При опухолеобразовании молочной железы метастатическая стадия заболевания представляет наибольшую угрозу для пораженного человека. Нормальные клетки молочной железы с измененными генотипами теперь обладают способностью проникать и выживать в других тканях. В этом протоколе удаляются опухоли молочной железы мыши и из опухолей подготавливаются первичные клетки. Клетки, выделенные в результате этой процедуры, затем доступны для экспериментов по профилированию генов. Для успешного метастазирования эти клетки должны быть способны к интравазии, выживанию в циркуляции, экстравазации в отдаленные органы и выживанию в этой новой системе органов. Легкие являются типичной мишенью метастазирования рака молочной железы. Был обнаружен набор генов, который опосредует селективность метастазирования в легкие. В данной статье мы опишем метод изучения метастазов в легких на генетически модифицированной мышиной модели. Кроме того, включен еще один протокол анализа эмбриональных фибробластов (MEF) мыши из эмбриона мыши. MEF-клетки одного и того же животного типа дают ключ к разгадке экспрессии генов нераковых клеток. Вместе эти методы полезны для изучения опухолевого генеза молочной железы у мышей, связанных с ним сигнальных механизмов и путей аномалий у эмбрионов.