Summary

On-Chip oktanolassistert liposommontering for bioteknologi

Published: March 17, 2023
doi:

Summary

Den nåværende protokollen beskriver oktanolassistert liposommontering (OLA), en mikrofluidisk teknikk for å generere biokompatible liposomer. OLA produserer monodispergerte liposomer i mikronstørrelse med effektiv innkapsling, noe som muliggjør umiddelbar eksperimentering på brikken. Denne protokollen forventes å være spesielt egnet for syntetisk biologi og syntetisk celleforskning.

Abstract

Mikrofluidikk er et mye brukt verktøy for å generere dråper og vesikler av forskjellige slag på en kontrollert og høy gjennomstrømningsmåte. Liposomer er forenklede cellulære etterligninger sammensatt av et vandig interiør omgitt av et lipid-dobbeltlag; De er verdifulle i utformingen av syntetiske celler og forstå grunnleggende biologiske celler in vitro mote og er viktige for anvendt vitenskap, for eksempel lastlevering for terapeutiske applikasjoner. Denne artikkelen beskriver en detaljert arbeidsprotokoll for en on-chip mikrofluidisk teknikk, oktanolassistert liposommontering (OLA), for å produsere monodispergerte, mikronstore, biokompatible liposomer. OLA fungerer på samme måte som bobleblåsing, hvor en indre vandig (IA) fase og en omkringliggende lipidbærende 1-oktanolfase klemmes av av overflateaktive ytre væskestrømmer. Dette genererer lett dobbeltemulsjonsdråper med utstående oktanollommer. Når lipid-dobbeltlaget samles ved dråpegrensesnittet, løsner lommen spontant for å gi opphav til et unilamellært liposom som er klar for videre manipulering og eksperimentering. OLA gir flere fordeler, for eksempel jevn liposomgenerering (>10 Hz), effektiv innkapsling av biomaterialer og monodispergerte liposompopulasjoner, og krever svært små prøvevolumer (~ 50 μL), noe som kan være avgjørende når du arbeider med dyrebare biologiske. Studien inkluderer detaljer om mikrofabrikasjon, myklitografi og overflatepassivering, som er nødvendig for å etablere OLA-teknologi i laboratoriet. En proof-of-principle syntetisk biologi anvendelse er også vist ved å indusere dannelsen av biomolekylære kondensater inne i liposomene via transmembran protonfluks. Det forventes at denne medfølgende videoprotokollen vil gjøre det lettere for leserne å etablere og feilsøke OLA i laboratoriene sine.

Introduction

Alle celler har en plasmamembran som deres fysiske grense, og denne membranen er i hovedsak et stillas i form av et lipid-dobbeltlag dannet ved selvmontering av amfifile lipidmolekyler. Liposomer er de minimale syntetiske motstykkene til biologiske celler; De har et vandig lumen omgitt av fosfolipider, som danner et lipid-dobbeltlag med de hydrofile hodegruppene som vender mot den vandige fase og de hydrofobe haler begravet innover. Liposomenes stabilitet styres av den hydrofobe effekten, samt hydrofiliteten mellom polargruppene, van der Waals-kreftene mellom de hydrofobe karbonhalene og hydrogenbindingen mellom vannmolekyler og de hydrofile hodene 1,2. Avhengig av antall lipid-dobbeltlag kan liposomer klassifiseres i to hovedkategorier, nemlig unilamellære vesikler som består av et enkelt dobbeltlag og multilamellære vesikler konstruert fra flere dobbeltlag. Unilamellære vesikler klassifiseres videre basert på deres størrelser. Vanligvis sfæriske i form, kan de produseres i en rekke størrelser, inkludert små unilamellære vesikler (SUV, 30-100 nm diameter), store unilamellære vesikler (LUV, 100-1,000 nm diameter), og til slutt, gigantiske unilamellære vesikler (GUV, >1,000 nm diameter) 3,4. Ulike teknikker har blitt utviklet for å produsere liposomer, og disse kan kategoriseres bredt i bulkteknikker5 og mikrofluidiske teknikker6. Vanlige praktiserte bulkteknikker inkluderer lipidfilmrehydrering, elektroformasjon, invertert emulsjonsoverføring og ekstrudering 7,8,9,10. Disse teknikkene er relativt enkle og effektive, og disse er de viktigste årsakene til deres utbredt bruk i det syntetiske biologisamfunnet. Imidlertid lider de samtidig av store ulemper med hensyn til polydispersiteten i størrelse, mangelen på kontroll over lamellariteten og lav innkapslingseffektivitet 7,11. Teknikker som kontinuerlig dråpegrensesnittkryssende innkapsling (cDICE)12 og dråpeskyting og størrelsesfiltrering (DSSF)13 overvinner til en viss grad disse begrensningene.

Mikrofluidiske tilnærminger har blitt fremtredende i løpet av det siste tiåret. Mikrofluidisk teknologi gir et kontrollerbart miljø for å manipulere væskestrømmer innenfor brukerdefinerte mikrokanaler på grunn av den karakteristiske laminær strømning og diffusjonsdominert masseoverføring. De resulterende lab-on-a-chip-enhetene gir unike muligheter for spatiotemporal kontroll av molekyler, med betydelig reduserte prøvevolumer og multipleksingsevner14. Tallrike mikrofluidiske metoder for å lage liposomer har blitt utviklet, inkludert pulserende jetting 15, dobbel emulsjon templating 16, forbigående membranutstøting 17, dråpeemulsjonsoverføring18 og hydrodynamisk fokusering 19. Disse teknikkene produserer monodispergerte, unilamellar, liposomer i cellestørrelse med høy innkapslingseffektivitet og høy gjennomstrømning.

Denne artikkelen beskriver prosedyren for oktanolassistert liposommontering (OLA), en mikrofluidisk metode på brikken basert på den hydrodynamiske klemmemekanismen og påfølgende løsningsmiddelavfuktingsmekanisme20 (figur 1). Man kan relatere arbeidet med OLA til en bobleblåsingsprosess. Et seksveis kryss fokuserer den indre vandige (IA) fasen, to lipidbærende organiske (LO) strømmer og to overflateaktivt middelholdige ytre vandige (OA) strømmer på et enkelt sted. Dette resulterer i vann-i-(lipider + oktanol)-i-vann doble emulsjonsdråper. Når disse dråpene strømmer nedstrøms, fører grenseflateenergiminimering, ekstern skjærstrøm og interaksjon med kanalveggene til dannelsen av et lipiddobbeltlag ved grensesnittet når løsningsmiddellommen løsner og danner dermed unilamellære liposomer. Avhengig av størrelsen på oktanollommen, kan dewetting-prosessen ta titalls sekunder til et par minutter. På slutten av utgangskanalen flyter de mindre tette oktanoldråpene til overflaten, mens de tyngre liposomene (på grunn av en tettere innkapslet løsning) synker til bunnen av visualiseringskammeret klar for eksperimentering. Som et representativt eksperiment demonstreres prosessen med væske-væskefaseseparasjon (LLPS) inne i liposomer. For det er de nødvendige komponentene innkapslet i liposomer ved en sur pH som forhindrer LLPS. Ved eksternt å utløse en pH-endring og dermed en transmembran protonfluks, dannes faseseparerte kondensatdråper inne i liposomene. Dette fremhever de effektive innkapslings- og manipuleringsfunksjonene til OLA-systemet.

Protocol

1. Fremstilling av masterwaferen Ta en 4 tommer (10 cm) diameter ren silisiumskive (se materialfortegnelse). Rengjør den ytterligere med trykkluft for å fjerne støvpartikler. Monter skiven på en rotasjonsfrakk, og dispenser forsiktig ~ 5 ml av en negativ fotoresist (se materialfortegnelse) i midten av skiven. Prøv å unngå luftbobler, da de kan forstyrre nedstrøms utskriftsprosessen til skiven. For å oppnå et 10 μm tykt fotoresistl…

Representative Results

Denne studien demonstrerer dannelsen av membranløse kondensater via prosessen med væske-væskefaseseparasjon (LLPS) inne i liposomer som et representativt eksperiment. Prøve forberedelseIA, OA, ES og fôrløsning (FS) fremstilles som følger: IA: 12 % glyserol, 5 mM dekstran, 150 mM KCl, 5 mg/ml poly-L-lysin (PLL), 0,05 mg/ml poly-L-lysin-FITC-merket (PLL-FITC), 8 mM adenosintrifosfat (ATP), 15 mM citrat-HCl (pH 4) <p class="jove…

Discussion

Cellulær kompleksitet gjør det ekstremt vanskelig å forstå levende celler når de studeres som en helhet. Å redusere redundans og sammenkobling av celler ved å rekonstituere nøkkelkomponentene in vitro er nødvendig for å fremme vår forståelse av biologiske systemer og skape kunstige cellulære etterligninger for bioteknologiske applikasjoner22,23,24. Liposomer fungerer som et utmerket minimalt system for å forstå ce…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Vi ønsker å anerkjenne Dolf Weijers, Vera Gorelova og Roosjen for vennlig å gi oss YFP. SD anerkjenner økonomisk støtte fra det nederlandske forskningsrådet (tilskuddsnummer: OCENW. KLEIN.465).

Materials

1-Octanol Sigma-Aldrich No. 297887
1.5 mL tubes Fisher scientific 10451043 Eppendorf 3810X Polypropylene microcentrifuge tubes
ATP Sigma-Aldrich No. A2383
Biopsy punch Darwin microfluidics PT-T983-05 0.5 mm and 3 mm diameter
Citrate-base Sigma-Aldrich No. 71405
Dextran Sigma-Aldrich No. 31388 Mr~6,000
Direct-write optical lithography machine Durham Magneto Optics Ltd MicroWriter ML3 Baby setup and software
DOPC lipid Avanti SKU:850375C
F68 Sigma-Aldrich No. 24040032
Glass cover slip Corning #1, 24 x 40 mm
Glycerol Sigma-Aldrich No. G2025
Hydrochloric acid Thermo Scientific Acros No. 124630010
Liss Rhod PE lipid Avanti SKU:810150C
Parafilm Sigma-Aldrich No. P7793
Photoresist Micro resist technology GmbH EpoCore 10
Photoresist developer micro resist technology GmbH mr-Dev 600
Plasma cleaner Harrick plasma PDC-32G
Polydimethylsiloxane Dow Sylgard 184 PDMS and curing agent
Poly-L-lysine Sigma-Aldrich No. P7890
Poly-L-lysine–FITC Labeled Sigma-Aldrich No. P3543
Polyvinyl alcohol Sigma-Aldrich no. P8136 molecular weight 30,000–70,000, 87%–90% hydrolyzed
Pressure controller Elveflow  OBK1 Mk3+ Flow controller
Scotch tape Magic Tape Invisible Matt Tape
Silicon wafer Silicon Materials 0620R16002
Spin coater  Laurell Technologies Corporation Model WS-650MZ-23NPP
Stainless Steel 90° Bent PDMS Couplers Darwin microfluidics PN-BEN-23G
Tris-base Sigma-Aldrich No. 252859
Tygon tubing Darwin microfluidics 1/16" OD x 0.02" ID
UV laser  365 nm wavelength

References

  1. Frezard, F. Liposomes: From biophysics to the design of peptide vaccines. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. 32 (2), 181-189 (1999).
  2. Monteiro, N., Martins, A., Reis, R. L., Neves, N. M. Liposomes in tissue engineering and regenerative medicine. Journal of the Royal Society Interface. 11 (101), 20140459 (2014).
  3. Mishra, H., Chauhan, V., Kumar, K., Teotia, D. A comprehensive review on liposomes: A novel drug delivery system. Journal of Drug Delivery and Therapeutics. 8 (6), 400-404 (2018).
  4. Liu, W., et al. Research progress on liposomes: Application in food, digestion behavior and absorption mechanism. Trends in Food Science & Technology. 104, 177-189 (2020).
  5. Kamiya, K., Takeuchi, S. Giant liposome formation toward the synthesis of well-defined artificial cells. Journal of Materials Chemistry B. 5 (30), 5911-5923 (2017).
  6. van Swaay, D., DeMello, A. Microfluidic methods for forming liposomes. Lab on a Chip. 13 (5), 752-767 (2013).
  7. Lombardo, D., Kiselev, M. A. Methods of liposomes preparation: Formation and control factors of versatile nanocarriers for biomedical and nanomedicine application. Pharmaceutics. 14 (3), 543 (2022).
  8. Zhang, H., D’Souza, G. G. M. Thin-film hydration followed by extrusion method for liposome preparation. Liposomes: Methods and Protocols. , 17-22 (2017).
  9. Filipczak, N., Pan, J., Yalamarty, S. S. K., Torchilin, V. P. Recent advancements in liposome technology. Advanced Drug Delivery Reviews. 156, 4-22 (2020).
  10. Has, C., Sunthar, P. A comprehensive review on recent preparation techniques of liposomes. Journal of Liposome Research. 30 (4), 336-365 (2020).
  11. Large, D. E., Abdelmessih, R. G., Fink, E. A., Auguste, D. T. Liposome composition in drug delivery design, synthesis, characterization, and clinical application. Advanced Drug Delivery Reviews. 176, 113851 (2021).
  12. Abkarian, M., Loiseau, E., Massiera, G. Continuous droplet interface crossing encapsulation (cDICE) for high throughput monodisperse vesicle design. Soft Matter. 7 (10), 4610-4614 (2011).
  13. Morita, M., et al. Droplet-shooting and size-filtration (DSSF) method for synthesis of cell-sized liposomes with controlled lipid compositions. ChemBioChem. 16 (14), 2029-2035 (2015).
  14. Convery, N., Gadegaard, N. 30 years of microfluidics. Micro and Nano Engineering. 2, 76-91 (2019).
  15. Stachowiak, J. C., et al. Unilamellar vesicle formation and encapsulation by microfluidic jetting. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (12), 4697-4702 (2008).
  16. Chu, L. Y., Utada, A. S., Shah, R. K., Kim, J. W., Weitz, D. A. Controllable monodisperse multiple emulsions. Angewandte Chemie. 119 (47), 9128-9132 (2007).
  17. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. Engineering asymmetric vesicles. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100 (19), 10718-10721 (2003).
  18. Ota, S., Yoshizawa, S., Takeuchi, S. Microfluidic formation of monodisperse, cell-sized, and unilamellar vesicles. Angewandte Chemie International Edition. 48 (35), 6533-6537 (2009).
  19. Carugo, D., Bottaro, E., Owen, J., Stride, E., Nastruzzi, C. Liposome production by microfluidics: Potential and limiting factors. Scientific Reports. 6, 25876 (2016).
  20. Deshpande, S., Dekker, C. On-chip microfluidic production of cell-sized liposomes. Nature Protocols. 13 (5), 856-874 (2018).
  21. Last, M. G., Deshpande, S., Dekker, C. pH-controlled coacervate-membrane interactions within liposomes. ACS Nano. 14 (4), 4487-4498 (2020).
  22. Jia, H., Schwille, P. Bottom-up synthetic biology: reconstitution in space and time. Current Opinion in Biotechnology. 60, 179-187 (2019).
  23. Ganar, K. A., Leijten, L., Deshpande, S. Actinosomes: Condensate-Templated Containers for Engineering Synthetic Cells. ACE Synthetic Biology. 11 (8), 2869-2879 (2022).
  24. Gaut, N. T., Adamala, K. P. Reconstituting Natural Cell Elements in Synthetic Cells. Advanced Biology. 5 (3), 2000188 (2021).
  25. Ganar, K. A., Honaker, L. W., Deshpande, S. Shaping synthetic cells through cytoskeleton-condensate-membrane interactions. Current Opinion in Colloid & Interface Science. 54, 101459 (2021).
  26. Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Encapsulation of the cytoskeleton: Towards mimicking the mechanics of a cell. Soft Matter. 15 (42), 8425-8436 (2019).
  27. Deshpande, S., et al. Spatiotemporal control of coacervate formation within liposomes. Nature Communications. 10, 1800 (2019).
  28. Love, C., et al. Reversible pH-responsive coacervate formation in lipid vesicles activates dormant enzymatic reactions. Angewandte Chemie. 132 (15), 6006-6013 (2020).
  29. Lu, T., et al. Endocytosis of coacervates into liposomes. Journal of the American Chemical Society. 144 (30), 13451-13455 (2022).
  30. Van de Cauter, L., et al. Optimized cDICE for efficient reconstitution of biological systems in giant unilamellar vesicles. ACS Synthetic Biology. 10 (7), 1690-1702 (2021).
  31. Blanken, D., Foschepoth, D., Serrão, A. C., Danelon, C. Genetically controlled membrane synthesis in liposomes. Nature Communications. 11, 4317 (2020).
  32. Bouzetos, E., Ganar, K. A., Mastrobattista, E., Deshpande, S., vander Oost, J. (R) evolution-on-a-chip. Trends in Biotechnology. 40 (1), 60-76 (2022).
  33. Kamalinia, G., Grindel, B. J., Takahashi, T. T., Millward, S. W., Roberts, R. W. Directing evolution of novel ligands by mRNA display. Chemical Society Reviews. 50 (16), 9055-9103 (2021).
  34. Godino, E., et al. De novo synthesized Min proteins drive oscillatory liposome deformation and regulate FtsA-FtsZ cytoskeletal patterns. Nature Communications. 10, 4969 (2019).
  35. Tenchov, R., Bird, R., Curtze, A. E., Zhou, Q. Lipid nanoparticles─From liposomes to mRNA vaccine delivery, a landscape of research diversity and advancement. ACS Nano. 15 (11), 16982-17015 (2021).
  36. Deshpande, S., Caspi, Y., Meijering, A. E., Dekker, C. Octanol-assisted liposome assembly on chip. Nature Communications. 7, 10447 (2016).
  37. Schaich, M., et al. An integrated microfluidic platform for quantifying drug permeation across biomimetic vesicle membranes. Molecular Pharmaceutics. 16 (6), 2494-2501 (2019).
  38. Schaich, M., Sobota, D., Sleath, H., Cama, J., Keyser, U. F. Characterization of lipid composition and diffusivity in OLA generated vesicles. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes. 1862 (9), 183359 (2020).
  39. Deshpande, S., Spoelstra, W. K., Van Doorn, M., Kerssemakers, J., Dekker, C. Mechanical division of cell-sized liposomes. ACS Nano. 12 (3), 2560-2568 (2018).
  40. Jusková, P., et al. 34;Basicles": Microbial growth and production monitoring in giant lipid vesicles. ACS Applied Materials & Interfaces. 11 (38), 34698-34706 (2019).
  41. Fletcher, M., et al. DNA-based optical quantification of ion transport across giant vesicles. ACS Nano. 16 (10), 17128-17138 (2022).
  42. Vaezi, Z., et al. Investigation of the programmed cell death by encapsulated cytoskeleton drug liposomes using a microfluidic platform. Microfluidics and Nanofluidics. 24 (7), 48 (2020).
  43. Al Nahas, K., et al. A microfluidic platform for the characterisation of membrane active antimicrobials. Lab on a Chip. 19 (5), 837-844 (2019).
  44. Bao, P., et al. Production of giant unilamellar vesicles and encapsulation of lyotropic nematic liquid crystals. Soft Matter. 17 (8), 2234-2241 (2021).
  45. Yandrapalli, N., Petit, J., Bäumchen, O., Robinson, T. Surfactant-free production of biomimetic giant unilamellar vesicles using PDMS-based microfluidics. Communications Chemistry. 4, 100 (2021).
  46. Cama, J., et al. An ultrasensitive microfluidic approach reveals correlations between the physico-chemical and biological activity of experimental peptide antibiotics. Scientific Reports. 12, 4005 (2022).
  47. Guerzoni, L. P., et al. High macromolecular crowding in liposomes from microfluidics. Advanced Science. 9 (27), 2201169 (2022).
  48. Gonzales, D. T., Yandrapalli, N., Robinson, T., Zechner, C., Tang, T. D. Cell-free gene expression dynamics in synthetic cell populations. ACS Synthetic Biology. 11 (1), 205-215 (2022).
  49. Ushiyama, R., Koiwai, K., Suzuki, H. Plug-and-play microfluidic production of monodisperse giant unilamellar vesicles using droplet transfer across water-oil interface. Sensors and Actuators B: Chemical. 355, 131281 (2022).
  50. Banlaki, I., Lehr, F. -. X., Niederholtmeyer, H., Karim, A. S., Jewett, M. C. Microfluidic production of porous polymer cell-mimics capable of gene expression. Cell-Free Gene Expression. , 237-255 (2022).
check_url/65032?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Chen, C., Ganar, K. A., Deshpande, S. On-Chip Octanol-Assisted Liposome Assembly for Bioengineering. J. Vis. Exp. (193), e65032, doi:10.3791/65032 (2023).

View Video