Burada tek tek hayvan uzun bir süre boyunca izlemek için bir iletişim kuralı mevcut. Vaka çalışması, aynı anda nasıl evine, bilgi veren bir grup ıstakoz kullanarak el ile oluşturulmuş etiketleri kümesini tanımlamak için yöntemleri işlemek ve ıstakoz işaretlemek bilgisayarlı görme kullanır.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Cohoused suda yaşayan hayvanların uzun süreli Video izleme: Norveç ıstakoz (Nephrops norvegicus) ve günlük Lokomotor aktivite bir vaka çalışması
* These authors contributed equally
Bu makalede
Özet
Özet
Biz arka plan çıkarma ve ayrı ayrı cohoused hayvanları izlemek olanak sağlar görüntü eşik dayalı bir video izleme tekniği ile ilgili bir protokol mevcut. Dört cohoused Norveç ıstakoz (Nephrops norvegicus) ile izleme rutin 5 gün boyunca ışık-karanlık koşullarda test ettik. Istakoz tek tek etiketli. Deneysel kurulum ve izleme teknikleri kullanılan tamamen açık kaynak yazılım üzerinde temel alır. El ile algılama ile izleme çıktısının karşılaştırma ıstakoz doğru olduğunu gösterir % 69 kez algılandı. Arasında doğru bir şekilde tespit edilen ıstakoz, onların bireysel etiketleri doğru olduğunu %89,5 kez tanımlanmış. Göz önüne alındığında iletişim kuralında kullanılan kare hızı ve ıstakoz hareket hızı, video izleme performansı iyi bir kalite sahiptir ve araştırma ihtiyaçları (birey için değerli veri üretiminde protokol geçerliliğini temsilcisi sonuçları destek Uzay doluluk veya Lokomotor aktivite desen). Burada sunulan Protokolü kolayca özelleştirilebilir ve, bu nedenle, nereye örneklerin bir gruptaki bireysel izleme-ebilmek var olmak araştırma soruları yanıtlamak için değerli diğer türler için transfer edilebilir.
Giriş
Son birkaç yılda, ekoloji ve davranış disiplinleri1temel soruları keşfetmek için kullanılan son derece hassas veri kümeleri otomatik görüntü tabanlı izleme sağlamıştır. Bu veri kümeleri için kantitatif analiz hayvan davranışları2,3kullanılabilir. Ancak, her görüntü metodoloji hayvanlar ve davranış değerlendirme izlemek için kullanılan onun güçlü ve sınırlamalar vardır. İki hayvan yolları geçerken hayvanlar4,5,6izlemek için bir film önceki kare uzamsal bilgileri kullanın yansıma tabanlı izleme p....
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Protokol
Bu çalışmada kullanılan türler bir nesli tehlike altında olan veya korunan türler değildir. Örnekleme, laboratuvar deneyleri İspanyol mevzuat ve hayvan refahı ile ilgili iç kurumsal (ICM-CSIC) kuralları izledi. Hayvan örnekleme yerel otorite (Katalonya bölgesel hükümet) izni ile yapılmıştır.
1. hayvan bakım ve örnekleme
Not: Aşağıdaki Protokolü araştırmacılar zarar vermemek için photoreceptors23gece boyunca i. norvegicus alanında tadabilirsiniz varsayımına dayanır. İ. norvegicus ışığına maruz kalma kaçınılmalıdır. Örnekleme sonra ıstakoz Tarih daha önce
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Sonuçlar
Otomatik video analiz doğrulamak için deneysel verilerin bir alt kümesini el ile inşa edilmiştir. 1,308 çerçeveler bir güven düzeyi % 99 (nüfus, resminizde bir hata sınırı içinde örnek iyi yansıtacak olup olmadığını gösterir güvenlik ölçüsü olan) ve hata % 4'lük payı ile bir örnek boyutu (ne kadar yakın açıklayan yüzde olduğu yanıttır örnek verdi nüfus gerçek değerine) rastgele seçilmiştir, ve el ile ek açıklama ROIs doğru tanımlaması ve her yatırım Getirisi etiketinde doğru tanımlaması g.......
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tartışma
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Açıklamalar
Yazarlar ifşa gerek yok.
Teşekkürler
Yazarlar bu eserin yayın finanse Dr. Joan B. şirket için minnettarız. Ayrıca, Yazarlar deneysel çalışmaları sırasında deniz Bilimler Enstitüsü Barselona (ICM-CSIC) deneysel akvaryum bölgenin kendi yardım teknisyenleri için minnettarız.
Bu eser RITFIM projesi tarafından desteklenmiştir (CTM2010-16274; yürütücü: J. Aguzzi) İspanyol Bakanlığı bilim ve yenilik (MICINN) ve İspanyolca Bakanlığı Ekonomi ve rekabet TIN2015-66951-C2-2-R hibe tarafından kurulmuş.
....Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Malzemeler
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Tripod 475 | Manfrotto | A0673528 | Üretimi Durdurulan |
| Mafsallı Kol 143 | Manfrotto | D0057824 | Üretimi Durdurulan |
| Kamera USB 2.0 uEye LE | iDS | UI-1545LE-M | https://en.ids-imaging.com/store/products/cameras/usb-2-0-cameras/ueye-le.html |
| Balık Gözü Len C-mount f = 6 mm/F1.4 | Infaimon | Standart Optik | https://www.infaimon.com/es/estandar-6mm |
| Cam Elyaf Tankı 1500 x 700 x 300 mm 3< / sup> | |||
| Siyah Keçe Kumaş | |||
| Ahşap Yapı Tankı | 5 Ahşap Şerit 50x50x250 mm | ||
| Ahşap Yapı Keçe Kumaş | 10 Ahşap Şerit 25x25x250 mm | ||
| Paslanmaz Çelik Vidalar | Ahşap şerit yapıları PC'yi sabitlemek için gerektiği kadar | ||
| 2 çekirdekli CPU, 4 GB RAM, 1 GB Grafik, 500 GB HD | |||
| Harici Depolama HDD | 2 TB kapasite arzu edilen | ||
| Windows PC için iSPY Sotfware | iSPY | https://www.ispyconnect.com/download.aspx | |
| Zoneminder Yazılımı Linux PC | Zoneminder | https://zoneminder.com/ | |
| OpenCV 2.4.13.6 Kütüphanesi | OpenCV | https://opencv.org/ | |
| Python 2.4 | Python | https://www.python.org/ | |
| Kamp Buzluk | |||
| Plastik Tepsi | |||
| Siyanokrilat Jel | Etiketi yapıştırmak için' S | ||
| 1 siyah PVC plastik levha (1 mm kalınlık) | Etiketin yapısı | ||
| 1 beyaz PVC plastik levha (1 mm kalınlık) | Etiketin yapısı | ||
| 4 Etiket ' s & Oslash; 40 mm | Siyah-beyaz PVC plastik levha ile üretilmiştir | ||
| 3 m Mavi Strid Led Ligts (480 nm) | İstenilen kadar su geçirmez | ||
| 3 m IR Strid Led Ligts (850 nm) | İstenildiği gibi su geçirmez | ||
| 6 m Metakrilat borular ve oslash; 15 mm | Kapalı Strid Led | ||
| 4 PVC Dirsek 45o & Oslash; 63 mm | Yuva konstrüksiyonu | ||
| 3 m Esnek PVC Boru & Oslash; 63 mm | Yuva konstrüksiyonu | ||
| 4 PVC vidalı kapak & Oslash; 63 mm | |||
| Yuva konstrüksiyonu | |||
| 4 Dişi PVC soket tutkal / iplik & Oslash; 63 mm | Yuva yapımı | ||
| 10 m DC 12V Elektrik Kablosu | Işık Kontrol Mekanizması | ||
| Ligt Güç Kaynağı DC 12 V 300 W | Işık Kontrol Mekanizması | ||
| MOSFET, RFD14N05L, N-Kanal, 14 A, 50 V, 3 Pin, IPAK (TO-251) | RS Bileşenleri | 325-7580 | Işık Kontrol Mekanizması |
| Diyot, 1N4004-E3/54, 1A, 400V, DO-204AL, 2 Pines | RS Bileşenleri | 628-9029 | Işık Kontrol Mekanizması |
| Sigorta Tutucu | RS Bileşenleri | 336-7851 | Işık Kontrol Mekanizması |
| 2 Güç Terminali 3.81 mm | RS Bileşenleri | 220-4658 | Işık Kontrol |
| Mekanizması Kondansatör 220 ve mikro; F 200 V | RS Bileşenleri | 440-6761 | Işık Kontrol |
| Mekanizması Direnci 2K2 7 W | RS Bileşenleri | 485-3038 | Işık Kontrol Mekanizması Sigortası |
| 6.3 x 32 mm2 3A | RS Bileşenleri | 413-210 | Işık Kontrol Mekanizması |
| Arduino Uno Atmel Atmega 328 MCU kartı | RS Bileşenleri | 715-4081 | Işık Kontrol |
| Mekanizması Prototip Kartı CEM3,3 orific.,RE310S2 | RS Bileşenleri | 728-8737 | Işık Kontrol Mekanizması |
| DC/DC dönüştürücü,12 Vin,+/-5 Vout 100 mA 1 W | RS Bileşenleri | 689-5179 | Işık Kontrol Mekanizması |
| 2 SERA T8 mavi ay ışığı floresan ampul 36 watt | SERA | Durdurulan/Işık yalıtımlı tesis |
Kaynaklar
- Dell, A. I., et al. Automated image-based tracking and its application in ecology. Trends in Ecology & Evolution. 29 (7), 417-428 (2014).
- Berman, G. J., Choi, D. M., Bialek, W., Shaevitz, J. W. Mapping the stereotyped behaviour of freely mo....
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yeniden basım ve izinler
