Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Medicine

Met behulp van een chemische biopsie voor Graft Quality Assessment

Published: June 17, 2020 doi: 10.3791/60946
* These authors contributed equally

ERRATUM NOTICE

Summary

Het protocol presenteert het gebruik van de chemische biopsie aanpak gevolgd door uitgebreide metabolomic en lipidomische analyse voor de kwaliteit van de beoordeling van niertransplantaties toegewezen voor transplantatie.

Abstract

Niertransplantatie is een levensreddende behandeling voor een groot aantal mensen met een eindstadium nierdisfunctie wereldwijd. De procedure wordt geassocieerd met een verhoogde overlevingskans en een grotere kwaliteit van het leven van de patiënt in vergelijking met conventionele dialyse. Helaas lijdt de transplantatieologie aan een gebrek aan betrouwbare methoden voor de beoordeling van de orgaankwaliteit. Standaard diagnostische technieken zijn beperkt tot macroscopische verschijning inspectie of invasieve weefselbiopsie, die geen uitgebreide informatie over de graft. Het voorgestelde protocol heeft tot doel vaste fasemicroextractie (SPME) in te voeren als een ideale analysemethode voor uitgebreide metabolomics en lipidomische analyse van alle laagmoleculaire verbindingen die aanwezig zijn in nieren die voor transplantatie zijn toegewezen. De kleine omvang van de SPME-sonde maakt de uitvoering van een chemische biopsie mogelijk, waardoor metabolieten rechtstreeks uit het orgaan kunnen worden verwijderd zonder dat er weefsel wordt verzameld. De minimale invasieve werking van de methode maakt het mogelijk om meerdere analyses in de loop van de tijd uit te voeren: direct na het oogsten van organen, tijdens het behoud ervan en onmiddellijk na revascularisatie op het lichaam van de ontvanger. Het wordt verondersteld dat de combinatie van deze nieuwe bemonsteringsmethode met een massaspectrometer met hoge resolutie discriminatie mogelijk zal maken van een reeks karakteristieke verbindingen die kunnen dienen als biologische markers van graftkwaliteit en indicatoren van mogelijke ontwikkeling van orgaandisfunctie.

Introduction

Volgens het United States' Organ Procurement and Transplantation Network waren er in 2019 94.756 patiënten die in de VS op niertransplantaties wachtten; in Europa in 2018 waren dat er 10.791. Elke tien minuten, iemand wordt toegevoegd aan de nationale transplantatie wachtlijst in de VS, en er wordt geschat dat 20 mensen sterven elke dag te wachten op eentransplantatie 1,2. Niertransplantatie is een levensreddende behandeling voor een groot aantal mensen die lijden aan eindstadium nierdisfunctie wereldwijd. De procedure wordt geassocieerd met een verhoogde overlevingskans en een grotere kwaliteit van leven in vergelijking met conventionele dialyse.

Transplantatie kampt echter met veel ernstige problemen, zoals een tekort aan organen of het ontbreken van effectieve instrumenten voor de beoordeling van de orgaankwaliteit. De standaardprotocollen zijn beperkt tot macroscopische verschijningsinspectie of invasieve weefselbiopsie, die geen uitgebreide informatie geven over de kwaliteit van het transplantaat. Terwijl een visuele beoordeling zorgt voor identificatie van tumoren zichtbaar voor het oog, anatomische afwijkingen, of uitgebreide schade aan de grafts, deze aanpak is zeer subjectief, variërend in de effectiviteit ervan volgens de ervaring van de waarnemers. Biopsie, aan de andere kant, kan waardevolle informatie over reeds bestaande nieraandoeningen, en wordt dus beschouwd als een methode van objectieve en bewezen waarde bij het bepalen van graft resultaten. Echter, de biopsie procedure is niet vrij van gebreken; er is het risico van mogelijke complicaties zoals bloeden en een extra 4-5 uur monstervoorbereiding is vereist, wat de koude ischemische tijd aanzienlijk verlengt. Daarom is vooral in Europa het gebruik van directe weefselanalyse beperkt tot uitgebreide criteria donoren (ECD) en donoren na het overlijden van de bloedsomloop (DCD)3,4.

Metabolomics en lipidomics zijn onlangs erkend als veelbelovende benaderingen voor het bereiken van een beter begrip van de veranderingen in biochemische trajecten die zich voordoen tijdens orgaanbehoud. Metabolomic en lipidomic profilering maakt het mogelijk om onmiddellijke reacties van het systeem op plotselinge veranderingen in het milieu in verband met orgaanverwijdering met latere gevolgen: ischemie, oxidatieve stress of ontstekingsreacties5,6,7,8. De nier is een orgaan dat grotendeels wordt geassocieerd met metabole processen, dus metingen van metabolieten en lipiden concentraties kunnen het mogelijk maken identificatie van potentiële orgaankwaliteit biomarkers en maken betere voorspellingen van graft resultaat.

Gezien de bovenstaande complicaties en beperkingen in verband met de huidige orgaankwaliteitsbeoordelingsmethoden, is een minder invasieve diagnostische oplossing nodig voor een snelle en complexe orgaankwaliteitsbeoordeling. Solid phase microextraction (SPME) voldoet aan deze eisen als een minimaal invasieve analytische methode die dekking van een breed spectrum van metabolieten en lipiden mogelijk maakt. De techniek is gebaseerd op het inbrengen van een dunne (~ 200 μm), biocompatibele, titanium-nikkel legering sonde bedekt met een selectieve extractie fase in het onderzochte orgaan voor een korte tijd. Er moet worden benadrukt dat SPME eiwitextractie voorkomt en dus al in het stadium van de monsterverzameling een metabolismeremming mogelijk maakt, wat een aanzienlijk voordeel is ten opzichte van alternatieve methoden. Bovendien maakt de miniaturisatie van het apparaat het mogelijk om repetitieve en gelijktijdige analyses uit te voeren van enkele structuren van het orgel9,10,11.

Protocol

Alle dieren kregen humane zorg in overeenstemming met de ''Principles of Laboratory Animal Care'' geformuleerd door de National Society for Medical Research en de ''Guide for the Care of Laboratory Animals'' gepubliceerd door het National Institute of Health, Ontario, Canada. De Animal Care Committee van de Toronto General Research Institute goedgekeurd alle studies. Het onderzoek waarbij menselijke proefpersonen betrokken waren, werd goedgekeurd door het Bioethisch Comité van Collegium Medicum in Bydgoszcz Nicolaus Copernicus University in Torun.

LET OP: Verkrijg goedkeuring van de juiste ethische borden. Vergeet niet om altijd veiligheidshandschoenen te dragen. Raak de extractiefase van SPME-sondes niet aan. Het gebruik van gedeactiveerde glazen flacons wordt aanbevolen voor lipidomische analyses.

1. Voorbereiding van sondes

  1. Bereid de sondes van de legering van titanium en nikkel (40 mm lengte; 0,2 mm diameter) met 7 mm sorbent in de mengmodus. Het aantal sondes is afhankelijk van de tijdstippen die tijdens de hele procedure zijn gericht en het aantal replica's (3 wordt aanbevolen per tijdpunt).
    OPMERKING: De lengte en het type extractiefase kunnen worden aangepast op basis van de wijze van studie, de polariteit van metabolieten en de monstermatrix.
  2. Bereid een reinigingsmengsel bestaande uit 2:1 chloroform:methanol (v/v). Pipet 1.0 mL van de oplossing voor elke 2,0 mL glazen flacon en plaats een sonde, eerder doorboord door de dop, in elke flacon.
    OPMERKING: Reinig voor gebruik alle sondes om vervuilende deeltjes te verwijderen.
  3. Zet de flacons op de roerganger en zet de agitatiesnelheid op 1.200 rpm. Na 45 minuten stopt u het apparaat en spoel de coatings af met water van LC-MS-kwaliteit.
  4. Aangezien coatings een voorconditionerende stap moeten ondergaan om ze te activeren, bereidt u een conditioneringsmengsel dat bestaat uit 1:1 methanol:water (v/v). Pipet 1.0 mL van de oplossing voor elke 2,0 mL glazen flacon en plaats een sonde, eerder doorboord door de dop, in elke flacon.
  5. Zet de flacons op de vortex agitator en zet de agitatie snelheid op 1.200 rpm.
  6. Na 60 min, stop de roerganger en spoel de coatings met LC-MS grade water.
  7. Steriliseren sondes volgens de standaard chirurgische apparatuur sterilisatie protocol.

2. Extractie

  1. Open de steriele verpakking vlak voor de bemonstering om een steriele omgeving te garanderen.
  2. Steek twee sondes direct in de nierschors gedurende 10 minuten op elk tijdstip. De volledige lengte van de coating moet door de weefselmatrix worden afgedekt; er is geen specifieke hoek nodig, maar meestal wordt ca. 90 deg gebruikt.
    LET OP: De volledige medische procedure volgt standaardprotocollen in bepaalde instelling. Er wordt geen wijziging met betrekking tot spme-bemonstering overwogen. De procedure omvat de zes volgende bemonsteringstijdpunten:
    a) vóór de resectie van de nieren, in vivo van donor;
    b)-e) na 1 uur, 3 uur, 5 uur, 7 uur nierperfusie, ex vivo in orgaankamer;
    f) na reperfusie, in vivo van de ontvanger.
  3. Trek de sondes in door het uit het weefsel te trekken en spoel vervolgens coatings met LC-MS-kwaliteit water om het resterende bloed van het coatingoppervlak te halen. Spoel weg van de chirurgische plaats, en onmiddellijk na verwijdering van de sondes.

3. Vervoer en opslag

  1. Plaats sondes in aparte flesjes en sluit ze.
  2. Plaats flesjes in een piepschuim doos gevuld met droog ijs of in vloeibare stikstof voor transport.
  3. Bewaar monsters in een vriezer (-80 °C), of onmiddellijk beginnen met de desorptie stap.

4. Desorptie

  1. Bereid desorptieoplossingen voor bestaande uit 80:20 acetonitril:water (v/v) voor metabolomic analyse en 1:1 isopropanol:methanol (v/v) voor lipidomische analyse.
  2. Pipet 100 μL van de oplossing voor inserts geplaatst in 2,0 mL gelabelde flesjes en plaats een sonde, eerder doorboord door de dop, in elke flacon.
  3. Zet de flacons op de vortex agitator en zet de agitatie snelheid op 1.200 rpm voor 120 min.
  4. Verwijder sondes uit de flesjes. Verkregen extracten zijn nu klaar voor instrumentele analyse.

5. LC-MS analyse

  1. Plaats flacons met extracten in de autosampler van het LC-MS systeem.
    OPMERKING: Vloeibare chromatografie (RP, HILIC) in combinatie met hoge resolutie massaspectrometrie en een orbitrap massa analyzer werden gebruikt voor deze studie. Voor metabolomic analyse parameters, ga naar stap 5.2. Voor lipidomic analyse parameters, ga naar stap 5.6.
  2. Gebruik een pentafluorophenyl (PFP) kolom (2,1 mm x 100 mm, 3 μm) voor omgekeerde fasescheiding.
    1. Stel de stroomsnelheid in op 300 μL/min en de temperatuur van de automatische versterker en kolom op respectievelijk 4 °C en 25 °C.
    2. Bereid mobiele fasen voor volgens de volgende verhoudingen: mobiele fase A: water:mierenzuur (99.9:0.1, v/v) en mobiele fase B: acetonitril:mierenzuur (99.9:0.1, v/v). Stel de mobiele fasestroom in volgens de volgende parameters: start van de mobiele fasestroom (0-3 min): 100% A gevolgd door een lineair verloop naar 10% A (3-25 min), eindigend met isocratische stroom van 10% A tot 34 min, gevolgd door 6 minuten kolomre-evenwichtstijd.
  3. Gebruik voor HILIC-scheiding een HILIC-kolom (2,0 mm x 100 mm, 3 μm, 200A). Stel de stroomsnelheid in op 400 μL/min.
    1. Bereid mobiele fasen voor volgens de volgende verhoudingen: mobiele fase A: acetonitril:ammoniumacetaatbuffer (9:1, v/v, effectieve zoutconcentratie 20 mM), mobiele fase B: acetonitrile:ammoniumacetaatbuffer (1:1, v/v, effectieve zoutconcentratie 20 mM).
    2. Stel de mobiele fasestroom in volgens de volgende parameters: start de mobiele fasestroom (0-3 min) op 100% A, houd 3,0 min vast en raap vervolgens binnen 5 minuten op naar 100% B. Houd met 100% B tot 12 min, gevolgd door 8 min kolom re-evenwicht tijd.
  4. Stel het scanbereik in op 85-1000 m/z. Stel HESI ionenbronparameters in positieve ionisatiemodus in op: sproeispanning 1.500 V, capillaire temperatuur 300 °C, schedegas 40 a.u., aux gas flow rate 15 a.u., probe heater temperature 300 °C, S-Lens RF level 55%.
  5. Voer QC-monsters uit die bestaan uit 10 μL van elk geanalyseerd monster (regelmatig, elke 10-12 monsters) om de prestaties van het instrument te controleren.
  6. Gebruik voor omgekeerde fasescheiding een C18-kolom (2,1 mm x 75 mm, 3,5 μm).
    1. Stel de stroomsnelheid in op 200 μL/min en de temperatuur van de automatische versterker en kolom op respectievelijk 4 °C en 55 °C. Bereid mobiele fasen voor volgens de volgende verhoudingen: mobiele fase A: H2O:MeOH (60:40, v/v), 10 mM ammoniumacetaat en 1 mM azijnzuur; mobiele fase B: IPA:MeOH (90:10, v/v), 10 mM ammoniumacetaat en 1 mM azijnzuur.
    2. Stel de mobiele fasestroom in volgens de volgende parameters: 0-1 min (20% B), 1-1,5 min (20-50% B), 1,5-7,5 min (50-70% B), 7,55-13 min (70-95% B), 13-17 min (95% B), 17-17,1 min (95-20% B), 17,1-23 min (20%).
  7. Gebruik voor HILIC-scheiding een HILIC-kolom (100 x 2,1 mm, 3 μm).
    1. Stel de stroomsnelheid in op 400 μL/min en de temperatuur van de automatische versterker en kolom op respectievelijk 4 °C en 40 °C.
    2. Bereid mobiele fasen voor volgens de volgende verhoudingen: mobiele fase A: ACN; mobiele fase B: 5 mM ammoniumacetaat in water. Stel de mobiele fasestroom in volgens de volgende parameters: 0-2 min (96% B), 2-15 min (96-80% B), 15-15,1 min (80-96% B), 15,1-21 min (96% B).
  8. Stel HESI ionenbronparameters in positieve ionisatiemodus in op sprayspanning 3.500 V, capillaire temperatuur 275 °C, schedegas 20 a.u., aux gas flow rate 10 a.u., probe heater temperatuur 300 °C, S-Lens RF niveau 55%.
  9. Voer QC-monsters uit die bestaan uit 10 μL van elk geanalyseerd monster (elke 10-12 monsters) om de prestaties van het instrument te controleren.
  10. Gegevensverwerving uitvoeren in software die compatibel is met het instrument.

6. Gegevensanalyse

  1. Voer gegevensverwerking, vermeende identificatie en statistische analyse uit met behulp van software die is gewijd aan ongerichte metabolomics en lipidomics-analyse.
    OPMERKING: De belangrijkste componentenanalyse (PCA) en box-whisker plots kunnen worden verkregen om de gegevensstructuur te visualiseren.

Representative Results

De monsterverzameling werd uitgevoerd volgens de hierboven beschreven SPME-methode, met behulp van sondes die zijn bekleed met een extractiefase in gemengde modus van 7 mm. De bemonstering werd rechtstreeks uitgevoerd vanuit het transplantaatweefsel (in vivo vóór transplantatie), ex vivo in de nierkamer na 1 uur, 3 uur, 5 uur en 7 uur perfusie, en in vivo na revascularisatie bij de ontvanger. Ongerichte metabolische en lipidomische analyses werden uitgevoerd met het gebruik van vloeibare chromatografie (RP, HILIC) in combinatie met hoge resolutie massaspectrometrie, met de massaanalysator in positieve ionisatiemodus. Om de kwaliteit van de gegevens te beoordelen en algemene inzichten te verkrijgen met betrekking tot de resultaten, werden de gegevens onderworpen aan principal component analysis (PCA). Zoals blijkt uit figuur 1,vormden QC-monsters een strak cluster, wat de kwaliteit van de analyses bevestigde. De bestudeerde groepen vertonen een relatief goede scheiding, waardoor de verschillen in metabole en lipidomische profielen voor en na transplantatie kunnen worden gevisualiseerd, evenals tijdens orgaanperfusie(figuur 2). SPME-bemonstering maakt metabolische profilering van het orgaan na verloop van tijd mogelijk. Box-whisker percelen van geselecteerde metabolieten dienen om veranderingen in metaboliet niveaus te illustreren gedurende het hele experiment (Figuur 3). Het brede spectrum van geëxtraheerde kenmerken gescheiden op zowel RP- als HILIC-kolommen wordt weergegeven in figuur 4.

Figure 1
Figuur 1: Principal component analyse met clustering van kwaliteitscontrole monsters voor metabolomic reversed-fase (A), HILIC (B) en lipidomic reversed-phase (C), HILIC (D) analyses. De kwaliteitscontrole is noodzakelijk in ongerichte analyse om eventuele veranderingen veroorzaakt door instrumentele instabiliteit te controleren. Strakke cluster van QC monsters zorgt ervoor dat alle waargenomen veranderingen van biologische oorsprong zijn. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figure 2
Figuur 2: Hoofdcomponentanalyse waaruit metabolomic (A) en lipidomische (B) verschillen tussen bepaalde bemonsteringspunten blijkt. Ongerichte profilering van nieren met SPME-LC-HRMS maakt het mogelijk om biochemische verschillen in organen te observeren in latere stappen van hun bewaring. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figure 3
Figuur 3: Box-whisker percelen van geselecteerde verbindingen met veranderingen in metabolieten (A, B) en lipiden (C, D) tijdens de peritransplantperiode. Na de selectie en identificatie van discriminerende verbindingen box-snorharen percelen maakt het mogelijk om veranderingen in de niveaus van deze verbindingen te controleren in latere stappen van het protocol en vergelijk de metabolieten niveaus in organen onderworpen aan verschillende behoud protocollen of geoogst van verschillende donoren bijvoorbeeld hartkloteren donoren of donoren na hartdood. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Figure 4
Figuur 4: Ionenkaart (m/z versus retentietijd) van functies verkregen door LC-MS analyse met (A) omgekeerde fase en (B) HILIC scheiding. Het perceel maakt het mogelijk om het totale aantal functies verkregen met het voorgestelde protocol (van extractie tot detectie) te schatten en analytdekking te beoordelen op basis van de polariteit. Klik hier om een grotere versie van dit cijfer te bekijken.

Discussion

Evaluatie van de orgaankwaliteit blijft een grote uitdaging voor artsen, die snel geïnformeerde beslissingen moeten nemen over de vraag of een bepaald orgaan levensvatbaar is voor transplantatie of dat het moet worden weggegooid. Meerdere factoren, zoals donorleeftijd, duur van ischemie en infecties en ontstekingsprocessen, kunnen de uiteindelijke uitkomst van de enting op lange termijn beïnvloeden. Hoewel tot op heden diverse methoden zijn ontwikkeld om de nieraltograftfunctie te diagnosticeren, blijft histopathologische inspectie de gouden standaard in die kwestie3,4,12. Hoewel de biopsieprocedure aanzienlijke informatie kan opleveren over reeds bestaande donorziekte en vasculaire veranderingen, is het niet vrij van gebreken. Bemonsteringsfouten in verband met interobservervariabiliteit en bemonstering van onvoldoende glomeruli voor uitgebreide informatie over de orgaanfunctie blijven in dit verband typische zorgen. Bovendien brengt de bereiding van specimen een aantal kwesties met zich mee, zoals een onvolledige beoordeling van het transplantaat in geval van bevroren delen, en verlenging van de proceduretijd voor paraffinesectie. Het verhoogde risico op bloedingen, die acuut kan lijken als microscopisch of grove hematurie, is echter de belangrijkste levensbedreigende complicatie die verband houdt met de biopsieprocedure. Om deze reden is het aantal toegestane biopten strikt beperkt in transplantatieprocedures, een factor die het vastleggen van dynamische veranderingen en tijdreeksanalyses via deze methode12,13,14belemmert . De voordelen van een histologische analyse moeten worden afgewogen tegen de risico's die aan de methodologie verbonden zijn. De waarde van histologische bevindingen staat buiten kijf, maar ze verklaren de moleculaire mechanismen van de afwijkingen niet.

Metabolomics en lipidomics zijn de jongste domeinen van de "-omics" wetenschappelijke familie. De volledige set van lage moleculaire (<1,200 Da) menselijke metabolieten en lipiden verbonden binnen een metabolisch netwerk wordt gedefinieerd als een menselijke metabolome. Het genoom blijft gedurende zijn hele levensduur relatief constant, met lichte wijzigingen veroorzaakt door mutaties die zelden voorkomen. De metabolome is het product van genexpressie, dat zeer gevoelig is voor veranderingen in alle biologische processen en omgevingsfactoren. Het dynamische karakter van metabolieten en lipiden maakt ze perfecte indicatoren van de huidige orgaanconditie7,8,15,16. De SPME-methode die in het bovengenoemde protocol wordt voorgesteld, maakt het mogelijk om veranderingen in het orgaan tijdens het behoud ervan op te sporen, te beginnen met het verwijderen van organen uit het lichaam van de donor tot revascularisatie bij de ontvanger. De kleine diameter van de sonde (~ 200 μm) zorgt voor minimale invasieve werking en zorgt voor verschillende bemonsteringen van hetzelfde orgaan zonder schade aan het weefsel. Het uitvoeren van studies met behulp van nier, als de meest getransplanteerde orgaan, zorgt voor een beter begrip en verdere karakterisering van de metabole trajecten die verantwoordelijk zijn voor het afnemen van de kwaliteit en functie van grafts. De mogelijkheid van het monitoren van wijzigingen na verloop van tijd is zeker een belangrijk voordeel van de techniek in vergelijking met conventionele invasieve methoden zoals biopsie. De momenteel gepresenteerde analyse geïdentificeerd veranderde concentraties van verschillende groepen lipiden en metabolieten, met name van essentiële aminozuren, purines, purine nucleosides, en glycerophosfopiden. Deze resultaten komen overeen met eerdere weefselanalyserapporten5,6,17,18,19,20. Tot op heden zijn de meeste wetenschappelijke rapporten die gebruikmaken van metabolomics of lipidomics om processen te verklaren die complicaties veroorzaken na transplantatie of ischemie/reperfusieletsel (IRI) verschijnselen beperkt tot analyse van biofluïden21,22,23.

Elke klinische toepassing vereist optimalisatie van het bemonsteringsprotocol om ervoor te zorgen dat de prestaties van de analysemethode voldoen aan de verwachte criteria. In dit verband is het voordeel van het gebruik van SPME de mogelijkheid om de voorwaarden voor verschillende experimentele ontwerpen aan te passen. De verscheidenheid aan toegankelijke extractiefasen biedt een breed spectrum van geëxtraheerde metabolieten met gediversifieerde polariteiten. Tegelijkertijd kan dit worden beschouwd als een beperking van de methode vanwege het feit dat elke sorbent selectiviteit biedt ten opzichte van specifieke kenmerken en niet alle verbindingen in de monstermatrix extraheert. Opgemerkt moet worden dat SPME coatings alleen extraheren via vrije moleculen, en gewoon niet interageren met een gebonden fractie van de analyt. De biocompatibiliteit van de coatings introduceert geen toxiciteit in het weefsel, terwijl de extractie van grote moleculen zoals eiwitten wordt beperkt; als gevolg hiervan worden de enzymatische processen al in het stadium van monsterverzameling geremd en wordt de aanwezigheid van artefacten geminimaliseerd, wat een groot voordeel is ten opzichte van alternatieve bemonsteringsmethoden. De lengte van de coating beïnvloedt de efficiëntie van de extractie (d.w.z. de lengte van de coating wijst het oppervlak en het volume van de extractiefase aan); dus, langere coatings opleveren hogere terugvorderingen. Aan de andere kant zorgen kortere coatings voor een hogere ruimtelijke resolutie. Voor betrouwbare resultaten is het cruciaal om de sonde onder te dompelen op exact dezelfde diepte van de nierschors. Het te diep inbrengen veroorzaakt het risico om de nier medulla binnen te gaan. De tijd van de extractie is ook evenredig aan de extractie-efficiëntie. Daarom is de keuze van een optimale extractietijd een van de meest kritieke stappen in de ontwikkeling van SPME-methoden. De nauwkeurigheid van de tijdmeting biedt de hoogste herhaalbaarheid. In biologische toepassingen zoals die besproken, is er altijd een compromis tussen de gevoeligheid en herhaalbaarheid van het analytische protocol en de beperkingen van de medische procedure. Hoewel evenwichtsextractie de hoogste gevoeligheid biedt, worden om veiligheidsredenen vaak pre-evenwichtsvoorwaarden gebruikt in dergelijke toepassingen, omdat de extractietijd de totale duur van de operatie niet mag beïnvloeden. De efficiëntie van de desorptie wordt bepaald door het tijdstip van het proces en de samenstelling van het desorptieoplosmiddel, dat compatibel moet zijn met de mobiele fase die wordt gebruikt voor chromatografische scheiding9,10,11.

Een van de belangrijkste vereisten voor diagnostische instrumenten die worden gebruikt voor intrachirurgische beoordelingen is het tijdstip van analyse. De huidige pogingen worden gedaan om een snel instrument te ontwikkelen voor in vivo SPME-extractie die rechtstreeks via microfluïde open interface (MOI)24 of gecoate bladespray (CBS)25wordt gekoppeld aan een massaspectrometer. Dergelijke benaderingen zouden het mogelijk maken om analytische resultaten in reële of bijna realtime te onthullen. Het gebruik van dergelijke methoden voor pre-interventieanalyses van metabole en lipidomische profielen zou het besluitvormingsproces tijdens transplantatieprocedures kunnen verbeteren, waardoor de best mogelijke gepersonaliseerde aanpak en snelle respons in geval van orgaanfalen mogelijk worden.

Samengevat wordt verondersteld dat het voorgestelde protocol volledige metabolische en lipidomische profielen van niertransplantaten mogelijk zal maken, wat op zijn beurt een uitgebreide beoordeling van de kwaliteit van het orgaan en de karakterisering van de processen die verantwoordelijk zijn voor ischemie-reperfusieletsel zou bieden. De nieuwigheid van het project omvat het gebruik van solid-phase microextraction (SPME), het aanbieden van lage invasieve bemonstering van levende systemen, in combinatie met een van de meest innovatieve technologieën beschikbaar voor metabolomics en lipidomics analyse (bijvoorbeeld, de Orbitrap hoge resolutie massaspectrometer). SPME combineert het verzamelen, afzuiden en blussen van metabolieten in één stap, waardoor het een perfect hulpmiddel is voor snelle analyse. Er wordt verwacht dat dit protocol zal helpen bij het beantwoorden van vragen met betrekking tot wat pre-transplantatie voorwaarden van de nier verantwoordelijk zijn voor vertraagde orgaanfunctie of de disfuncties ervan na transplantatie, evenals hoe de graft behoud protocol beïnvloedt de biochemie van het orgaan. Dergelijke kennis zou niet alleen aanzienlijke gevolgen hebben voor de preventie van mogelijke complicaties in verband met transplantatie, maar kan ook bijdragen tot het verbeteren van de huidige protocollen voor het behoud van graft, waardoor het verlies van levensvatbaar transplantatieweefsel en het verlies van mensenlevens tot een minimum worden geminimaliseerd. De voorgestelde oplossing zal de deur openen voor verder onderzoek op dit gebied, met inbegrip van de validatie van specifieke potentiële biomarkers en verbetering van therapeutische resultaten in de transplantatie.

Disclosures

De auteurs willen MilliporeSigma (Merck KGaA, Darmstadt, Duitsland) erkennen voor het leveren van SPME-apparaten en Thermo Fisher Scientific voor toegang tot de Q-Exactive Focus Orbitrap massaspectrometer.

Acknowledgments

De studie werd ondersteund door subsidie Opus UMO-2017/27/B/NZ5/01013 van National Science Centre. De auteurs willen MilliporeSigma erkennen, een bedrijf van Merck KGaA, Darmstadt, Duitsland voor het leveren van SPME-apparaten. De life science business van Merck opereert als MilliporeSigma in de VS en Canada. Ook willen de auteurs Thermo Fisher Scientific bedanken voor de toegang tot Q-Exactive Focus orbitrap massaspectrometer. De auteurs willen dr. Aleksandra Woderska-Jasińska en het personeel van de afdeling Transplantatieologie en Algemene Chirurgie in Bydgoszcz bedanken voor hun vriendelijke hulp bij het project. BB wil prof. Janusz Pawliszyn bedanken voor de mogelijkheid van monstercollectie in toronto General Hospital tijdens haar verblijf aan de Universiteit van Waterloo.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Acetic acid Merck 5330010050 Mobile phase additive
Acetonitrile Alchem 696-34967-4X2.5L HPLC solvent
Ammonium acetate Merck 5330040050 Mobile phase additive
BENCHMIXER XL MULTI-TUBE VORTEXER Benchmark Scientific BV1010 Vortex mixer
Caps Perlan Technologies 5183-2076 Blue scrw tp, pre-slit PTFE/Si spta, 100PK
Chloroform Merck 1024441000
Discovery HS F5 Supelguard Cartridge, 3 μm, L × I.D. 2 cm × 2.1 mm Merck 567570-U HPLC guard column
Discovery HS F5, 2.1 mm x 100 mm, 3 μm Merck 567502-U HPLC column
Formic acid Alchem 497-94318-50ML Mobile phase additive
Glass vials Perlan Technologies 5182-0714
HILIC Luna 3 μm, 200A, 100 x 2.0 mm Shim-Pol PHX-00D-4449-B0 HPLC column
HILIC SecurityGuard Cartridge, 3 μm, 4 x 2.0 mm Shim-Pol PHX-AJ0-8328 HPLC guard column
Isopropanol Alchem 231-AL03262500 HPLC solvent
Methanol Alchem 696-34966-4X2.5L HPLC solvent
Nano-pure water Merck 1037281002 HPLC solvent
Q Exactive Focus hybrid quadrupole-Orbitrap MS Thermo Scientific Q Exactive Focus Mass Spectrometer
SeQuant ZIC-cHILIC 3µm,100Å 100 x 2.1 mm Merck 1506570001 HPLC column
SeQuant ZIC-HILIC Guard Kit 20 x 2.1 mm Merck 1504360001 HPLC guard column
SPME LC fiber probes, mixed mode Supelco prototype fibers
UltiMate 3000 HPLC systems Thermo Scientific UltiMate 3000 HPLC system
Vial inserts (deactivated) Perlan Technologies 5181-8872
XSelect CSH C18 3.5μm 2.1x75mm Waters 186005644 HPLC column
XSelect CSH C18 VanGuard Cartridge 3.5μm, 2.1x5mm Waters 186007811 HPLC guard column

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. U.S. Department of Health & Human Services. Organ Procurement and Transplantation Network. , Available from: https://optn.transplant.hrsa.gov (2019).
  2. Branger, P., Undine, S. Annual Report 2018/Eurotransplant International Foundation. , Eurotransplant Foundation. Leiden. (2018).
  3. Dare, A. J., Pettigrew, G. J., Saeb-Parsy, K. Preoperative assessment of the deceased-donor kidney: From macroscopic appearance to molecular biomarkers. Transplantation. 97, 797-807 (2014).
  4. Mueller, T. F., Solez, K., Mas, V. Assessment of kidney organ quality and prediction of outcome at time of transplantation. Seminars in Immunopathology. 33, 185-199 (2011).
  5. Xu, J., et al. Lipidomics comparing DCD and DBD liver allografts uncovers lysophospholipids elevated in recipients undergoing early allograft dysfunction. Scientific Reports. 5, 1-10 (2015).
  6. Rao, S., et al. Early lipid changes in acute kidney injury using SWATH lipidomics coupled with MALDI tissue imaging. American Journal of Physiology - Renal Physiology. 310, 1136-1147 (2016).
  7. Wishart, D. S. Metabolomics: The principles and potential applications to transplantation. American Journal of Transplantation. 5, 2814-2820 (2005).
  8. Kim, S. J., Kim, S. H., Kim, J. H., Hwang, S., Yoo, H. J. Understanding metabolomics in biomedical research. Endocrinology and Metabolism. 31, 7-16 (2016).
  9. Bojko, B., et al. Solid phase microextraction fills the gap in tissue sampling protocols. Analytica Chimica Acta. 803, 75-81 (2013).
  10. Filipiak, W., Bojko, B. SPME in clinical, pharmaceutical, and biotechnological research - How far are we from daily practice. TrAC - Trends in Analytical Chemistry. , 115-213 (2019).
  11. Bojko, B., et al. Low invasive in vivo tissue sampling for monitoring biomarkers and drugs during surgery. Laboratory Investigation. 94, 586-594 (2014).
  12. Ahmad, I. Biopsy of the transplanted kidney. Seminars in Interventional Radiology. 21, 275-281 (2004).
  13. Plattner, B. W., et al. Complications and adequacy of transplant kidney biopsies: A comparison of techniques. Journal of Vascular Access. 19, 291-296 (2018).
  14. Tapia-Canelas, C., et al. Complications associated with renal graft biopsy in transplant patients. Nefrologia. 34, 115-119 (2014).
  15. Afshinnia, F., et al. Lipidomics and Biomarker Discovery in Kidney Disease. Seminars in Nephrology. 38, 127-141 (2018).
  16. Zhao, Y. Y., Vaziri, N. D., Lin, R. C. Lipidomics: New insight into kidney disease. Advances in Clinical Chemistry. 68, 153-175 (2015).
  17. Kaminski, J., et al. Oxygen Consumption by Warm Ischemia-Injured Porcine Kidneys in Hypothermic Static and Machine Preservation. Journal of Surgical Research. 242, 78-86 (2019).
  18. Wijermars, L. G. M., et al. Defective postreperfusion metabolic recovery directly associates with incident delayed graft function. Kidney International. 90, 181-191 (2016).
  19. Huang, H., et al. Proteo-metabolomics reveals compensation between ischemic and non-injured contralateral kidneys after reperfusion. Scientific Reports. 8, 1-12 (2018).
  20. Solati, Z., Edel, A. L., Shang, Y., Karmin, O., Ravandi, A. Oxidized phosphatidylcholines are produced in renal ischemia reperfusion injury. PLoS One. 13, 1-24 (2018).
  21. Wishart, D. S. Metabolomics in monitoring kidney transplants. Current Opinion in Nephrology and Hypertension. 15, 637-642 (2006).
  22. Abbiss, H., Maker, G. L., Trengove, R. D. Metabolomics approaches for the diagnosis and understanding of kidney diseases. Metabolites. 9, (2019).
  23. Zhang, Z. H., et al. Metabolomics insights into chronic kidney disease and modulatory effect of rhubarb against tubulointerstitial fibrosis. Scientific Reports. 5, 1-17 (2015).
  24. Looby, N. T., et al. Solid phase microextraction coupled to mass spectrometry: Via a microfluidic open interface for rapid therapeutic drug monitoring. Analyst. 144, 3721-3728 (2019).
  25. Gómez-Ríos, G. A., Tascon, M., Pawliszyn, J. Coated blade spray: Shifting the paradigm of direct sample introduction to MS. Bioanalysis. 10, 257-271 (2018).

Tags

Geneeskunde transplantatie nier chemische biopsie metabolomic lipidomisch vaste fase microextractie (SPME) vloeibare chromatografie in combinatie met massaspectrometrie (LC-MS)

Erratum

Formal Correction: Erratum: Using a Chemical Biopsy for Graft Quality Assessment
Posted by JoVE Editors on 08/28/2020. Citeable Link.

An erratum was issued for: Using a Chemical Biopsy for Graft Quality Assessment. One of the affiliations was updated.

The third affiliation was updated from:

Department of Transplantation and General Surgery, University Hospital, University of Nicolaus Copernicus Torun"

to:

Department of Transplantology and General Surgery, Collegium Medicum in Bydgoszcz, Antoni Jurasz University Hospital No. 1 in Bydgoszcz, Nicolaus Copernicus University in Torun, Bydgoszcz, Poland

Met behulp van een chemische biopsie voor Graft Quality Assessment
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Stryjak, I., Warmuzińska, N.,More

Stryjak, I., Warmuzińska, N., Łuczykowski, K., Hamar, M., Urbanellis, P., Wojtal, E., Masztalerz, M., Selzner, M., Włodarczyk, Z., Bojko, B. Using a Chemical Biopsy for Graft Quality Assessment. J. Vis. Exp. (160), e60946, doi:10.3791/60946 (2020).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

PLAYLIST

  • Research • Medicine
    Estimation of Urinary Nanocrystals in Humans using Calcium Fluorophore Labeling and Nanoparticle Tracking Analysis
  • Research • Medicine
    Development and Evaluation of 3D-Printed Cardiovascular Phantoms for Interventional Planning and Training
  • Research • Medicine
    Human Fetal Blood Flow Quantification with Magnetic Resonance Imaging and Motion Compensation
  • Research • Medicine
    Digital Handwriting Analysis of Characters in Chinese Patients with Mild Cognitive Impairment
  • Research • Medicine
    Segmentation and Linear Measurement for Body Composition Analysis using Slice-O-Matic and Horos
  • Research • Medicine
    Magnetic Resonance Imaging of Multiple Sclerosis at 7.0 Tesla
  • Research • Medicine
    Real-Time Magnetic Resonance Guided Focused Ultrasound for Painful Bone Metastases
  • Research • Medicine
    Isolation of Viable Adipocytes and Stromal Vascular Fraction from Human Visceral Adipose Tissue Suitable for RNA Analysis and Macrophage Phenotyping
  • Research • Medicine
    Obtaining Quality Extended Field-of-View Ultrasound Images of Skeletal Muscle to Measure Muscle Fascicle Length
  • Research • Medicine
    Lung CT Segmentation to Identify Consolidations and Ground Glass Areas for Quantitative Assesment of SARS-CoV Pneumonia
  • Research • Medicine
    Electroretinogram Recording for Infants and Children under Anesthesia to Achieve Optimal Dark Adaptation and International Standards
  • Research • Medicine
    Measurement of Tissue Oxygenation Using Near-Infrared Spectroscopy in Patients Undergoing Hemodialysis
  • Research • Medicine
    Evaluation of Capnography Sampling Line Compatibility and Accuracy when Used with a Portable Capnography Monitor
  • Research • Medicine
    Simultaneous Laryngopharyngeal and Conventional Esophageal pH Monitoring
  • Research • Medicine
    Real-Time Monitoring of Neurocritical Patients with Diffuse Optical Spectroscopies
  • Research • Neuroscience
    Evaluating Postural Control and Lower-extremity Muscle Activation in Individuals with Chronic Ankle Instability
  • Research • Medicine
    Assessment of Dependence in Activities of Daily Living Among Older Patients in an Acute Care Unit
  • Research • Medicine
    Validated LC-MS/MS Panel for Quantifying 11 Drug-Resistant TB Medications in Small Hair Samples
  • Research • Medicine
    International Expert Consensus and Recommendations for Neonatal Pneumothorax Ultrasound Diagnosis and Ultrasound-guided Thoracentesis Procedure
  • Research • Biology
    A Finite Element Approach for Locating the Center of Resistance of Maxillary Teeth
  • Research • Medicine
    Lower Limb Biomechanical Analysis of Healthy Participants
  • Research • Neuroscience
    Assessing Early Stage Open-Angle Glaucoma in Patients by Isolated-Check Visual Evoked Potential
  • Research • Medicine
    Oral Health Assessment by Lay Personnel for Older Adults
  • Research • Medicine
    Determining and Controlling External Power Output During Regular Handrim Wheelchair Propulsion
  • Research • Medicine
    A Whole Body Dosimetry Protocol for Peptide-Receptor Radionuclide Therapy (PRRT): 2D Planar Image and Hybrid 2D+3D SPECT/CT Image Methods
  • Research • Medicine
    Measurement of Carotenoids in Perifovea using the Macular Pigment Reflectometer
  • Research • Medicine
    Assessment of Static Graviceptive Perception in the Roll-Plane using the Subjective Visual Vertical Paradigm
  • Research • Medicine
    Learning Modern Laryngeal Surgery in a Dissection Laboratory
  • Research • Medicine
    DIPLOMA Approach for Standardized Pathology Assessment of Distal Pancreatectomy Specimens
  • Research • Medicine
    A Computerized Functional Skills Assessment and Training Program Targeting Technology Based Everyday Functional Skills
  • Research • Medicine
    Imaging Features of Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease
  • Research • Medicine
    Integrating Augmented Reality Tools in Breast Cancer Related Lymphedema Prognostication and Diagnosis
  • Research • Medicine
    Ultrasonographic Assessment During Cardiopulmonary Resuscitation
  • Research • Medicine
    Measurement of the Hepatic Venous Pressure Gradient and Transjugular Liver Biopsy
  • Research • Medicine
    Patient Directed Recording of a Bipolar Three-Lead Electrocardiogram using a Smartwatch with ECG Function
  • Research • Medicine
    Traditional Trail Making Test Modified into Brand-new Assessment Tools: Digital and Walking Trail Making Test
  • Research • Medicine
    Use of Magnetic Resonance Imaging and Biopsy Data to Guide Sampling Procedures for Prostate Cancer Biobanking
  • Research • Medicine
    A Fluorescence-based Assay for Characterization and Quantification of Lipid Droplet Formation in Human Intestinal Organoids
  • Research • Medicine
    A Novel Non-invasive Method for the Detection of Elevated Intra-compartmental Pressures of the Leg
  • Research • Medicine
    Quantitative Mapping of Specific Ventilation in the Human Lung using Proton Magnetic Resonance Imaging and Oxygen as a Contrast Agent
  • Research • Neuroscience
    Portable Thermographic Screening for Detection of Acute Wallenberg's Syndrome
  • Research • Medicine
    Use of MRI-ultrasound Fusion to Achieve Targeted Prostate Biopsy
  • Research • Medicine
    Testing of all Six Semicircular Canals with Video Head Impulse Test Systems
  • Research • Medicine
    Protocol and Guidelines for Point-of-Care Lung Ultrasound in Diagnosing Neonatal Pulmonary Diseases Based on International Expert Consensus
  • Research • Neuroscience
    Bilateral Assessment of the Corticospinal Pathways of the Ankle Muscles Using Navigated Transcranial Magnetic Stimulation
  • Research • Medicine
    Targeting Gray Rami Communicantes in Selective Chemical Lumbar Sympathectomy
  • Research • Medicine
    Multi-Modal Home Sleep Monitoring in Older Adults
  • Research • Medicine
    Cardiac Magnetic Resonance for the Evaluation of Suspected Cardiac Thrombus: Conventional and Emerging Techniques
  • Research • Medicine
    Observational Study Protocol for Repeated Clinical Examination and Critical Care Ultrasonography Within the Simple Intensive Care Studies
  • Research • Medicine
    Measurements of Motor Function and Other Clinical Outcome Parameters in Ambulant Children with Duchenne Muscular Dystrophy
  • Research • Medicine
    Assessment of the Efficacy of An Osteopathic Treatment in Infants with Biomechanical Impairments to Suckling
  • Research • Medicine
    Quantification of Levator Ani Hiatus Enlargement by Magnetic Resonance Imaging in Males and Females with Pelvic Organ Prolapse
  • Research • Medicine
    Quantitative [18F]-Naf-PET-MRI Analysis for the Evaluation of Dynamic Bone Turnover in a Patient with Facetogenic Low Back Pain
  • Research • Medicine
    Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures (3D-LTCs) for Disease Modeling
  • Research • Medicine
    Proton Therapy Delivery and Its Clinical Application in Select Solid Tumor Malignancies
  • Research • Medicine
    Combining Volumetric Capnography And Barometric Plethysmography To Measure The Lung Structure-function Relationship
  • Research • Medicine
    Two-Dimensional X-Ray Angiography to Examine Fine Vascular Structure Using a Silicone Rubber Injection Compound
  • Research • Medicine
    Preparation, Procedures and Evaluation of Platelet-Rich Plasma Injection in the Treatment of Knee Osteoarthritis
  • Research • Medicine
    Cardiac Magnetic Resonance Imaging at 7 Tesla
  • Research • Medicine
    Semi-quantitative Assessment Using [18F]FDG Tracer in Patients with Severe Brain Injury
  • Research • Medicine
    Handheld Metal Detector Screening for Metallic Foreign Body Ingestion in Children
  • Research • Medicine
    Conducting Maximal and Submaximal Endurance Exercise Testing to Measure Physiological and Biological Responses to Acute Exercise in Humans
  • Research • Medicine
    A Metadata Extraction Approach for Clinical Case Reports to Enable Advanced Understanding of Biomedical Concepts
  • Research • Medicine
    Autonomic Function Following Concussion in Youth Athletes: An Exploration of Heart Rate Variability Using 24-hour Recording Methodology
  • Research • Medicine
    Hydra, a Computer-Based Platform for Aiding Clinicians in Cardiovascular Analysis and Diagnosis
  • Research • Medicine
    Objective Nociceptive Assessment in Ventilated ICU Patients: A Feasibility Study Using Pupillometry and the Nociceptive Flexion Reflex
  • Research • Medicine
    'Boden Food Plate': Novel Interactive Web-based Method for the Assessment of Dietary Intake
  • Research • Medicine
    Anogenital Distance and Perineal Measurements of the Pelvic Organ Prolapse (POP) Quantification System
  • Research • Medicine
    Bedside Ultrasound for Guiding Fluid Removal in Patients with Pulmonary Edema: The Reverse-FALLS Protocol
  • Research • Medicine
    Muscle Imbalances: Testing and Training Functional Eccentric Hamstring Strength in Athletic Populations
  • Research • Medicine
    Isolation of Primary Human Decidual Cells from the Fetal Membranes of Term Placentae
  • Research • Medicine
    Skeletal Muscle Neurovascular Coupling, Oxidative Capacity, and Microvascular Function with 'One Stop Shop' Near-infrared Spectroscopy
  • Research • Medicine
    Collecting Hair Samples for Hair Cortisol Analysis in African Americans
  • Research • Medicine
    In Vivo Morphometric Analysis of Human Cranial Nerves Using Magnetic Resonance Imaging in Menière's Disease Ears and Normal Hearing Ears
  • Research • Medicine
    Measuring the Carotid to Femoral Pulse Wave Velocity (Cf-PWV) to Evaluate Arterial Stiffness
  • Research • Medicine
    Standardized Measurement of Nasal Membrane Transepithelial Potential Difference (NPD)
  • Research • Medicine
    Taste Exam: A Brief and Validated Test
  • Research • Medicine
    Absorption of Nasal and Bronchial Fluids: Precision Sampling of the Human Respiratory Mucosa and Laboratory Processing of Samples
  • Research • Medicine
    Methodology for Sputum Induction and Laboratory Processing
  • Research • Medicine
    Electrophysiological Measurement of Noxious-evoked Brain Activity in Neonates Using a Flat-tip Probe Coupled to Electroencephalography
  • Research • Medicine
    A Detailed Protocol for Physiological Parameters Acquisition and Analysis in Neurosurgical Critical Patients
  • Research • Medicine
    Oral Biofilm Sampling for Microbiome Analysis in Healthy Children
  • Research • Medicine
    Using Retinal Imaging to Study Dementia
  • Research • Medicine
    Application of an Amplitude-integrated EEG Monitor (Cerebral Function Monitor) to Neonates
  • Research • Medicine
    3D Ultrasound Imaging: Fast and Cost-effective Morphometry of Musculoskeletal Tissue
  • Research • Medicine
    The 4-vessel Sampling Approach to Integrative Studies of Human Placental Physiology In Vivo
  • Research • Medicine
    A Component-resolved Diagnostic Approach for a Study on Grass Pollen Allergens in Chinese Southerners with Allergic Rhinitis and/or Asthma
  • Research • Medicine
    A Novel Method: Super-selective Adrenal Venous Sampling
  • Research • Medicine
    A Method for Quantifying Upper Limb Performance in Daily Life Using Accelerometers
  • Research • Medicine
    Non-invasive Assessments of Subjective and Objective Recovery Characteristics Following an Exhaustive Jump Protocol
  • Research • Medicine
    Experimental Protocol of a Three-minute, All-out Arm Crank Exercise Test in Spinal-cord Injured and Able-bodied Individuals
  • Research • Medicine
    Phosphorus-31 Magnetic Resonance Spectroscopy: A Tool for Measuring In Vivo Mitochondrial Oxidative Phosphorylation Capacity in Human Skeletal Muscle
  • Research • Medicine
    Assessment of Pulmonary Capillary Blood Volume, Membrane Diffusing Capacity, and Intrapulmonary Arteriovenous Anastomoses During Exercise
  • Research • Medicine
    Assessment of Child Anthropometry in a Large Epidemiologic Study
  • Research • Medicine
    Video Movement Analysis Using Smartphones (ViMAS): A Pilot Study
  • Research • Medicine
    Network Analysis of Foramen Ovale Electrode Recordings in Drug-resistant Temporal Lobe Epilepsy Patients
  • Research • Medicine
    A Model to Simulate Clinically Relevant Hypoxia in Humans
  • Research • Medicine
    Interictal High Frequency Oscillations Detected with Simultaneous Magnetoencephalography and Electroencephalography as Biomarker of Pediatric Epilepsy
  • Research • Medicine
    Induction and Assessment of Exertional Skeletal Muscle Damage in Humans
  • Research • Medicine
    A Detailed Protocol for Perspiration Monitoring Using a Novel, Small, Wireless Device
  • Research • Medicine
    Drug-Induced Sleep Endoscopy (DISE) with Target Controlled Infusion (TCI) and Bispectral Analysis in Obstructive Sleep Apnea
  • Research • Medicine
    Integrated Compensatory Responses in a Human Model of Hemorrhage
  • Research • Medicine
    Transthoracic Speckle Tracking Echocardiography for the Quantitative Assessment of Left Ventricular Myocardial Deformation
  • Research • Medicine
    Impression Cytology of the Lid Wiper Area
  • Research • Behavior
    A Protocol of Manual Tests to Measure Sensation and Pain in Humans
  • Research • Medicine
    Unbiased Deep Sequencing of RNA Viruses from Clinical Samples
  • Research • Medicine
    A Choroid Plexus Epithelial Cell-based Model of the Human Blood-Cerebrospinal Fluid Barrier to Study Bacterial Infection from the Basolateral Side
  • Research • Medicine
    Isolation and Profiling of MicroRNA-containing Exosomes from Human Bile
  • Research • Medicine
    Generation of Microtumors Using 3D Human Biogel Culture System and Patient-derived Glioblastoma Cells for Kinomic Profiling and Drug Response Testing
  • Research • Medicine
    Ultrasound Assessment of Endothelial Function: A Technical Guideline of the Flow-mediated Dilation Test
  • Research • Medicine
    Using a Laminating Technique to Perform Confocal Microscopy of the Human Sclera
  • Research • Medicine
    Intravenous Endotoxin Challenge in Healthy Humans: An Experimental Platform to Investigate and Modulate Systemic Inflammation
  • Research • Medicine
    Modeling and Simulations of Olfactory Drug Delivery with Passive and Active Controls of Nasally Inhaled Pharmaceutical Aerosols
  • Research • Medicine
    Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool
  • Research • Medicine
    A Multimodal Imaging- and Stimulation-based Method of Evaluating Connectivity-related Brain Excitability in Patients with Epilepsy
  • Research • Medicine
    Measuring Cardiac Autonomic Nervous System (ANS) Activity in Toddlers - Resting and Developmental Challenges
  • Research • Medicine
    Using Saccadometry with Deep Brain Stimulation to Study Normal and Pathological Brain Function
  • Research • Medicine
    Quantitative Fundus Autofluorescence for the Evaluation of Retinal Diseases
  • Research • Medicine
    Diagnosis of Musculus Gastrocnemius Tightness - Key Factors for the Clinical Examination
  • Research • Medicine
    Stereo-Electro-Encephalo-Graphy (SEEG) With Robotic Assistance in the Presurgical Evaluation of Medical Refractory Epilepsy: A Technical Note
  • Research • Medicine
    Quantitative Magnetic Resonance Imaging of Skeletal Muscle Disease
  • Research • Medicine
    Transcutaneous Microcirculatory Imaging in Preterm Neonates
  • Research • Medicine
    Using an Ingestible Telemetric Temperature Pill to Assess Gastrointestinal Temperature During Exercise
  • Research • Medicine
    Design, Fabrication, and Administration of the Hand Active Sensation Test (HASTe)
  • Research • Medicine
    MRI-guided dmPFC-rTMS as a Treatment for Treatment-resistant Major Depressive Disorder
  • Research • Medicine
    Functional Human Liver Preservation and Recovery by Means of Subnormothermic Machine Perfusion
  • Research • Medicine
    A Multicenter MRI Protocol for the Evaluation and Quantification of Deep Vein Thrombosis
  • Research • Medicine
    Determining The Electromyographic Fatigue Threshold Following a Single Visit Exercise Test
  • Research • Medicine
    Use of Electromagnetic Navigational Transthoracic Needle Aspiration (E-TTNA) for Sampling of Lung Nodules
  • Research • Medicine
    Trabecular Meshwork Response to Pressure Elevation in the Living Human Eye
  • Research • Medicine
    In Vivo, Percutaneous, Needle Based, Optical Coherence Tomography of Renal Masses
  • Research • Medicine
    Establishment of Human Epithelial Enteroids and Colonoids from Whole Tissue and Biopsy
  • Research • Medicine
    Human Brown Adipose Tissue Depots Automatically Segmented by Positron Emission Tomography/Computed Tomography and Registered Magnetic Resonance Images
  • Research • Medicine
    Preparation and Respirometric Assessment of Mitochondria Isolated from Skeletal Muscle Tissue Obtained by Percutaneous Needle Biopsy
  • Research • Medicine
    A Methodological Approach to Non-invasive Assessments of Vascular Function and Morphology
  • Research • Medicine
    Isolation and Immortalization of Patient-derived Cell Lines from Muscle Biopsy for Disease Modeling
  • Research • Medicine
    State of the Art Cranial Ultrasound Imaging in Neonates
  • Research • Medicine
    Measurement of Dynamic Scapular Kinematics Using an Acromion Marker Cluster to Minimize Skin Movement Artifact
  • Research • Medicine
    The Supraclavicular Fossa Ultrasound View for Central Venous Catheter Placement and Catheter Change Over Guidewire
  • Research • Medicine
    Ultrasound Assessment of Endothelial-Dependent Flow-Mediated Vasodilation of the Brachial Artery in Clinical Research
  • Research • Medicine
    Tracking the Mammary Architectural Features and Detecting Breast Cancer with Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging
  • Research • Medicine
    A Neuroscientific Approach to the Examination of Concussions in Student-Athletes
  • Research • Medicine
    DTI of the Visual Pathway - White Matter Tracts and Cerebral Lesions
  • Research • Medicine
    Collection, Isolation, and Flow Cytometric Analysis of Human Endocervical Samples
  • Research • Medicine
    Fundus Photography as a Convenient Tool to Study Microvascular Responses to Cardiovascular Disease Risk Factors in Epidemiological Studies
  • Research • Medicine
    A Multi-Modal Approach to Assessing Recovery in Youth Athletes Following Concussion
  • Research • Medicine
    Clinical Assessment of Spatiotemporal Gait Parameters in Patients and Older Adults
  • Research • Medicine
    Multi-electrode Array Recordings of Human Epileptic Postoperative Cortical Tissue
  • Research • Medicine
    Collection and Extraction of Saliva DNA for Next Generation Sequencing
  • Research • Medicine
    Fast and Accurate Exhaled Breath Ammonia Measurement
  • Research • Medicine
    Developing Neuroimaging Phenotypes of the Default Mode Network in PTSD: Integrating the Resting State, Working Memory, and Structural Connectivity
  • Research • Medicine
    Two Methods for Establishing Primary Human Endometrial Stromal Cells from Hysterectomy Specimens
  • Research • Medicine
    Assessment of Vascular Function in Patients With Chronic Kidney Disease
  • Research • Medicine
    Coordinate Mapping of Hyolaryngeal Mechanics in Swallowing
  • Research • Medicine
    Network Analysis of the Default Mode Network Using Functional Connectivity MRI in Temporal Lobe Epilepsy
  • Research • Medicine
    EEG Mu Rhythm in Typical and Atypical Development
  • Research • Medicine
    The Multiple Sclerosis Performance Test (MSPT): An iPad-Based Disability Assessment Tool
  • Research • Medicine
    Isolation and Functional Characterization of Human Ventricular Cardiomyocytes from Fresh Surgical Samples
  • Research • Medicine
    Dynamic Visual Tests to Identify and Quantify Visual Damage and Repair Following Demyelination in Optic Neuritis Patients
  • Research • Medicine
    Primary Culture of Human Vestibular Schwannomas
  • Research • Medicine
    Utility of Dissociated Intrinsic Hand Muscle Atrophy in the Diagnosis of Amyotrophic Lateral Sclerosis
  • Research • Medicine
    Lesion Explorer: A Video-guided, Standardized Protocol for Accurate and Reliable MRI-derived Volumetrics in Alzheimer's Disease and Normal Elderly
  • Research • Medicine
    Pulse Wave Velocity Testing in the Baltimore Longitudinal Study of Aging
  • Research • Medicine
    Isolation, Culture, and Imaging of Human Fetal Pancreatic Cell Clusters
  • Research • Medicine
    3D-Neuronavigation In Vivo Through a Patient's Brain During a Spontaneous Migraine Headache
  • Research • Medicine
    A Novel Application of Musculoskeletal Ultrasound Imaging
  • Research • Medicine
    Computerized Dynamic Posturography for Postural Control Assessment in Patients with Intermittent Claudication
  • Research • Medicine
    Collecting Saliva and Measuring Salivary Cortisol and Alpha-amylase in Frail Community Residing Older Adults via Family Caregivers
  • Research • Medicine
    Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging in the Analysis of Neurodegenerative Diseases
  • Research • Medicine
    Transcriptomic Analysis of Human Retinal Surgical Specimens Using jouRNAl
  • Research • Medicine
    Improved Protocol For Laser Microdissection Of Human Pancreatic Islets From Surgical Specimens
  • Research • Medicine
    Evaluation of Respiratory Muscle Activation Using Respiratory Motor Control Assessment (RMCA) in Individuals with Chronic Spinal Cord Injury
  • Research • Medicine
    Minimal Erythema Dose (MED) Testing
  • Research • Medicine
    Measuring Cardiac Autonomic Nervous System (ANS) Activity in Children
  • Research • Medicine
    Collecting And Measuring Wound Exudate Biochemical Mediators In Surgical Wounds
  • Research • Medicine
    A Research Method For Detecting Transient Myocardial Ischemia In Patients With Suspected Acute Coronary Syndrome Using Continuous ST-segment Analysis
  • Research • Medicine
    Using a Chemical Biopsy for Graft Quality Assessment
  • Research • Medicine
    Characterizing Exon Skipping Efficiency in DMD Patient Samples in Clinical Trials of Antisense Oligonucleotides
  • Research • Medicine
    In Vitro Assessment of Cardiac Function Using Skinned Cardiomyocytes
  • Research • Medicine
    Normothermic Ex Situ Heart Perfusion in Working Mode: Assessment of Cardiac Function and Metabolism
  • Research • Medicine
    Evaluation of Vascular Control Mechanisms Utilizing Video Microscopy of Isolated Resistance Arteries of Rats
  • Research • Medicine
    Bronchoalveolar Lavage (BAL) for Research; Obtaining Adequate Sample Yield
  • Research • Medicine
    Non-invasive Optical Measurement of Cerebral Metabolism and Hemodynamics in Infants
  • Research • Medicine
    Tilt Testing with Combined Lower Body Negative Pressure: a "Gold Standard" for Measuring Orthostatic Tolerance
  • Research • Medicine
    Driving Simulation in the Clinic: Testing Visual Exploratory Behavior in Daily Life Activities in Patients with Visual Field Defects
  • Research • Medicine
    Isolation, Characterization and Comparative Differentiation of Human Dental Pulp Stem Cells Derived from Permanent Teeth by Using Two Different Methods
  • Research • Medicine
    Portable Intermodal Preferential Looking (IPL): Investigating Language Comprehension in Typically Developing Toddlers and Young Children with Autism
  • Research • Medicine
    Intraoperative Detection of Subtle Endometriosis: A Novel Paradigm for Detection and Treatment of Pelvic Pain Associated with the Loss of Peritoneal Integrity
  • Research • Medicine
    The Use of Primary Human Fibroblasts for Monitoring Mitochondrial Phenotypes in the Field of Parkinson's Disease
  • Research • Medicine
    Collection Protocol for Human Pancreas
  • Research • Medicine
    The α-test: Rapid Cell-free CD4 Enumeration Using Whole Saliva
  • Research • Medicine
    The Measurement and Treatment of Suppression in Amblyopia
  • Research • Medicine
    Corneal Donor Tissue Preparation for Endothelial Keratoplasty
  • Research • Medicine
    Quantification of Atherosclerotic Plaque Activity and Vascular Inflammation using [18-F] Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography/Computed Tomography (FDG-PET/CT)
  • Research • Medicine
    Eye Tracking Young Children with Autism
  • Research • Medicine
    Doppler Optical Coherence Tomography of Retinal Circulation
  • Research • Medicine
    Utilizing Transcranial Magnetic Stimulation to Study the Human Neuromuscular System
  • Research • Medicine
    Detection and Genogrouping of Noroviruses from Children's Stools By Taqman One-step RT-PCR
  • Research • Medicine
    Method to Measure Tone of Axial and Proximal Muscle
  • Research • Medicine
    The Trier Social Stress Test Protocol for Inducing Psychological Stress
  • Research • Medicine
    Probing the Brain in Autism Using fMRI and Diffusion Tensor Imaging
  • Research • Medicine
    Multifocal Electroretinograms
  • Research • Medicine
    Isolation of Human Islets from Partially Pancreatectomized Patients
  • Research • Medicine
    Examining the Characteristics of Episodic Memory using Event-related Potentials in Patients with Alzheimer's Disease
  • Research • Medicine
    Magnetic Resonance Imaging Quantification of Pulmonary Perfusion using Calibrated Arterial Spin Labeling
  • Research • Medicine
    Manual Muscle Testing: A Method of Measuring Extremity Muscle Strength Applied to Critically Ill Patients
  • Research • Medicine
    Expired CO2 Measurement in Intubated or Spontaneously Breathing Patients from the Emergency Department
  • Research • Medicine
    A Protocol for Comprehensive Assessment of Bulbar Dysfunction in Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
  • Research • Medicine
    An Investigation of the Effects of Sports-related Concussion in Youth Using Functional Magnetic Resonance Imaging and the Head Impact Telemetry System
  • Research • Medicine
    Corneal Confocal Microscopy: A Novel Non-invasive Technique to Quantify Small Fibre Pathology in Peripheral Neuropathies
  • Research • Medicine
    Methods to Quantify Pharmacologically Induced Alterations in Motor Function in Human Incomplete SCI
  • Research • Medicine
    Multispectral Real-time Fluorescence Imaging for Intraoperative Detection of the Sentinel Lymph Node in Gynecologic Oncology
  • Research • Medicine
    Technique to Collect Fungiform (Taste) Papillae from Human Tongue
  • Research • Medicine
    Assessing Endothelial Vasodilator Function with the Endo-PAT 2000
  • Research • Medicine
    Making Sense of Listening: The IMAP Test Battery
  • Research • Medicine
    An Experimental Paradigm for the Prediction of Post-Operative Pain (PPOP)
  • Research • Biology
    Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees
  • Research • Biology
    Demonstration of Cutaneous Allodynia in Association with Chronic Pelvic Pain
  • Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

    Waiting X
    Simple Hit Counter