Summary

Att skapa Sub-50 Nm nanofluidic korsningar i PDMS mikroflödes Chip via självorganiserande processen av kolloidala partiklar

Published: March 13, 2016
doi:

Summary

We propose a simple self-assembly technique of silica colloidal nanoparticles to create a nanofluidic junction between two microchannels in polydimethylsiloxane (PDMS). Using this technique, a nanoporous bead membrane with a pore size down to ~45 nm was built inside a microchannel and applied to electrokinetic preconcentration of DNA samples.

Abstract

Polydimetylsiloxan (PDMS) är den rådande byggnadsmaterialet att göra mikroflödessystem enheter på grund av dess enkla gjutning och bindning samt dess öppenhet. På grund av mjukheten hos PDMS materialet, är det emellertid svårt att använda PDMS för att bygga nanokanaler. Kanalerna tenderar att kollapsa lätt under plasma bindning. I detta dokument presenterar vi en avdunstning driven självorganisering metod kolloidal nanopartiklar för att skapa nanofluidic korsningar med sub-50 nm porer mellan två mikro. Porstorleken samt ytladdningen hos den nanofluidic korsningen är avstämbar helt enkelt genom att ändra den kolloidala kiseldioxiden pärlstorlek och ytfunktionalisering utanför den monterade mikroflödessystem enhet i en injektionsflaska innan den självorganiserande processen. Använda självorganisering av nanopartiklar med en pärla storlek på 300 nm, 500 nm och 900 nm, var det möjligt att tillverka ett poröst membran med en porstorlek av ~ 45 nm, ~ 75 nm och ~ 135 nm, respektive. Under elektriskal potential, denna nanoporösa membran inlett jonkoncentration polarisering (ICP) som fungerar som en katjon-selektiv membran för att koncentrera DNA genom ~ 1700 gånger inom 15 minuter. Denna icke-litografiska nanofabrikation processen öppnar upp en ny möjlighet att bygga en avstämbar nanofluidic knutpunkt för studiet av nanotransportprocesser av joner och molekyler inuti en PDMS mikroflödessystem chip.

Introduction

Nanofluidik är ett växande forskningsområde | i TAS (Micro Total Analysis System) för att studera biologiska processer eller transportfenomen av joner och molekyler på längdskalan av 10 januari-10 Februari nm. Med tillkomsten av de nanofluidic verktyg såsom nanokanaler, kan transportprocesser av molekyler och joner övervakas med oöverträffad precision och manipuleras, om det behövs, genom att utnyttja funktioner som bara är tillgängliga på denna längd skala för separation och detektion. 1,2 Ett av dessa karakteristiska nano funktioner är en hög andel av ytan till bulkladdning (eller Dukhin nummer) i nanokanaler som kan orsaka en laddningsobalans och initiera jonkoncentration polarisering (ICP) mellan nanochannel och mikro. 3

En gemensam enhetsplattform för studier av nanofluidic fenomen består av en två-mikrokanalsystemet förbundna genom en matris med nanokanaler som en knutpunkt. 4-6 </sup> Materialet i valet för att bygga en sådan nanofluidic anordning är kisel på grund av sin höga styvhet som förhindrar kanalen från att kollapsa under bindningsprocesser. 7 emellertid kiselanordningstillverkning kräver dyra masker och betydande mängd bearbetning i renrumsanläggningen. 8- 10 på grund av att underlätta för enheten tillverkning genom gjutning och plasma bindning, polydimetylsiloxan (PDMS) har allmänt accepterats som byggnadsmaterial för mikrofluidik och det skulle vara ett idealiskt material för nanofluidik också. Men dess låga Youngs modul runt 360-870 kPa, gör PDMS kanalen lätt hopfällbar under plasma bindning. Sidförhållandet av nanochannel (bredd och djup) minst måste vara mindre än 10: 1, vilket innebär att tillverkningen av PDMS-enheter via standard fotolitografi blir extremt utmanande om nanochannel djupet måste vara under 100 nm, vilket kräver en kanalbredd mindre än den nuvarande gränsen för Fotolitograferaography på runt 1 pm. För att övervinna denna begränsning, har det förekommit försök att skapa nanokanaler i PDMS som använder icke-litografiska metoder, såsom sträckning för att initiera sprickor med medeldjup av 78 nm 11 eller för att bilda rynkor efter plasmabehandling. 12 kollapsa en PDMS-kanal med mekaniskt tryck tillåts en nanochannel höjd så låg som 60 nm. 13

Trots dessa mycket uppfinningsrika icke-litografiska metoder tillåtna byggnanokanaler under 100 nm i djup, utgör mått styrbarhet av nanochannel tillverkning fortfarande ett hinder för en bred acceptans av PDMS som byggnadsmaterial för nanofluidic enheter. Ett annat kritiskt problem av de nanokanaler, vare sig i kisel eller PDMS, är ytan funktionalisering i fall det finns ett behov av att ändra ytladdningen på kanalväggen för manipulering av joner eller molekyler. Efter anordningsenheten genom limning, de nanokanaler är extremt svåra attnå för ytan funktionalisering på grund av diffusion begränsade transport. Att skapa en nano kanal med hög dimensionell trohet och enkel yta funktionalisering, kan självorganisering metod för kolloidala partiklar inducerade genom avdunstning 14-16 i mikroflödessystem enheter vara en av de lovande metoder. Förutom möjligheten att kontrollera porstorlek och ytegenskapen, det finns även en möjlighet att avstämma storleken av poren in situ vid användning av kolloidala partiklar belagda med polyelektrolyter genom att styra temperatur, 17 pH, 18,19 och jonstyrka. 18 På grund av dessa fördelar, har den självsammansättningsmetoden av kolloidala partiklar som redan har hittats applikationer för elektrokromatografi, 20 biosensorer, 21 proteinkoncentration 22 och separation av proteiner och DNA i mikrofluidik. 14,23 i denna studie, iordning vi denna självsammansättning metod för att bygga en elektrokinetisk förkoncentrering enheten iPDMS som kräver en nanofluidic korsning mellan två mikro. 24 Den grundläggande mekanismen bakom den elektrokinetiska koncentrationen är baserad på jonkoncentration polarisation (ICP). 25 En detaljerad beskrivning av tillverknings- och monteringssteg ingår i följande protokoll.

Protocol

1. Framställning av de Silica Kolloidala Bead Suspensioner Framställning av 300 nm och 500 nm kiseldioxid pärla suspensioner Vortex kiseldioxiden bead stock suspension (10% vikt / volym i vatten) under 30 sek. för att erhålla en homogen suspension. Pipettera totalt 600 | j, l stamsuspension in i ett 1,5 ml rör och centrifugera den vid 2600 xg under 1 min. Ersätta supernatanten med 400 | il av 1 mM natriumfosfatbuffert (PB, pH 7,0). Suspendera kiseldioxidpä…

Representative Results

En elektrokinetisk koncentrator chip i PDMS som innehåller en egenmonterad nanofluidic korsning mellan två mikrokanaler visas i figur 1A). Kanalen i mitten av anordningen är fylld med ett DNA-prov-lösning och flankeras av två buffertlösning kanaler på varje sida via en 50 | im breda vulsten leveranskanal (Figur 1B). Kiseldioxid kolloidal suspension flygs in pärlan leveranskanal direkt efter plasma bindning för att skapa en nanofluidic korsning m…

Discussion

Efter den gemensamma enheten designschema för att studera nanofluidik, tillverkade vi en nanofluidic korsning mellan två mikroflödessystem kanaler med hjälp av avdunstning drivna självorganisering av kolloidala nanopartiklar i stället för litografiskt mönstring en rad nanokanaler. När den strömmar de kolloidala partiklarna i vulsten leveranskanal, en matris med nanotraps med ett djup på 700 nm och en bredd av 2 | j, m på båda sidor om vulsten leveranskanal vid en total bredd på 100 | j, m förhindrade kuls…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Detta arbete stöddes av NIH R21 EB008177-01A2 och New York University Abu Dhabi (NYUAD) Forskning Enhancement Fund 2013. Vi uttrycker vårt tack till den tekniska personalen av MIT MTL för deras stöd under mikro och James Weston och Nikolas Giakoumidis av NYUAD för deras stöd i att ta SEM-bilder och bygga en spänningsdelare, respektive. Enheten tillverkning i PDMS genomfördes i mikrokärnanläggningen NYUAD. Slutligen vill vi tacka Rebecca Pittam från NYUAD Center for Digital stipendium för videoinspelning och redigering.

Materials

Poly(Styrenesulfonic Acid) Sodium Salt Polysciences  08772
Poly(allylamine) Solution Sigma Aldrich 479144-5G
Silica Microsphere – 300 nm Polysciences  24321
Silica Microsphere – 500 nm Polysciences  24323
Silica Microsphere Carboxyl Functional – 500 nm Polysciences  24753
Silica Microsphere Amine Functional – 500 nm Polysciences  24756
Sylgard 184 Silicone Elastomer kit Dow Corning
Trichlorosilane Sigma Aldrich 175552
Ultrasonic Cleaner Branson 3510
Tube Rotator  VWR 10136-084
Vortex Mixer WiseMix VM-10
Microcentrifuge VWR Micro 1207
Plasma Cleaner Harrick Plasma PDC-001-HP
PDMS Mixer Thinky ARE-250
Oven Thermo Scientific PR305220M
Epi-fluorescence Microscope Nikon Eclipse Ti
CCD Camera Andor Clara
Platinum Electrodes Alfa Aesar 43014
Source Meter Keithley 2400
Digital Multimeter  Extech 410
Microscopy Glass Slides Thermo Scientific 2951-001
Tween 20 Merck Millipore 822184
Sodium chloride Fisher Scientific 7646-14-5
Sodium phosphate monobasic Sigma Aldrich 71505
Sodium phosphate dibasic Sigma Aldrich S3264
DNA IDT CAA CCG ATG CCA CAT CAT TAG CTA C
B-Phycoerythrin Life Technologies P-800
Dynamic light scattering system for Zeta Potential Measurement Malvern Zetasizer Nano S
Photoresist  Shipley SPR700-1.0
Projection lithography Nikon NSR2005i9
Reactive Ion Etcher Applied Materials AME P5000
ICP deep reactive ion etcher STS STS-6"
Contact lithography Electronic Visions EV620
Photoresist Coater Developer SSI SSI 150
Non-contact surface profiler Wyko NT 9800

References

  1. Mawatari, K., Kazoe, Y., Shimizu, H., Pihosh, Y., Kitamori, T. Extended-Nanofluidics: Fundamental Technologies, Unique Liquid Properties, and Application in Chemical and Bio Analysis Methods and Devices. Anal Chem. 86, 4068-4077 (2014).
  2. Tsukahara, T., Mawatari, K., Kitamori, T. Integrated extended-nano chemical systems on a chip. Chem Soc Rev. 39, 1000-1013 (2010).
  3. Mani, A., Zangle, T. A., Santiago, J. G. On the Propagation of Concentration Polarization from Microchannel-Nanochannel Interfaces Part I: Analytical Model and Characteristic Analysis. Langmuir. 25, 3898-3908 (2009).
  4. Aizel, K., et al. Enrichment of nanoparticles and bacteria using electroless and manual actuation modes of a bypass nanofluidic device. Lab Chip. 13, 4476-4485 (2013).
  5. Wang, Y. C., Stevens, A. L., Han, J. Million-fold preconcentration of proteins and peptides by nanofluidic filter. Anal Chem. 77, 4293-4299 (2005).
  6. Karnik, R., et al. Electrostatic control of ions and molecules in nanofluidic transistors. Nano letters. 5, 943-948 (2005).
  7. Mao, P., Han, J. Y. Fabrication and characterization of 20 nm planar nanofluidic channels by glass-glass and glass-silicon bonding. Lab Chip. 5, 837-844 (2005).
  8. Mao, P., Han, J. Massively-parallel ultra-high-aspect-ratio nanochannels as mesoporous membranes. Lab Chip. 9, 586-591 (2009).
  9. Balducci, A., Mao, P., Han, J. Y., Doyle, P. S. Double-stranded DNA diffusion in slitlike nanochannels. Macromolecules. 39, 6273-6281 (2006).
  10. Yamada, M., Mao, P., Fu, J. P., Han, J. Y. Rapid Quantification of Disease-Marker Proteins Using Continuous-Flow Immunoseparation in a Nanosieve Fluidic Device. Anal Chem. 81, 7067-7074 (2009).
  11. Huh, D., et al. Tuneable elastomeric nanochannels for nanofluidic manipulation. Nat Mater. 6, 424-428 (2007).
  12. Chung, S., Lee, J. H., Moon, M. W., Han, J., Kamm, R. D. Non-lithographic wrinkle nanochannels for protein preconcentration. Adv Mater. 20, 3011-3016 (2008).
  13. Park, S. M., Huh, Y. S., Craighead, H. G., Erickson, D. A method for nanofluidic device prototyping using elastomeric collapse. Proc Natl Acad Sci. 106, 15549-15554 (2009).
  14. Zeng, Y., Harrison, D. J. Self-assembled colloidal arrays as three-dimensional nanofluidic sieves for separation of biomolecules on microchips. Anal Chem. 79, 2289-2295 (2007).
  15. Malekpourkoupaei, A., Kostiuk, L. W., Harrison, D. J. Fabrication of Binary Opal Lattices in Microfluidic Devices. Chem Mat. 25, 3808-3815 (2013).
  16. Merlin, A., Salmon, J. -. B., Leng, J. Microfluidic-assisted growth of colloidal crystals. Soft Matter. 8, 3526-3537 (2012).
  17. Schepelina, O., Zharov, I. PNIPAAM-modified nanoporous colloidal films with positive and negative temperature gating. Langmuir. 23, 12704-12709 (2007).
  18. Schepelina, O., Zharov, I. Poly(2-(dimethylamino)ethyl methacrylate)-Modified Nanoporous Colloidal Films with pH and Ion Response. Langmuir. 24, 14188-14194 (2008).
  19. Smith, J. J., Zharov, I. Ion transport in sulfonated nanoporous colloidal films. Langmuir. 24, 2650-2654 (2008).
  20. Gaspar, A., Hernandez, L., Stevens, S., Gomez, F. A. Electrochromatography in microchips packed with conventional reversed-phase silica particles. Electrophoresis. 29, 1638-1642 (2008).
  21. Lee, S. Y., et al. High-Fidelity Optofluidic On-Chip Sensors Using Well-Defined Gold Nanowell Crystals. Anal Chem. 83, 9174-9180 (2011).
  22. Hu, Y. L., et al. Interconnected ordered nanoporous networks of colloidal crystals integrated on a microfluidic chip for highly efficient protein concentration. Electrophoresis. 32, 3424-3430 (2011).
  23. Zhang, D. -. W., et al. Microfabrication-free fused silica nanofluidic interface for on chip electrokinetic stacking of DNA. Microfluid Nanofluid. 14, 69-76 (2013).
  24. Syed, A., Mangano, L., Mao, P., Han, J., Song, Y. A. Creating sub-50 nm nanofluidic junctions in a PDMS microchip via self-assembly process of colloidal silica beads for electrokinetic concentration of biomolecules. Lab Chip. 14, 4455-4460 (2014).
  25. Kim, S. J., Song, Y. A., Han, J. Nanofluidic concentration devices for biomolecules utilizing ion concentration polarization: theory, fabrication, and applications. Chem Soc Rev. 39, 912-922 (2010).
  26. Fu, J. P., Mao, P., Han, J. Y. Continuous-flow bioseparation using microfabricated anisotropic nanofluidic sieving structures. Nat Protoc. 4, 1681-1698 (2009).
  27. Plecis, A., Nanteuil, C., Haghiri-Gosnet, A. M., Chen, Y. Electropreconcentration with Charge-Selective Nanochannels. Anal Chem. 80, 9542-9550 (2008).
  28. Ko, S. H., et al. Nanofluidic preconcentration device in a straight microchannel using ion concentration polarization. Lab Chip. 12, 4472-4482 (2012).
check_url/54145?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Wei, X., Syed, A., Mao, P., Han, J., Song, Y. Creating Sub-50 Nm Nanofluidic Junctions in PDMS Microfluidic Chip via Self-Assembly Process of Colloidal Particles. J. Vis. Exp. (109), e54145, doi:10.3791/54145 (2016).

View Video