Een abonnement op JoVE is vereist om deze inhoud te bekijken. Log in of start vandaag met uw gratis proefperiode.

Methodenartikel

Lentivirale CRISPR/Cas9-gemedieerde genoom bewerking voor de studie van hematopoietische cellen in ziekte modellen

11.7K weergaven

⸱

DOI:

10.3791/59977

⸱

3 oktober 2019

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 

In dit artikel

Samenvatting

Beschreven zijn protocollen voor de zeer efficiënte genoom bewerking van muriene hematopoietische stam en voorlopercellen (HSPC) door het CRISPR/Cas9-systeem om snel muismodel systemen te ontwikkelen met hematopoietische systeemspecifieke genmodificaties.

Samenvatting

Het manipuleren van genen in hematopoietische stamcellen met conventionele Transgenese benaderingen kan tijdrovend, duur en uitdagend zijn. Met het voordeel van de vooruitgang in de genoom Editing technologie en lentivirusgemedieerde transgen toedieningssystemen, wordt hier een efficiënte en economische methode beschreven die muizen vastlegt waarin genen specifiek worden gemanipuleerd in hematopoietische stamcellen. Lentivirussen worden gebruikt om Cas9-uitverkorende Lineage-negatieve beenmergcellen te leiden met een RNA-gelei (gRNA) gericht op specifieke genen en een rood fluorescentie reporter-gen (RFP), waarna deze cellen worden getransplanteerd in dodelijk bestraalde C57BL/6 muizen. Muizen die worden getransplanteerd met lentivirus die niet-gerichte gRNA uitdrukken, worden gebruikt als besturingselementen. Engraftment van getransduceerde hematopoietische stamcellen wordt geëvalueerd door flowcytometrische analyse van RFP-positieve leukocyten van perifeer bloed. Met behulp van deze methode, ~ 90% transductie van myeloïde cellen en ~ 70% van lymfoïde cellen na 4 weken na transplantatie kan worden bereikt. Genomisch DNA is geïsoleerd van RFP-positieve bloedcellen, en delen van het doelwit van het DNA van de site worden versterkt door PCR om de genoom bewerking te valideren. Dit protocol biedt een evaluatie van de hoge doorvoer van Hematopoiesis-regelgevende genen en kan worden uitgebreid naar een verscheidenheid van muis ziekte modellen met hematopoietische celbetrokkenheid.

Inleiding

Veel studies in hematologie en immunologie vertrouwen op de beschikbaarheid van genetisch gemodificeerde muizen, met inbegrip van conventionele en voorwaardelijke transgene/knock-out muizen die gebruik maken van hematopoietische systeemspecifieke CRE drivers zoals Mxcre, vav-CRE, en anderen 1,2,3,4,5. Deze strategieën vereisen de oprichting van nieuwe muis stammen, die tijdrovend en financieel belastend kunnen zijn. Terwijl revolutionaire ontwikkelingen in de genoom Editing technologie het genereren van nie....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Protocol

Alle procedures met betrekking tot dierproef personen zijn goedgekeurd door het institutioneel Dierenzorg-en gebruiks Comité (IACUC) aan de Universiteit van Virginia.

1. opwekking en zuivering van lentivirusdeeltjes

Opmerking: Lentivirusdeeltjes met de geoptimaliseerde handleiding RNA kunnen worden geproduceerd door de gedetailleerde protocollen die door Addgene: < https://media.addgene.org/cms/files/Zhang_lab_LentiCRISPR_library_protocol.pdf) >. De geoptimaliseerde methoden voor de bereiding en opslag van hoogtiter lentivirus worden elders besproken17,18. ....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Resultaten

Met behulp van het hierboven beschreven protocol zijn ongeveer 0,8-1,0 x 108 beenmergcellen per muis verkregen. Het aantal Lineage-negatieve cellen die we verkrijgen is ongeveer 3 x 106 cellen per muis. Typisch, de opbrengst van beenmerg Lineage-negatieve cellen is 4%-5% van die van totale beenmerg kern cellen.

Het chimerisme van getransduceerde cellen (RFP-positief) wordt geëvalueerd door Flowcytometrie va.......

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Discussie

Het voordeel van dit protocol is de creatie van diermodellen die specifieke mutaties in hematopoietische cellen in een snelle en zeer kosteneffectieve manier verteren in vergelijking met conventionele muis transgene benaderingen. Bleek dat deze methodologie maakt het genereren van muizen met hematopoietische cel gen-manipulaties binnen 1 maand. Er zijn verschillende kritieke stappen in dit protocol die verder moeten worden overwogen.

Screening van de gRNA-sequentie

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Openbaarmakingen

De auteurs hebben niets te onthullen.

Dankbetuigingen

S. S. werd gesteund door een Amerikaanse hart vereniging Postdoctoral Fellowship 17POST33670076. K. W. werd ondersteund door NIH subsidies R01 HL138014, R01 HL141256, en R01 HL139819.

....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Materialen

Lijst van materialen gebruikt in dit artikel
NaamBedrijfCatalogusnummerOpmerkingen
RPMI Medium 1640 (1X)Gibco11875-093Medium
Sulfamethoxazole and Trimethoprim injectionTEVA0703-9526-01
1/2 cc LO-DOSE INSULIN SYRINGEEXELINT26028algemeen benodigd
293T cellsATCCCRL-3216--Cell line
APC-anti-mouse Ly6C (Clone AL-21)BD Biosciences560599Antilichamen
APC-Cy7-anti-muis CD45R (RA3-6B2)BD Biosciences552094Antilichamen
BD Luer-Lok wegwerpspuiten, 10 mlBD309604algemeen benodigd
BD Microtainer bloedafnamebuisjes, K2EDTA toegevoegdBD Bioscience365974algemeen benodigd
BD Precisionglide naald, 18 GBD305195algemeen benodigd
BD Precisionglide naald, 22 GBD305155algemeen benodigd
BV510-anti-muis CD8a (Clone 53-6.7)Biolegend100752Antilichamen
BV711-anti-muis CD3e (Clone 145-2C11)Biolegend100349Antilichamen
KalfshuidcollenSigma-Aldrich9007-34-5algemeen benodigd
Corning Costar Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate, 6 wellMillipore SigmaCLS3471algemeen benodigd
CRISPR/Cas9 knock-in muizenThe Jackson Laboratory028555muis
DietGel 76AClear H2O70-01-5022algemeen benodigd
Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM) - hoge glucoseSigma AldrichD6429Medium
eBioscience 1X RBC Lysis BufferThermo fisher Scientific00-4333-57Oplossing
Falcon 100 mm TC-behandelde celkwekerLife Sciences353003algemeen benodigd
Falcon 5 mL ronde bodem polystyreen testbuisLife Sciences352054algemeen benodigd
Falcon 50 mL KegelcentrifugebuizenFisher Scientific352098algemeen benodigd
Falcon 6 Well Clear Flat Bodem TC-behandelde Multiwell Celkweker PlateLife Science353046algemeen benodigd
Fisherbrand microhematocrit capillaire buisjesThermo Fisher Scientific22-362566algemeen benodigd
Fisherbrand steriele celstrainers, 70 μmFisher Scientific22363548algemeen benodigd
FITC-anti-muis CD4 (Clone RM4-5)Invitrogen11-0042-85Antilichamen
Fixatie BufferBD Bioscience554655Oplossing
Guide-it Compete sgRNA Screening SystemsClontech632636Kit
Isothesia (Isoflurane) oplossingHenry Schein29404Oplossing
Lenti-X qRT-PCR Titratie KitTakara631235Kit
Lineage Cell Depletion Kit, muisMiltenyi Biotec130-090-858Kit
Millex-HV Spuitfilter Unit, 0.45 mmMillipore SigmaSLHV004SLalgemeen benodigd
PBS pH7.4 (1X)Gibco10010023Oplossing
PE-Cy7-anti-muis CD115 (Clone AFS98)eBioscience25-1152-82Antilichamen
PEI MAXPolysciences24765-1Oplossing
Penicillin-Streptomycin MixtuurLonza17-602FOplossing
PerCP-Cy5.5-anti-muis Ly6G (Clone 1A8)BD Biosciences560602Antilichamen
pLKO5.sgRNA.EFS.tRFPAddgene57823Plasmid
pMG2DAddgene12259Plasmid
Polybrene Infectie/TransfectiereagensSigma AldrichTR-1003-GOplossing
Polypropyleen CentrifugebuizenBECKMAN COULTER326823algemeen benodigd
psPAX2Addgene12260Plasmid
RadDisk – Muis Irradiator DiskBraintree ScientificIRD-P Malgemeen benodigd
Recombinant Muur SCFPeprotech250-03Oplossing
Recombinant Muur TPOPeprotech315-14Oplossing
StemSpan SFEMSTEMCELL Technologies09600Oplossing
TOPO TA cloning kit voor sequencing met One Shot TOP10 Chemisch Competente E.coliThermo fisher ScientificK457501Kit
Zombie Aqua Fixable Viability KitBioLegend423102Oplossing

Referenties

  1. Sasaki, Y., et al. Defective immune responses in mice lacking LUBAC-mediated linear ubiquitination in B cells. EMBO Journal. 32, 2463-2476 (2013).
  2. Ogilvy, S., et al. Transcriptional regulation of vav, a gene expressed thro....

Toegang beperkt. Log in of start een proefperiode om deze inhoud te bekijken.

Herprints en machtigingen

Meer artikelen verkennen

Hematopoëtische stamcellenflowcytometriebeenmergtransplantatielineage-negatieve cellenRFP-reportergenvirale tittermetinganalyse van perifeer bloedgenomische DNA PCR