonza | CC-3202 | |
Trypsin | Invitrogen | 25300 | |
Sodium acetate buffer | Sigma-Aldrich | S7899 | Dilute to 25mM in deionized water |
Dimethyl sulfoxide | Sigma-Aldrich | 276855 | |
pEGFP DNA | Elim Biopharmaceuticals | NA | |
DsRed DNA | Addgene | 21718 | |
PEI, branched | Sigma-Aldrich | 408727 | |
CellTiter 96 AQueous One | Promega | G3580 | |
Materials | |||
Clear flat bottom 96-well plate, sterile | Sarstedt | 82.1581.001 | |
Clear round bottom 96-well plate, sterile | Sarstedt | 82.1582.001 | |
12-channel Finnpipette | Thermo Scientific | NA | 5-50 and 50-300 μl |
Fluorescence Microscope | Zeiss | NA | Model number: AX10 |
C6 Accuri flow cytometer | BD Biosciences | NA | |
HyperCyt attachment | Intellicyt | NA | |
NS500 | Nanosight | NA |