Summary

A Novel bioreaktor for High Density Dyrking av Diverse mikrobielle samfunn

Published: December 25, 2015
doi:

Summary

A novel reactor design, coined a high density bioreactor (HDBR), is presented for the cultivation and study of high density microbial communities. Here, the HDBR is successfully applied in a photobioreactor (PBR) configuration for the study of nitrogen metabolism by a mixed high density algal community.

Abstract

A novel reactor design, coined a high density bioreactor (HDBR), is presented for the cultivation and study of high density microbial communities. Past studies have evaluated the performance of the reactor for the removal of COD1 and nitrogen species2-4 by heterotrophic and chemoautotrophic bacteria, respectively. The HDBR design eliminates the requirement for external flocculation/sedimentation processes while still yielding effluent containing low suspended solids. In this study, the HDBR is applied as a photobioreactor (PBR) in order to characterize the nitrogen removal characteristics of an algae-based photosynthetic microbial community. As previously reported for this HDBR design, a stable biomass zone was established with a clear delineation between the biologically active portion of the reactor and the recycling reactor fluid, which resulted in a low suspended solid effluent. The algal community in the HDBR was observed to remove 18.4% of total nitrogen species in the influent. Varying NH4+ and NO3 concentrations in the feed did not have an effect on NH4+ removal (n=44, p=0.993 and n=44, p=0.610 respectively) while NH4+ feed concentration was found to be negatively related with NO3 removal (n=44, p=0.000) and NO3 feed concentration was found to be positively correlated with NO3 removal (n=44, p=0.000). Consistent removal of NH4+, combined with the accumulation of oxidized nitrogen species at high NH4+ fluxes indicates the presence of ammonia- and nitrite-oxidizing bacteria within the microbial community.

Introduction

Kommunalt avløpsvann er vanligvis behandlet med aktiverte slamprosesser for å redusere de suspenderte faste stoffer (SS), biologisk oksygenforbruk (BOD), organisk og uorganisk nitrogen, og fosforinnhold 5,6. Den aktiverte slamprosess, et middel for sekundær behandling av avløpsvann, innebærer oksydasjon av organisk karbon i en luftetank fylt med en blandet væske av innkommende avløpsvann og resirkulert heterotrof mikroorganisme (ofte referert til som aktivert slam) 5-7. Den blandede væsken entrer så en relativt stor klaringsinnretning (settling tank) der slammet legger seg for lettere innsamling, enten kastes eller resirkuleres tilbake til luftetanken, mens den klarede, renset avløpsvann kan fortsette til tertiær behandling eller desinfisering før den blir sluppet inn i resipienten 5-7. Effektiv separasjon av renset avløpsvann og faste stoffer (slam) i den sekundære klaringsinnretningen er viktig for riktig funksjon av en vartewater behandlingssystemet, som en hvilken som helst aktivert slam fortsetter utover klarings vil øke BOD og SS i avløpet 5-8.

En rekke alternative biologiske prosesser eksisterer for sekundær behandling av avløpsvann, som reduserer eller eliminerer behovet for store klargjørende tanker, deriblant festet-vekst (biofilmreaktorer), membran bioreaktorer (MBRs), og granulerte slamreaktorer. I biofilmreaktorer, dannelse av biofilm, hvori mikroorganismer naturlig aggregat, og feste som et lag på en fast overflate, gjør det mulig for biomasse oppbevaring og oppsamling uten behov for et klaringstank. Biofilmreaktorer kan klassifiseres i tre typer: pakket bed reaktorer, hvirvelsjiktreaktorer, og roterende biologiske kontaktorer. Pakket bed reaktorer, som for eksempel en sildrende filtre og biologiske tårn, bruke en stasjonær solid vekst overflate 5,6. Fluidisert sjiktreaktorer (FBRs) avhenger av festingen av mikroorganismer til partiklerslik som sand, granulert aktivert karbon (GAC), eller glasskuler, som holdes i suspensjon ved en høy oppoverrettede strømningshastighet 9,10. Roterende biologiske reaktorer avhenge av biofilmer dannet på media festet til en roterende aksel slik at biofilmen til å bli vekselvis utsettes for luft, og væsken som blir behandlet 5,6. MBRs bruke membranfiltreringsenheter, enten innenfor bioreaktor (nedsenket konfigurasjon) eller eksternt via resirkulasjon (side-stream konfigurasjon) 5,11. Membranene som tjener til å oppnå god separasjon av biomassen og faste partikler fra den behandlede flytende 11,12. Granulerte slamreaktorer er reaktorer med oppadgående strøm i hvilken dannelsen av ekstremt tette og godt avsetningsgranuler av mikroorganismer som forekommer når de utsettes for høye overflate luft oppstrømshastigheter 13.

Som et annet alternativ til den aktiverte slamprosess, et nytt reaktorsystem med strømning oppover, nå kalt en høy tetthet bioreaktor (HDBR), ble designed og bygget av Salg og Shieh (2006) for å studere COD fjerning av slam fra syntetiske avfallsstrømmer i lave F / M forhold som er kjent for å forårsake dannelse av dårlig bosetting slam (dvs. bulking slam) 1,7,14. Den HDBR system benyttes modifisert hvirvelsjiktreaktorer som vanligvis består av en oppstrømsreaktor og en ytre resirkuleringstank. Hvirvelsjiktreaktorer blir som regel drevet med resirkuleringsstrømmen strømningshastigheter som er høye nok til å holde biofilmveksten grunnen suspendert, men lav nok til at biofilm-dekket substrat bibeholdes. I motsetning til reaktorer med fluidisert sjikt, den HDBR beskrevet i salg og Shieh (2006) som brukes forholdsvis lave strømningshastigheter resirkuleringsstrøm som sammen med ytre lufting, forhindres ødeleggelse av biomassen sone som dannes i reaktoren 1. Senere studier har vist denne reaktordesign evne til å behandle en rekke nitrogen flukser hjelp nitrifiserende / denitrifiserende bakterier 3,4. I alle studies dannelsen av et stabilt, tett biomasse sone inne i HDBR eliminert behovet for en ekstern flokkulering / sedimenteringsprosessen 1-4.

Som vi rapporterer her, har bruken av HDBR å vokse tette kulturer også blitt testet i en fotobioreaktor (PBR) konfigurasjon for dyrking av alger. Vi diskuterer fordelene og ulempene med denne romanen reaktorsystemet for algedyrking og dens potensial for å overvinne et stort hinder i kommersialiseringen av alge biodrivstoff forbundet med biomasse høsting (dvs. god solid væske separasjon 15,16). Følgende protokoll beskriver fremgangsmåten for å montere, oppstart, prøve fra, og opprettholde en HDBR med alger som den mikrobielle samfunn av interesse. Variasjoner i oppstart og drift protokoll av heterotrofe og nitrifiserende / Denitrifisering kulturer vil også bli nevnt. Endelig, vil generelle fordeler, ulemper og ukjente i denne romanen reaktordesign bli markert.

Protocol

1. Reactor Assembly Ordne reaktorkomponenter i henhold til den skjematiske i figur 1. Plasser reaktoren (R) på en blande plate tilsettes en rørestav til reaktoren. Plasser resirkuleringstanken (RT) ved oppstuss plate og reaktoren slik at porten til tanken avløpet (øverst) er rettet mot kanten av lab benken. Sett avfallsbeholderen (W) under port av resirkuleringstanken (RT) avløpsvann (øverst). Plasser matetanken (FT) ved siden av resirkuleringstanken (RT). Merk…

Representative Results

Den HDBR ble brukt til å dyrke algene i løpet av flere forhold av innstrømmende ammoniakk og nitratkonsentrasjoner, og samtidig opprettholde et totalt nitrogeninnhold i råstoffet på 40 mg -NL -1. Innløp og avløpsprøver ble tatt daglig; biomassetetthet prøver ble tatt ved begynnelsen og slutten av hver tilstand. Reaktoren tok i gjennomsnitt 3-5 dager å nå steady state likevekt etter forholdene ble endret. Over et bredt spekter av tilstander innstrømmende en distinkt sone biomasse ble etablert, som …

Discussion

Denne delen vil starte med en diskusjon av protokollvariasjonene som er nødvendige for å løse mulige driftsmessige forhold samt bruk av ulike mikrobielle samfunn. Styrkene i denne reaktoren design vil bli diskutert, inkludert muligheten til å styre kontroll over oksygenfluks og dannelse av høy tetthet flokker i reaktoren. Aktuelle utfordringer og mulige veier for etterforskning vil også bli nevnt.

Protokoll nyanser og variasjoner
Driften av HDBRs for dyrking av forskjel…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

The authors would like to acknowledge Aspen Walker at the University of Pennsylvania for her assistance in reactor maintenance and sample collection.

Materials

Aeration stone Alita AS-3015C
Aerator Top Fin Air-1000
Ammonium chloride Sigma Aldrich A9434
Anion analysis column Shodex IC SI-52 4E
Beaker (600 mL) Corning Pyrex 1000-600 Used as mixing vessel (MV). Addition of hose barbs at the bottom and 500 mL levels. Outside diameter of hose barbs 3/8". 
Calcium chloride Sigma Aldrich C5670
Cation analysis column Shodex IC YS-50
Cobalt chloride hexahydrate Sigma Aldrich C8661
Copper chloride Sigma Aldrich 222011
Ferric chloride Sigma Aldrich 157740
Filter (vacuum) Fisherbrand 09-719-2E 0.45 um membrane filter, MCE, 47 mm diameter
Graduated cylinder (1000 mL) Corning Pyrex 3025-1L Used as reactor vessel (R). Addition of hose barbs at bottom, 500 mL, and 1 L levels. Outside diameter of hose barbs 3/8".
HPLC/IC Shimadzu Prominence
Magnesium sulfate Sigma Aldrich M2643
Masterflex L/S variable speed drive Masterflex 07553-50 Drive for recycle and feed pumps (2 needed)
Nickel chloride hexahydrate Sigma Aldrich N6136
Potassium nitrate Sigma Aldrich P8291
(Monobasic) Potassium phosphate Sigma Aldrich P5655
Pump head Masterflex 07018-20 Recycle pump head
Pump head Masterflex 07013-20 Feed pump head
Pump tubing Masterflex 6404-18 Recycle pump tubing
Pump tubing Masterflex 6404-13 Feed pump tubing
Sodium bicarbonate Sigma Aldrich S5761
Zinc sulfate heptahydrate Sigma Aldrich Z0251

References

  1. Sales, C. M., Shieh, W. K. Performance of an aerobic/anaerobic hybrid bioreactor under the nitrogen deficient and low F/M conditions. Water Res. 40 (7), 1442-1448 (2006).
  2. Nootong, K. . Performance and kinetic evaluations of a novel bioreactor system in the low-oxygen/low-fluid shear reaction environments. , 3225514 (2006).
  3. Nootong, K., Shieh, W. K. Analysis of an upflow bioreactor system for nitrogen removal via autotrophic nitrification and denitrification. Bioresour Technol. 99 (14), 6292-6298 (2008).
  4. Ramanathan, G., Sales, C. M., Shieh, W. K. Simultaneous autotrophic denitrification and nitrification in a low-oxygen reaction environment. Water Sci Technol. 70 (4), 729-735 (2014).
  5. Rittmann, B. E., McCarty, P. L. . Environmental Biotechnology: Principles and Applications. , (2001).
  6. Tchobanoglous, G., Burton, F. L., Stensel, H. D. . Wastewater Engineering: Treatment and Reuse. , (2002).
  7. Palm, J. C., Jenkins, D., Parker, D. S. Relationship between Organic Loading, Dissolved-Oxygen Concentration and Sludge Settleability in the Completely-Mixed Activated-Sludge Process. Journal Water Pollution Control Federation. 52 (10), 2484-2506 (1980).
  8. Jenkins, D. Towards a Comprehensive Model of Activated-Sludge Bulking and Foaming. Water Science and Technology. 25 (6), 215-230 (1992).
  9. Shieh, W., Keenan, J. Ch. 5 Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology. Bioproducts. 33, 131-169 (1986).
  10. Shieh, W. K., Li, C. T. Performance and Kinetics of Aerated Fluidized-Bed Biofilm Reactor. Journal of Environmental Engineering-Asce. 115 (1), 65-79 (1989).
  11. Alvarez-Vazquez, H., Jefferson, B., Judd, S. J. Membrane bioreactors vs conventional biological treatment of landfill leachate: a brief review. Journal of Chemical Technology & Biotechnology. 79 (10), 1043-1049 (2004).
  12. Fenu, A., et al. Activated sludge model (ASM) based modelling of membrane bioreactor (MBR) processes: a critical review with special regard to MBR specificities. Water Res. 44 (15), 4272-4294 (2010).
  13. Liu, Y., Tay, J. H. The essential role of hydrodynamic shear force in the formation of biofilm and granular sludge. Water Res. 36 (7), 1653-1665 (2002).
  14. Chudoba, J., Grau, P., Ottová, V. Control of activated-sludge filamentous bulking-II. Selection of microorganisms by means of a selector. Water Research. 7 (10), 1389-1406 (1973).
  15. Christenson, L., Sims, R. Production and harvesting of microalgae for wastewater treatment, biofuels, and bioproducts. Biotechnol Adv. 29 (6), 686-702 (2011).
  16. Henderson, R., Parsons, S. A., Jefferson, B. The impact of algal properties and pre-oxidation on solid-liquid separation of algae. Water Res. 42 (8-9), 8-9 (2008).
  17. Jackson, P. E., Meyers, R. A. . Encyclopedia of Analytical Chemistry. , (2000).
  18. Wilkinson, G. N., Rogers, C. E. Symbolic descriptions of factorial models for analysis of variance. Applied Statistics. 22, 392-399 (1973).
  19. Chambers, J. M., Chambers, J. M., Hastie, T. J. Ch. 4. Statistical Models in S. , (1992).
  20. R Core Team. . R: A Language and Environment for Statistical Computing. , (2015).
  21. Ramanathan, G., Sales, C. M., Shieh, W. K. Apendix:Simultaneous autotrophic denitrification and nitrification in a low-oxygen reaction environment. Water Science & Technology. 70 (4), 729-735 (2014).
  22. . . Wastewater Management Fact Sheet – Energy Conservation. 832F06024, 1-7 (2006).
  23. Curtis, T. P., Mitchell, R., Gu, J. D. Ch 13. Environmental Biotechnology. , (2010).
  24. Asada, K. THE WATER-WATER CYCLE IN CHLOROPLASTS: Scavenging of Active Oxygens and Dissipation of Excess Photons. Annu Rev Plant Physiol Plant Mol Biol. 50, 601-639 (1999).
  25. Mullineaux, P., Karpinski, S. Signal transduction in response to excess light: getting out of the chloroplast. Curr Opin Plant Biol. 5 (1), 43-48 (2002).
  26. Mallick, N., Mohn, F. H. Reactive oxygen species: response of algal cells. Journal of Plant Physiology. 157 (2), 183-193 (2000).
  27. Fridovich, I. Oxygen toxicity: a radical explanation. J Exp Biol. 201 ((Pt 8)), 1203-1209 (1998).
  28. Doyle, S. M., Diamond, M., McCabe, P. F. Chloroplast and reactive oxygen species involvement in apoptotic-like programmed cell death in Arabidopsis suspension cultures. J Exp Bot. 61 (2), 473-482 (2010).
  29. Eisma, D., et al. Suspended-matter particle size in some West-European estuaries; part II: A review on floc formation and break-up. Netherlands Journal of Sea Research. 28 (3), 215-220 (1991).
  30. Thomas, D. N., Judd, S. J., Fawcett, N. Flocculation modelling: A review. Water Research. 33 (7), 1579-1592 (1999).
  31. Harris, R. H., Mitchell, R. The role of polymers in microbial aggregation. Annu Rev Microbiol. 27, 27-50 (1973).
  32. Raszka, A., Chorvatova, M., Wanner, J. The role and significance of extracellular polymers in activated sludge. Part I: Literature review. Acta Hydrochimica Et Hydrobiologica. 34 (5), 411-424 (2006).
  33. Lakaniemi, A. M., Intihar, V. M., Tuovinen, O. H., Puhakka, J. A. Growth of Dunaliella tertiolecta and associated bacteria in photobioreactors. J Ind Microbiol Biotechnol. 39 (9), 1357-1365 (2012).
  34. Lakaniemi, A. M., Intihar, V. M., Tuovinen, O. H., Puhakka, J. A. Growth of Chlorella vulgaris and associated bacteria in photobioreactors. Microb Biotechnol. 5 (1), 69-78 (2012).
  35. Natrah, F. M. I., Bossier, P., Sorgeloos, P., Yusoff, F. M., Defoirdt, T. Significance of microalgal-bacterial interactions for aquaculture. Reviews in Aquaculture. 6 (1), 48-61 (2014).
  36. Dittami, S. M., Eveillard, D., Tonon, T. A metabolic approach to study algal-bacterial interactions in changing environments. Mol Ecol. 23 (7), 1656-1660 (2014).
  37. Watanabe, K., et al. Symbiotic association in Chlorella culture. FEMS Microbiol Ecol. 51 (2), 187-196 (2005).
  38. Burke, C., Thomas, T., Lewis, M., Steinberg, P., Kjelleberg, S. Composition, uniqueness and variability of the epiphytic bacterial community of the green alga Ulva australis. ISME J. 5 (4), 590-600 (2011).
  39. Krohn-Molt, I., et al. Metagenome survey of a multispecies and alga-associated biofilm revealed key elements of bacterial-algal interactions in photobioreactors. Appl Environ Microbiol. 79 (20), 6196-6206 (2013).
  40. Cooper, E. D., Bentlage, B., Gibbons, T. R., Bachvaroff, T. R., Delwiche, C. F. Metatranscriptome profiling of a harmful algal bloom. Harmful Algae. 37, 75-83 (2014).
check_url/53443?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Price, J. R., Shieh, W. K., Sales, C. M. A Novel Bioreactor for High Density Cultivation of Diverse Microbial Communities. J. Vis. Exp. (106), e53443, doi:10.3791/53443 (2015).

View Video