Aterosclerose continua a ser a principal causa de morte no mundo e, apesar de inúmeros estudos pré-clínicos descrevendo alvos terapêuticos promissores, intervenções romance permanecem indescritíveis. Isto é provavelmente devido, em parte, para uma dependência de modelos pré-clínicos prevenção investigando os efeitos de manipulações genéticas ou tratamentos farmacológicos sobre o desenvolvimento de aterosclerose em vez da doença estabelecida. Também, os resultados desses estudos são muitas vezes confusão devido a utilização de análises de lesão superficial e uma falta de caracterização de populações de células da lesão. Para ajudar a superar esses obstáculos translacionais, propomos um aumento da dependência em modelos de intervenção que empregam a investigação das alterações na composição celular a um nível de célula única por imunofluorescência coloração e microscopia confocal. Para este fim, descrevemos um protocolo para teste um putativo agente terapêutico em um modelo murino de intervenção, incluindo uma abordagem sistemática para dissecação animal, incorporação, corte, coloração e quantificação das lesões da artéria Braquiocefálica. Além disso, devido à diversidade fenotípica de células dentro de lesões ateroscleróticas do tarde-estágio, descrevemos a importância do uso de sistemas de rato de rastreamento de linhagem celular específica, inducible e como isso pode ser aproveitado para a caracterização imparcial da populações de células da lesão aterosclerótica. Juntos, essas estratégias podem auxiliar biólogos vasculares mais precisamente modelo intervenções terapêuticas e analisar a doença aterosclerótica e Tomara que se traduzirá em uma maior taxa de sucesso em ensaios clínicos.