Summary
Quadridimensionale (4D) di imaging viene utilizzato per studiare il comportamento e le interazioni tra i due tipi di endosomi a vivere terminazioni nervose vertebrati. Movimento di queste piccole strutture è caratterizzata in tre dimensioni, permettendo conferma di eventi come endosomi fusione ed esocitosi.
Abstract
Quadridimensionale (4D) immagini poco è stato utilizzato per studiare il comportamento di piccole strutture nel raggio di terminali dei nervi motori del sottile trasverso dell'addome muscolo del serpente giarrettiera. I dati grezzi comprende sequenze time-lapse di 3D z-stack. Ogni stack contiene 4-20 immagini acquisite con ottica epifluorescenza a piani focali separati da 400-1,500 nm. Passi nella acquisizione di pile di immagini, quali la regolazione della messa a fuoco, la commutazione di lunghezze d'onda di eccitazione, e il funzionamento della fotocamera digitale, sono automatizzate per quanto possibile per massimizzare la velocità di immagine e minimizzare danni ai tessuti da esposizione alla luce. Dopo l'acquisizione, una serie di pile di immagini è deconvolved per migliorare la risoluzione spaziale, convertito nel formato 3D desiderato, e utilizzato per creare un "film" 4D che è adatto per diverse analisi basati su computer, a seconda dei dati sperimentali richiesti. Una applicazione è lo studio del comportamento dinamico di due classi di endosomi trovati in terminali nervosi-macroendosomes (MES)e endosomi acidi (AES)-le cui dimensioni (200-800 nm per entrambi i tipi) sono in prossimità o al limite di diffrazione. L'accesso alle informazioni 3D in ogni tempo offre diversi vantaggi rispetto ai tradizionali time-lapse imaging. In particolare, le dimensioni e la velocità di movimento delle strutture possono essere quantificati nel tempo senza perdita di fuoco. Esempi di dati di immagini 4D rivelano che ME avvicinano alla membrana plasmatica e scompaiono, suggerendo che essi sono exocytosed piuttosto che semplicemente spostando verticalmente distanti un unico piano di messa a fuoco. Ha anche rivelato è la fusione putativo di ME e AES, attraverso la visualizzazione di sovrapposizione tra i due strutture colorante contenente come visto in ogni tre proiezioni ortogonali.
Introduction
Time-lapse imaging di tessuto vivente fornisce l'accesso visivo dinamici relazioni struttura-funzione che non può essere apprezzato in preparazioni fissi o che vivono impressi in un unico punto nel tempo. Spesso, tuttavia, il compromesso per l'accesso alle informazioni temporali è una diminuzione della risoluzione ottica. Obiettivi ad immersione in olio ad alta apertura numerica sono impraticabili nel tessuto vivo a causa della loro ristretta gamma di messa a fuoco, lasciando immersione in acqua o obiettivi a secco come le uniche alternative. Inoltre, la maggiore risoluzione ottenibile con ottica confocale non può essere utilizzato in alcune preparazioni vivere a causa della fototossicità dai livelli relativamente alti di illuminazione richiesti 1,2. Infine, mentre diverse real-time o time-lapse tecniche ottiche sono disponibili che offrono una maggiore risoluzione, la loro applicabilità è limitata a preparazioni in cui le strutture di interesse possono essere posizionati a poche centinaia di nanometri dell'obiettivo 1. Il metodo descritto, a strumenti relativamente a basso costo, è versatile, ma offre una migliore risoluzione rispetto alle tecniche time lapse più comunemente usati. Esso è destinato all'uso nei laboratori individuali nonché strutture di imaging.
Il metodo utilizza epifluorescenza convenzionale, combinato con una fotocamera digitale sensibile e con hardware progettato per acquisire rapidamente gruppi di immagini a leggermente differenti piani focali (Z-stack). Ogni z-stack è digitalmente deconvolved per aumentare la risoluzione. Una caratteristica del 3D time-lapse (4D) imaging è tracciamento preciso di organelli o altre strutture in movimento. Se correttamente impostato, strutture impressi non vanno fuori fuoco, e il movimento in tutte e tre le direzioni possono essere osservati e quantificati. Così è impossibile per una struttura macchiato eliminata nell'arco di uno o più frame time lapse semplicemente alla deriva sopra o al di sotto di un piano focale stretta. Il metodo serve anche come strumento sensibile per valutare le interazioni e possibile fusione di piccole strutture. Epifluorescenza convenzionale o immagini confocali di strutture in prossimità del limite di diffrazione (a poche centinaia di nm) non confermano la fusione anche se le immagini mostrano unite sovrapposizione delle rispettive etichette 3. Fusion è suggerito, ma rimane la possibilità che gli oggetti sono separati orizzontalmente o verticalmente da una distanza che è inferiore al limite di diffrazione. Tre o immagini quadridimensionale, al contrario, consente la visualizzazione degli oggetti in ciascuna delle tre direzioni ortogonali. L'aspetto della fusione in tutte e tre le viste aumenta il livello di certezza. E, in alcune preparazioni viventi, diretto o moto browniano di oggetti ipoteticamente fuse fornisce un'ulteriore prova quando entrambi i marchi si muovono insieme nel tempo. Naturalmente, quando in prossimità del limite di diffrazione il livello di certezza in strutture esigenti da sfondo, o mostrando che esse contengono due coloranti (fusione), non è assoluto. Se, tecniche specializzate, ad esempio la risonanza di fluorescenza trasferimento di energia (FRET)4, sono più appropriato.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. Colorare la preparazione con sopravitale Coloranti
- Per il protocollo dissezione serpente giarrettiera vedere Stewart et al. 5 e Teng et al. 6 tessuto Reptilian resta fisiologica per tempi più lunghi, e con meno contaminazione batterica, conservato a basse temperature (vedi sotto). Tessuti di mammiferi, di solito è mantenuta a temperatura ambiente o superiore.
- Per lisosomiale colorante vitale colorazione, sciogliere il colorante in rettili freddi 1:5.000 soluzione Ringers (0,2 micron). Incubare a 4 ° C per 15 min. Lavare più volte con Ringers freddi. Immagine appena possibile.
- Per FM1-43 colorazione utilizzando la stimolazione KCl, diluire il colorante in alto KCl Ringers 1:500 (7 micron). Incubare a 4 ° C per 30-60 sec massimo. Lavare rapidamente tre volte con Ringers fredde, ~ 1 min / risciacquo. Immagine appena possibile.
- Per FM1-43 colorazione utilizzando la stimolazione ipertonica (saccarosio), diluire il colorante in 0,5 M Ringers saccarosio come sopra. Incubare a 4 & #176, C per 2-5 min. Lavare come al punto 1.3 con Ringers freddi. Immagine appena possibile.
- Per FM1-43 colorazione tramite stimolazione elettrica, vedere Teng et al. 6 Brevemente, la preparazione è posto un recipiente contenente soluzione salina fisiologica e il colorante. Il nervo viene stimolato con un treno programmato di 200 msec impulsi rettangolari (~ 7 V, 30 Hz, 18 msec). Lavare come al punto 1.3 con Ringers freddi. Immagine appena possibile.
2. Configurare la preparazione di Imaging
- Orientare la preparazione in modo che le strutture di interesse siano il più vicino possibile all'obiettivo microscopio.
- Se viene utilizzato un microscopio invertito, utilizzare una camera il cui fondo contiene un sottile giro copertura di slittamento. Tipicamente, la camera di imaging dovrebbe avere un fondo sottile in acciaio inossidabile con un diametro # 1 vetro spessore copertura antiscivolo 25 mm a centro. Se viene utilizzato un microscopio verticale, un coprioggetto inferiore non è necessaria ma è utileper consentire di imaging con luce trasmessa (ad esempio il contrasto di interferenza differenziale, DIC) per orientare il campione e localizzare oggetti di interesse.
- Scegliere un obiettivo appropriato per ottenere la massima risoluzione 3D possibile. Ci sono dei compromessi tra apertura numerica (na), distanza di funzionamento, l'ingrandimento e il tipo di lente (a secco, ad immersione in olio-acqua). Per i preparati sottili come colture di tessuti, gli obiettivi del petrolio sono i migliori. Utilizzando un microscopio verticale, mobile un vetrino sul bagno acquoso, e utilizzare olio per immersione tra la parte superiore del vetrino e l'obiettivo.
- Se si utilizza il software di deconvoluzione, il venditore potrebbe fornire funzioni di punto di spread predeterminati (PSF) per determinati obiettivi. Se tale informazione è fornita, o se si sceglie un obiettivo non supportato determinare il PSF da imaging di micropunti fluorescenti o oggetti di diffrazione limitata analoghi 7,8.
3. Stabilire la profondità di campo desiderata e numero di Images desiderati per Time-lapse con cornice
- Selezionare la profondità totale del campo in modo che lo spostamento o interagendo strutture di interesse non scompaiono o andare fuori fuoco, come si muovono nella direzione z. La z-campo dovrebbe superare leggermente la dimensione verticale del processo cellulare o la cellula viene esposta. Per i terminali del motore vertebrati, 15-20 micron è tipico.
- Calcolare il passo asse z necessaria per ogni incremento di messa a fuoco. Risoluzione lungo l'asse z varia a seconda proprietà del obiettivo; è circa un quarto della risoluzione piano xy. Se viene utilizzato sia confocale o software di deconvoluzione, risoluzione z è migliorata. Migliorare la risoluzione finale oversampling deliberata nella direzione z 5, ma si veda anche passo 3.3. Un intervallo tipico passo è nell'intervallo da 400-1,500 nm per obiettivi 40-100X. Luce dovrebbe essere coperto off tra ogni immagine z-step.
- Selezionare il numero di immagini per z-stack, cioè la profondità di campo desiderata divisodall'intervallo passo. Tempo per completare una tipica z-stack è 1-10 sec. Oggetti in rapido movimento (100 nm / sec) possono apparire sfocata in una pila di immagini 3D perché ogni piano dell'immagine corrisponde ad un punto temporale leggermente diverso. Inoltre, ogni immagine aggiuntiva contribuisce al photobleaching e fototossicità possibile (vedi discussione). Se una situazione riguarda, sceglierebbe una più grande z-passo per raccogliere un minor numero di immagini per stack. Compensare successivamente utilizzando il software di interpolazione dell'immagine (fase 6.3).
4. Selezionare il Frame Rate Time-lapse
Scegli sperimentazione un tasso che è appena sufficiente per risolvere agevolmente cambia con il tempo come il movimento, interazioni o eventi di fusione 9. Sotto il campionamento può produrre artefatti da movimento (errori di campionamento), mentre sovracampionamento aumenta inutilmente l'esposizione alla luce. Raccogliere una singola sequenza lunga o più sequenze ripetute della stessa preparazione, ciascuno con un intervallo relativamente piccolo tempo totale ( 5. Completa tutte le immagini dal vivo per una preparazione particolare Preparazioni Rettiliani in genere rimangono robusto per ~ 1-2 ore, più a lungo se raffreddato. 6. Analizzare i dati in base all'uso desiderato
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
I dati riportati sono da terminali serpente neuromuscolari (vedi visite basse e alte ingrandimento nella figura 3, il colorante endocitica (FM1-43) assorbimento crea una nebbia che riempie ogni bouton) e, in particolare, macroendosomes (MES) e endosomi acidi (AES) all'interno di questi terminali 5. ME sono creati da endocitosi massa durante l'attività neuronale 10 e il loro numero declina esponenzialmente con il tempo dopo l'attività è cessata 6. L'uso di 4D imaging dal vivo era di determinare se ME muovono verso la membrana plasmatica e scomparire rapidamente, suggerendo che il loro numero diminuisce perché alcuni di loro esocitosi. Tutti questi ME erano presenti a un certo punto volta (e quelli prima) e completamente andati al successivo punto di tempo (e di quelli dopo). Così il tempo richiesto per la scomparsa era inferiore al nostro intervallo telaio (più corto 30 sec) e coerente con esocitosi. Una teoria alternativa, non avvalorati da dati 4D, è che ME lentamente dissipare tramite gemmazione di vesicles fino a che non svaniscono. Erba vescicola si verifica 6, ma almeno qualche ME sono exocytosed durante o dopo erba 5. Figura 1 e Movie S1 illustrano la scomparsa di un ME tra due fotogrammi time-lapse. ME destinati a svanire non cambiano forma o la luminosità su due o più fotogrammi (N = 16), che sarebbe stato coerente con la lenta dissipazione durante il periodo del film (che inizia diversi minuti dopo la stimolazione breve). ME scomparsa è stata osservata in precedenza in convenzionale time-lapse, ma era possibile che le strutture hanno semplicemente lasciato il piano di messa a fuoco. Inoltre, la visualizzazione da una varietà di prospettive (Movie S1) ha confermato che la scomparsa ME è stata improvvisa. Con convenzionale l'imaging dal vivo (guardando da un unico punto di vista, ad esempio, il piano immagine xy) la presenza di rumori limitano la capacità del ricercatore di confermare che una struttura è rimasta invariata. Tali manufatti sono spesso presentiin una vista, ma non altri.
Studi di microscopia elettronica hanno dimostrato che gli endosomi a morsetti del motore sono di piccole dimensioni, in prossimità del limite di diffrazione della luce 10. Quindi fusione di questi endosomi non può essere distinto assolutamente da stretta associazione territoriale a livello di luce. ME sono stati etichettati con FM1-43 (verde fluorescente) e AES con un colorante vitale lisosomiale (rosso fluorescente). Strutture che fluoresced in entrambi i colori (che appare giallo) sono state occasionalmente notato in 4D record di immagine. Utilizzando il software appropriato, viste queste endosomi doppio etichettati e quindi apparentemente fusi da una varietà di prospettiva sono stati generati per esaminare la coincidenza delle due etichette in voxel vicino e all'interno della struttura apparente. Figura 2 mostra un putativo fuso AE-ME come visto da tre direzioni ortogonali. Un punto di vista è il piano xy; le altre viste sono ortogonali a tale piano e tra di loro. Usando questo metodo si è constatato che voxelo sovrapposti, come in questo esempio, o che evidentemente non in uno o più piani di visualizzazione. Film S2 mostra lo stesso putativo fuso AE-ME presentato come un display di realtà virtuale interattivo (completamente ruotabile in 3 dimensioni).
Deconvoluzione digitale è uno strumento utile per migliorare la risoluzione di 3D e 4D immagini, sia convenzionali e microscopi confocali 11. Deconvoluzione numerica è un processo iterativo che compensa, in parte, per risoluzione spaziale limitata dell'obiettivo utilizzato. Questa risoluzione è caratterizzato come punto spread funzione del volume del obiettivo 3D occupata dall'immagine di un punto infinitesimale. In teoria, deconvoluzione ripristina l'immagine che deriverebbe se l'obiettivo fosse perfetto. Figura 3 è una vista volume 3D di due diverse serie di dati, ciascuna visualizzati come una coppia di anaglifi rosso-verde. Le immagini a destra mostrano tipica miglioramento della nitidezza dopo de digitaleconvoluzione della pila di immagini.
Figura 1. A macroendosome (ME) scompare dopo contatto apparente con la membrana plasmatica. Un serpente preparazione nervo-muscolo è stato stimolato elettricamente in presenza di FM1-43. I dati sono stati raccolti usando l'imaging 4D, come descritto in Metodi e vengono visualizzati come "viste volume 3D" in sei punti (60 intervallo sec) per illustrare la Z-profondità di un singolo bouton. Un ME possono essere osservati allontanandosi dalla Y (linea rossa tratteggiata) su più fotogrammi, prima di scomparire tra i punti di tempo 5 e 6. Poco prima scomparsa, ME sembra essere situato membrana plasmatica del bouton (delineato da FM1-43 vescicola colorazione o "foschia"; vedi Figura 3 leggenda). La ME non ricomparve insuccessivi punti temporali (dati non mostrati; vedere film S1). Barra della scala, 2 micron. Cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.
MOVIE S1:. Vista 4D time-lapse di ME scomparsa Clicca qui per vedere film. lo stesso insieme di dati grezzi visualizzato in figura 1 è indicata come una "vista del volume 4D" con un ingrandimento minore. La sequenza di time-lapse originale comprende 8 punti temporali, separati da 60 sec; riproduzione è a 4 fotogrammi / sec. La sequenza è breve pausa all'inizio di ciascuno dei 24 3D rotazione passi circa l'asse y (15 gradi / step) per attirare l'attenzione sul procinto di scomparire ME (freccia rossa). Si noti che la ME è visibile, si avvicina al bordo del bouton (membrana plasmatica), scompare, e non restituisce, intutte le prospettive di visualizzazione. A causa della bassa risoluzione asse z rispetto alla risoluzione xy, la forma della ME sembra allungare e accorciare seconda visione prospettica. Le immagini sono state esportate come filmato QuickTime, e annotati utilizzando QuickTime Pro. Barra della scala, 2 micron.
Figura 2. Vista ortogonale di un endosomi fuso putativo. Una preparazione muscolare nervo è stato sequenzialmente tinto con un colorante vitale lisosomiale (rosso) per etichettare AES e FM1-43 (verde) per etichettare ME con 0,5 M di stimolazione saccarosio come descritto nei metodi. I dati da un punto di tempo di un film 4D vengono visualizzati come viste di volume 3D in tre orientamenti. Al top (pannelli 1-3) è il punto di vista convenzionale dall'alto (piano xy). A medio (pannelli 4-6) è una vista perpendicolare al piano xy enella (arbitraria) direzione della grande freccia rossa. In fondo (pannelli 7-9) è una vista reciprocamente perpendicolare entrambe le viste sopra, in direzione della freccia grande blu. Un ME (verde) è contrassegnato da una freccia verde; due eventi avversi (rosso) sono contrassegnati da frecce rosse. Un endosomi contenenti entrambi i coloranti (giallo) è contrassegnato da una freccia gialla in pannelli di 3, 6 e 9. Notare che la sovrapposizione di rosso e verde è altrettanto completo in tutte e tre le proiezioni ortogonali. Barra della scala, 2 micron. Cliccare qui per vedere una versione più grande di questa figura.
MOVIE S2:. Rotazione Interactive di un'immagine contenente ME e endosomi acidi EA . Clicca qui per vedere film Il set di dati di figura 2 è mostrata configurato come completamente ruotabile immagini 3D (QuickTime virtuale Reality formato; utilizzare il mouse per ruotare l'immagine per la visualizzazione da qualsiasi direzione). I putativo ME fusi / AE rimane gialla da tutte le prospettive.
Figura 3. Deconvoluzione migliora la risoluzione spaziale 3D. Due terminali tipici serpente nervose, mostrato a bassa (in alto) e alto (basso) di ingrandimento rispettivamente e macchiato durante la stimolazione con FM1-43. FM1-43 di fondo "foschia", a causa di etichettatura delle singole vescicole 50 nm, mostra la forma di boutons terminali, ai quali ME sono confinati. I dati vengono visualizzati come anaglifi rosso-verde di vista del volume 3D (profondità può essere visualizzato con vetri rosso-verde o rosso-blu, rosso occhio sinistro; nota assoni in alto a sinistra scende nel piano del terminale da sopra). Pannelli a sinistra: dati grezzi; Pannelli di destra: i dati dopodeconvoluzione. Si noti il significativo miglioramento nella risoluzione di ME. Pannelli di testa: la stimolazione elettrica; intero terminale mostrato (~ 30 x 50 micron) (stessi dati grezzi come in figura 1 e Movie S1, barra della scala, 10 micron). Pannelli di fondo: stimolazione KCl; ingrandita per mostrare quattro boutons individuali (~ 3 x 5 micron; bar scala, 2 micron). cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
L'aspetto più critico dell'imaging 4D è la gestione della durata e intensità di esposizione alla luce. Fotoscolorimento diminuisce immagine rapporto segnale-rumore e può essere problematico o meno a seconda di vari fattori, tra cui la scelta di fluorofori. Danni aspecifica di tessuto vivente (fototossicità) è legato alla photobleaching, e talvolta può essere identificato utilizzando sonde fluorescenti progettati per lo scopo 2,12 o di un esame della morfologia con opportune ottiche chiaro, come il contrasto di interferenza differenziale (DIC).
È possibile, tuttavia, per indurre un effetto fisiologico che si verifica a livelli luminosi ben al di sotto della grandezza di quelli associati con photobleaching e fototossicità. Ad esempio, nei primi esperimenti utilizzando più preparati, ciascuno fissato ad un momento diverso dopo stimolazione, il tasso al quale ME scomparse con il tempo dopo una stimolazione breve è stato misurato 6. Come è prassi normale to minimizzare dissolvenza, i preparativi sono stati tenuti all'oscuro fino a quando non sono state visualizzate. Quando esperimenti simili sono stati eseguiti utilizzando 4D imaging dal vivo, molti altri ME rimasti per tutto l'esperimento (~ 20-60 min) e non scompaiono. Uso dello stesso protocollo di imaging in tempo reale, tranne non effettivamente la registrazione e limitando l'esposizione alla luce per un singolo fotogramma 3D all'inizio e un singolo fotogramma alla fine quindi, ripristinato il tasso complessivo atteso di endosomi scomparsa a quello dei preparati fissi.
Ulteriore risoluzione dei problemi indicava che il tasso di scomparsa fu in parte, inversamente e monotonicamente correlata all'esposizione alla luce totale durante un esperimento. Dopo tentativi infruttuosi di ridurre l'esposizione attraverso l'ottica confocale convenzionali e multiphoton, il problema è stato finalmente risolto con l'acquisto di una fotocamera più sensibile ~ 3x (Tabella 1). Si raccomanda confronti analoghi essere effettuate se possibile, in funzione dell'applicazione dell'utente. Se alcuni process o transizione è documentata nel tempo, confermare che non vi è alcuna modifica attribuibile a intensità o la durata totale di illuminazione. Fototossicità e photobleaching sono specifici-dye. Ad esempio, abbiamo visto alcuna significativa dissolvenza 4D dopo ripetute di un terminale (350 singole esposizioni di luce oltre 30 min) con FM1-43. Lo stesso protocollo di imaging utilizzando un colorante simile, SGC5 (Tabella 1), tuttavia, ha portato in alcuni sbiadimento e, presumibilmente, fototossicità e (dati non mostrati).
Con l'eccezione di miglioramenti forniti dalla deconvoluzione digitale (ottica e confocale, se usati; non mostrati), il metodo diretto descritto fornisce alcuna soluzione "super". Tuttavia, il metodo ha il vantaggio di migliorare la risoluzione pratica o intuitivo durante la visualizzazione di strutture viventi, in particolare quelli in movimento, la cui dimensione è pari o leggermente superiore al limite di diffrazione. La possibilità di visualizzare gli oggetti da varie prospettive, includipresentazione ng in ciascuno dei tre piani ortogonali, guida il ricercatore se una struttura esiste effettivamente sopra del livello del rumore e se è etichettato da uno o più fluorofori. Ad esempio, in esperimenti volti a quantificare il numero e la dimensione di MI e AES, è stato possibile confermare che la struttura era visibile da vari punti di vista e che ogni dimensione (e quindi il suo volume tridimensionale) è stata nel range tipico per tale struttura. La posizione di una struttura è anche meglio definito, ad esempio, all'interno di un assone, terminale nervoso etc. piuttosto che al di sopra o al di sotto di esso. Al contrario, quando il campo di vista era limitata a una singola piano dell'immagine 2D o ad un singolo proiezione di dati 3D, strutture putativi spesso rivelati "rumore". Analogamente, strutture doppie marcato putativi spesso rivelati due strutture che apparivano coincidente da una prospettiva di visione (o due) ma non da tutti. Visualizzazione da tre direzione ortogonalezioni fornisce uno standard e un criterio di routine per valutare le caratteristiche di esistenza, di dimensioni e di etichettatura degli endosomi o strutture similari per l'uso in analisi quantitative e statistiche.
La metodologia descritta è pratico in quanto può essere utilizzato un video microscopio convenzionale del tipo che si trova in molti laboratori. La strumentazione è versatile e non specializzato, e relativamente poco costoso. Mentre il software specifico di un particolare microscopio è stato utilizzato qui, il software open-source sia per l'acquisizione delle immagini e l'elaborazione dei dati in grado di produrre risultati simili 13. Tecniche (compresi deconvoluzione) sono applicabili all'imaging singolo e multiphoton confocale con vantaggi simili, purché l'esposizione alla luce è tollerato dalla preparazione vivente utilizzato. In futuro, miglioramenti del design rafforzerà ulteriormente l'imaging dal vivo utilità 4D. Questi includono, in primo luogo, l'hardware che migliora la velocità di messa a fuoco e filtro di eccitazione / emissione changing, e la disponibilità di ancora più sensibile videocamere.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Gli autori dichiarano interessi finanziari concorrenti.
Acknowledgments
Questo lavoro è stato sostenuto dal National Institutes of Health di Grant NS-024572 (da RSW).
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Equipment | |||
| SGC5 | Biotium, Hayward, CA | 70057 | Final conc: 10 mM |
| FM1-43FX | Invitrogen, Carlsbad, CA | F35335 | Final conc: 7 mM |
| LysoTracker Red | Invitrogen, Carlsbad, CA | L7528 | Final conc: 0.2 mM |
| Reptilian Ringers pH 7.2 | |||
| NaCl | 145 mM | ||
| KCl | 2.5 mM | ||
| CaCl2 | 3.6 mM | ||
| MgSO4 | 1.8 mM | ||
| KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
| HEPES | 5.0 mM | ||
| High KCl Reptilian Ringers pH 7.2 | |||
| NaCl | 86 mM | ||
| KCl | 60 mM | ||
| CaCl2 | 3.6 mM | ||
| MgSO4 | 1.8 mM | ||
| KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
| HEPES | 5.0 mM | ||
| High Sucrose Ringers pH 7.2 | |||
| NaCl | 145 mM | ||
| KCl | 2.5 mM | ||
| CaCl2 | 3.6 mM | ||
| MgSO4 | 1.8 mM | ||
| KH2PO4 (Dibasic) | 1.0 mM | ||
| HEPES | 5.0 mM | ||
| Sucrose | 0.5 M (17.1 g/50 ml) | ||
| Axioplan 200 inverted microscope | Carl Zeiss, Thornwood, NY | www.zeiss.com | |
| N-Achroplan 63X water objective; n.a.=0.9; Working distance=2.4 mm | Carl Zeiss, Thornwood, NY | www.zeiss.com | |
| DG4 combination light source/excitation filterwheel switcher | Sutter Instruments, Novato, CA | 175W Xenon arc lamp | www.sutter.com |
| Lambda 10-2 emission filterwheel switcher | Sutter Instruments, Novato, CA | www.sutter.com | |
| Sensicam CCD camera | Cooke Instruments, Tonawanda, NY | www.cookecorp.com | |
| Cascade 512 CCD camera | Photometrics, Tucson, AZ | www.photometrics.com | |
| Imaging dishes- made in-house-11 cm dia.; 25 mm dia. #1 coverslip embedded; magnetic pins | |||
| Software | |||
| Slidebook 5.0 | Intelligent Imaging Innovations, Denver, CO | Deconvolution; Drift correction;3D and 4D data presentation | www.intelligent-imaging.com |
| IMARIS 7.5.2 | Bitplane, South Windsor, CT | Drift correction; 3D and 4D data presentation | www.bitplane.com |
| AfterEffects CS6 | Adobe, San Jose, CA | Drift correction | www.adobe.com |
| ImageJ 1.46 | National Institutes of Health, Bethesda, MD | Multiple plugins available; Stereo pair construction | http://rsbweb.nih.gov/ij |
| Zeiss LSM | Carl Zeiss, Thornwood, NY | Stereo pair construction | www.zeiss.com |
References
- Frigault, M. M., Lacoste, J., Swift, J. L., Brown, C. M.
- Tinevez, J. -Y., et al. A quantitative method for measuring phototoxicity of a live cell imaging microscope. Meth. Enzymol. 506, 291-309 (2012).
- Dunn, K. W., Kamocka, M. M., McDonald, J. H. A practical guide to evaluating colocalization in biological microscopy. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 300, (2011).
- Snapp, E. L., Hegde, R. S. Rational design and evaluation of FRETexperiments to measure proteinproximities in cells. Curr. Protoc. Cell Biol. 17, (2006).
- Stewart, R. S., Teng, H., Wilkinson, R. S. Late" macroendosomes and acidic endosomes in vertebrate motor nerve terminals. J. Comp. Neurol. 520, 4275-4293 (2012).
- Teng, H., Lin, M. Y., Wilkinson, R. S. Macroendocytosis and endosome processing in snake motor boutons. J. Physiol. 582, 243-262 (2007).
- McNally, J. G., Karpova, T., Cooper, J., Conchello, J. A. Three-dimensional imaging by deconvolution microscopy. Methods. 19, 373-385 (1999).
- Swedlow, J. R., Platani, M. Live cell imaging using wide-field microscopy and deconvolution. Cell Struct. Funct. 27, 335-341 (2002).
- Cromey, D. W. Digital images are data: and should be treated as such. Methods Mol. Biol. Taatjes, D. J., Roth, J. 931, 1-27 (2013).
- Teng, H., Wilkinson, R. S. Clathrin-mediated endocytosis near active zones in snake motor terminals. J. Neurosci. 20 (21), 7986-7993 (2000).
- Teng, H., Cole, J. C., Roberts, R. L., Wilkinson, R. S. Endocytic active zones: hot spots for endocytosis in vertebrate nerve terminals. J. Neurosci. 19 (12), 4855-4866 (1999).
- Tan, T. T. T., Khaw, C., Ng, M. M. L. Challenges and recent advances in live cell bioimaging. Microscopy: Science, Technology, Applications and Education. Mendez-Vilas, A., Diaz, J. , 1495-1505 (2010).
- Verbrugghe, K. J. C., Chan, R. C. Imaging C. elegans embryos using an epifluorescent microscope and open source software. J. Vis. Exp. (49), (2011).
