November 2012: Deze maand in Jove

Summary

In dit nummer, Oestreicher<em> Et al.</em> Tonen ons hoe magnetotactic bacteriën te isoleren van zoetwater monsters, en concentreren de bacteriën aan de ene kant van een glazen capillair. De magnetotactic bacteriën kunnen vervolgens worden gevisualiseerd door licht en transmissie elektronenmicroscopie en gebruikt voor diverse andere assays.

Abstract

In dit nummer, Oestreicher et al.. Laten ons zien hoe je magnetotactic bacteriën te isoleren van zoetwater monsters, en concentreren de bacteriën aan de ene kant van een glazen capillair. De magnetotactic bacteriën kunnen vervolgens worden gevisualiseerd door licht en transmissie elektronenmicroscopie en gebruikt voor diverse andere assays.

Ook in de november 2012 uitgave, Boland et al.. Demonstreren hoe fibroblasten te herprogrammeren in geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSCs), en hoe je IPSC regels te isoleren voor het injecteren in tetraploïde blastocysten, zoals eerder aangetoond in Jove . Terwijl de mond pipetteren is over het algemeen niet aan te raden, omdat het kan negatieve gevolgen hebben, dit protocol vereist de techniek, zorgvuldig uitgevoerd, te manipuleren de embryo's. Dit is een van de zeldzame gevallen waarin het eigenlijk op OK om de mond pipet in het lab. Indien de geïnduceerde cellen eenopnieuw volledig pluripotent, kunnen ze leiden tot voldragen muizen volledig afgeleid van iPSCs.

In Jove Neuroscience, Heermann en Krieglstein aantonen dat er een methode voor het visualiseren van Schwann cel ontwikkeling langs groeiende axonen. Om dit te doen, onze auteurs cultuur cervicale ganglia explantaten op collageen matrices, en de behandeling van de explantaten met zenuw groeifactor of andere stoffen. Het collageen gels kan dan worden gevisualiseerd met behulp van time-lapse imaging met fluorescentie of bright-field microscopie, migreren langs axonen naar de periferie.

Ook in Jove Neuroscience, Hoffmann et al.. Zet kleine koptelefoon op zangvogels te bestuderen hoe ze auditieve feedback te gebruiken om hun zang aan te passen. De auteurs laten zien hoe de hoofdtelefoon te bouwen en voeg ze toe aan het hoofd van de vogel, vandaar door het aanpassen van het akoestisch signaal, kunnen ze de computationele en neurofysiologische basis van vocale leren in vogels te bestuderen.

In Jove Klinische& Translational Medicine, Iyengar et al.. Gebruik maken van een zebravis tumor model om genen die de pathogenese van melanoom kan wijzigen studeren. Dit wordt gedaan door eerst transgene zebravis dat een gen van interesse tot expressie. Verschillende testen kunnen dan worden uitgevoerd om te onderzoeken hoe verschillende genen invloed hebben op melanoom, met inbegrip van aanvang, de invasie, en transplantability.

In Jove Bioengineering, Martin et al.. Tonen een glijdende assay om de buigstijfheid van biopolymeren (zoals microtubuli) te meten. Door het bevestigen van de motor-eiwitten op een objectglaasje, en het toevoegen van fluorescent gelabelde microtubuli, kunnen onze auteurs analyseren de dynamiek van het cytoskelet polymeren.

Dit voorbeeld vat slechts een paar opmerkelijke video-artikelen in de november 2012 uitgave van Jupiter. Stop bij de hele maand november te controleren of de volledige lengte versies van deze artikelen en nog veel meer.

Protocol

Generatie van Muizen Afgeleid van geïnduceerde pluripotente stamcellen Michael J. Boland 1, Jennifer L. Hazen 1, Kristopher L. Nazor 1, Alberto R. Rodriguez 2, Greg Martin 2, Sergey Kupriyanov 2, Kristin K. Baldwin 1 1 Dorris Neuroscience Center & Afdeling Celbiologie, het Scripps Research Institute, 2 Mouse Genetics Core Facility, het Scripps Research Institute Het genereren van geïnduceerde pluripotente stamcellen (IPSC) lijnen produceert lijnen van verschillende ontwikkelingspotentieel, zelfs als ze passeren standaard tests voor pluripotentie. Hier beschrijven we een protocol muizen volledig zijn verkregen uit iPSCs die de iPSC lijnen bezitten full pluripotentie 1 worden geproduceerd. Het analyseren van MurineSchwann cel ontwikkeling Samen Groeien Axonen Stephan Heermann 1, 2, Kerstin Krieglstein 1, 3 1 Afdeling Moleculaire Embryologie, Instituut voor Anatomie en Celbiologie, Universiteit van Freiburg, 2 Department of Neuroanatomie, Universiteit van Heidelberg, 3 FRIAS, Universiteit van Freiburg Hier beschrijven we een Schwann-cellen (SC) migratie assay waarin SC kunnen ontwikkelen langs axonen verlenging. Een lichtgewicht, hoofdtelefoon-gebaseerd systeem voor het manipuleren van auditieve feedback in Zangvogels Lukas A. Hoffmann 1, 2, Conor W. Kelly 1, 3, David A. Nicholson 1, 2, Samuel J. Sober 1 1 Departement Biologie, Emory University, 2 Neuroscience Graduate Program, Emory University, 3 Program in Neuroscience en Gedragsbiologie, Emory University We beschrijven het ontwerp en de assemblage van geminiaturiseerde hoofdtelefoons die geschikt zijn voor het vervangen van natuurlijke auditieve een zangvogel van de feedback met een gemanipuleerde akoestisch signaal. Online geluidsverwerking hardware wordt gebruikt om song-uitgang te manipuleren, real-time fouten in auditieve feedback te introduceren via de hoofdtelefoon, en vocale motorisch leren rijden. Screening op Melanoom Modifiers het gebruik van een zebravis Autochtone tumormodel Sharanya Iyengar 1, Yariv Houvras 2, 3, Craig J. Ceol 1 1 Programma in Molecular Medicine en het ministerie van kanker Biologie, Universiteit van Massachusetts Medical School, 2 afdelingen Chirurgie en Geneeskunde, Weill Cornell Medical College, 3 afdelingen Chirurgie en Geneeskunde, New York Presbyterian Hospital <p class = "jove_content"> Een snelle manier om te screenen op melanoom modifiers met behulp van een zebravis autochtone tumor model gepresenteerd. Het maakt gebruik van de miniCoopR vector waarmee expressie van genen kandidaat melanoom in melanocyten. Een methode om melanoom-vrije overleving bochten, een invasie assay, een protocol voor antilichaam kleuring van schaal melanocyten en een melanoom transplantatie assay te verkrijgen zijn beschreven. Buigstijfheid Metingen van Biopolymeren gebruik Zweefvliegen Assays Douglas S. Martin, Lu Yu, Brian L. Van Hoozen Departement Natuurkunde, Universiteit van Lawrence Een methode om de persistentielengte of buigstijfheid van biopolymeren meten beschreven. De methode gebruikt een kinesine aangedreven microtubule gliding assay experimenteel bepalen de persistentielengte van individuele microtubuli en is aanpasbaar aan actine gebaseerde assays glijden. < / P> Collection, Isolatie en Verrijking van natuurlijk voorkomende Magnetotactic Bacteriën van het milieu Zachery Oestreicher 1, Steven K. Lower 1, 2, Wei Lin 3, Brian H. Lower 2 1 School of Earth Sciences, de Ohio State University, 2 School van Milieu en Natuurlijke Hulpbronnen, de Ohio State University, 3 Instituut voor Geologie en Geofysica, de Chinese Academie van Wetenschappen We tonen een methode magnetotactic bacteriën (MTB) die kunnen worden toegepast in natuurlijke wateren verzamelen. MTB kunnen worden geïsoleerd en verrijkt door sediment monsters met behulp van een relatief eenvoudige installatie die gebruik maakt van de bacteriën de natuurlijke magnetisme. Geïsoleerde MTB kunnen dan worden in detail onderzocht met behulp van zowel licht-en elektronenmicroscopie. 8 "> Transnuclear Muizen met vooraf gedefinieerde T cel receptor specificiteiten tegen Toxoplasma gondii verkregen via SCNT Oktay Kirak 1, Eva-Maria Frickel 1, Gijsbert M. Grotenbreg 1, 2, Heikyung Suh 1, Rudolf Jaenisch 1, 3, Hidde L. Ploegh 1, 3 1, Whitehead Institute for Biomedical Research, 2 afdelingen Microbiologie en Biologische Wetenschappen, Nationale Universiteit van Singapore, 3 Departement Biologie, Massachusetts Institute of Technology We tonen hier dat epigenetische herprogrammering via somatische celkernen (SCNT) kan worden gebruikt als een instrument om muismodellen te genereren met vooraf gedefinieerde T cel receptor (TCR) specifieke kenmerken. Deze transnuclear muizen brengen de overeenkomstige TCR uit hun endogene locus onder controle van de endogene promotor.