本方案描述了将胰腺导管腺癌(PDAC)细胞和正常胰腺导管上皮细胞重编程为诱导性多能干细胞(iPSCs)的方法。我们提供了一套优化且详细的逐步操作流程,从慢病毒的制备到建立稳定的iPSC细胞系。
需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用
本方案描述了将胰腺导管腺癌(PDAC)细胞和正常胰腺导管上皮细胞重编程为诱导性多能干细胞(iPSCs)的方法。我们提供了一套优化且详细的逐步操作流程,从慢病毒的制备到建立稳定的iPSC细胞系。
利用转录因子诱导生成诱导性多能干细胞(iPSCs)已几乎可从任何分化的细胞类型中实现,并在科研和临床应用中展现出极高的价值。有趣的是,对胰腺导管腺癌(PDAC)等癌细胞进行iPSC重编程已被证明能够逆转其侵袭性PDAC表型,并克服癌症表观遗传组的异常。由PDAC细胞衍生的iPSCs在分化过程中可重现PDAC从早期胰腺上皮内瘤变(PanIN)前体开始的疾病进展过程,揭示PDAC进展早期发生的分子与细胞变化。因此,PDAC来源的iPSCs可用于模拟PDAC的最早期阶段,从而发现可用于早期检测的诊断标志物。这一点对于PDAC患者尤为重要,因为目前缺乏可靠的PanIN早期阶段生物标志物,导致大多数患者通常在晚期转移阶段才得以确诊。然而,将包括PDAC在内的癌细胞系重编程为多能状态仍面临挑战,过程繁琐且不同细胞系之间的效率差异显著。本文中,我们描述了一种使用双顺反子慢病毒载体从多种人源PDAC细胞系生成iPSCs的更为稳定一致的实验方案。所获得的iPSC细胞系具有良好的稳定性,无需依赖外源性重编程因子表达或诱导药物的持续存在。总体而言,该方案有助于高效生成多种PDAC来源的iPSCs,这对于发现更具特异性和代表性的PDAC早期生物标志物至关重要。
胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的恶性肿瘤之一,由于该疾病早期无明显症状,早期诊断仍然具有挑战性。大多数PDAC患者在确诊时已处于晚期转移阶段,此时可用的治疗选择极为有限1,2。这主要是因为缺乏可用于早期阶段的可靠生物标志物,例如那些可被方便检测到的、释放到血液中的蛋白质类标志物。
胰腺导管腺癌(PDAC)在其进展过程中可很早发生播散,当PDAC局限于胰腺时进行早期癌症检测与较好的预后相关3。然而,仅有不到十分之一的PDAC患者被诊断时处于有利预后阶段,从而能够接受手术切除。即便如此,这些少数可切除肿瘤的患者中,也有很大比例在12个月内出现肿瘤复发4。
在过去五十年中,外科手术技术、患者护理和治疗方式已取得显著进步5,6。然而,接受手术切除的胰腺导管腺癌(PDAC)患者的5年生存率仅略微提高至17%。尽管如此,这一数据仍优于未接受切除手术的患者,后者生存率几乎未变(0.9%)4,7。化疗是目前唯一可用于PDAC的替代治疗手段。然而,该选择极为有限,因为绝大多数PDAC患者对吉西他滨(Gemcitabine)等化疗药物表现出强烈耐药性7,8。其他药物,如厄洛替尼(Erlotinib),仅适用于具有特定突变的一小部分PDAC患者,而其中大多数患者仍对厄洛替尼耐药9。此外,大多数PDAC患者在接受化疗时伴随的不良副作用是该疗法的另一项不利因素10。近期有前景的策略表明,免疫检查点抑制剂(ICIs)和小分子激酶抑制剂(SMKIs)在治疗PDAC方面可能有效,但这些靶向治疗的持久应答仍仅限于少数患者11,12。总体而言,发现PDAC特异性的早期生物标志物可为早期诊断和治疗开辟新途径。
胰腺导管腺癌(PDAC)起源于胰腺上皮内瘤变(PanIN)癌前病变,这些病变由非侵袭性的胰腺导管上皮细胞增殖所致13,14。尽管PanIN的形成始于KRAS等癌基因的突变,但其向PDAC进展还需要额外的遗传和表观遗传改变。据估计,PanIN经历不同阶段发展为侵袭性PDAC大约需要10年时间13,15,16,17。这一时间窗口为实现PDAC的早期诊断提供了重要机遇。因此,已有大量研究致力于建立肿瘤异种移植动物模型和类器官培养体系以研究PDAC的进展过程18,19,20,21。这些模型在研究PDAC侵袭阶段方面非常有用,但难以模拟从早期PanIN阶段转变的过程。因此,建立能够重现PanIN早期进展过程的实验模型,对于发现早期检测生物标志物具有重要意义。
利用四种转录因子OCT4、SOX2、KLF4和c-MYC(OSKM)将体细胞重编程为诱导性多能干细胞(iPSCs),揭示了细胞可塑性的程度22。癌症细胞的可塑性已有充分记录,将人类癌细胞重编程为iPSCs已被成功用于将细胞重置至其原始状态,消除在癌症进展过程中积累的许多表观遗传损伤23,24,25,26,27,28,29。因此,利用这种重编程策略调控癌细胞身份的可能性在癌症治疗中展现出巨大前景30,31。事实上,我们此前已证明,源自胰腺导管腺癌(PDAC)的iPSCs的分化能够重现PDAC通过早期PanIN阶段的进展过程32。通过鉴定PDAC早期至中期阶段特异的基因和通路,识别出可用于临床早期PDAC诊断的候选生物标志物32,33。然而,使用单个iPSC系发现的生物标志物在大多数PDAC患者中覆盖范围有限32。从其他PDAC患者中生成iPSC系所面临的挑战阻碍了发现更可靠生物标志物的能力。这归因于多种技术因素,包括OSKM递送的异质性,因为仅有少数人类原代PDAC细胞同时含有全部四种因子并成功响应重编程。本文提供了一种详细的实验方案,采用更高效且一致的双慢病毒系统递送OSKM,用于重编程原代PDAC细胞。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
所有实验方案均经俄勒冈健康与科学大学(OHSU)机构审查委员会批准。所有方法均按照相关指南和法规进行。涉及PDX肿瘤的动物实验均在获得OHSU机构动物使用与护理委员会(IACUC)批准后开展。本方案已在以下细胞中进行测试:来自患者来源的异种移植(PDX)模型的原代PDAC细胞、具有上皮形态的BxPc3细胞系(该细胞系分离自一名61岁女性腺癌患者的胰腺组织)、源自正常人胰腺导管上皮的H6C7永生化上皮细胞系,以及来自健康个体皮肤活检的原代人成纤维细胞。人PDAC样本取自俄勒冈胰腺组织登记研究(IRB00003609)。所有受试者均签署了知情同意书。原代人成纤维细胞由英国爱丁堡RBiomedical公司提供,其皮肤样本来自在英国爱丁堡皇家医院Little France院区接受常规手术的匿名供体,采集过程已获得供体同意并经伦理批准(编号09/MRE00/91)。所有慢病毒相关工作均在二级生物安全研究活动(GM207/16.6)条件下进行,并已获得爱丁堡大学健康与安全部门批准,同时已向苏格兰政府HSE主管机构报备。所有使用人胰腺细胞的重编程实验均在爱丁堡大学生物科学学院伦理委员会批准下进行(参考编号# asoufi-0002)。
1. 慢病毒的制备
2. 重编程慢病毒转导
3. 胰腺导管腺癌的慢病毒转导
4. BxPc3 细胞的慢病毒转导
5. 慢病毒感染 H6c7 细胞的转导
6. hFib 细胞的慢病毒转导
7. iMEF 饲养层细胞的制备
8. 将感染的细胞转移至iMEF饲养层
9. iPSC 克隆的传代
10. 使用 TRA-1-60 对 iPSC 克隆进行活体染色
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
图1展示了来自PDAC、BxPc3、H6C7和hFib细胞的iPSC集落形态的代表性图像。图1中可见,PDAC-iPSC集落在重编程第25天开始形成,到第40天时出现形态更成熟的、具有典型胚胎干细胞样特征的iPSC集落(图1)。同样,BxPc3-iPSC集落在重编程第23天开始出现,并于第35天趋于成熟。H6C7-iPSC的形成过程与PDAC-iPSC相似,从第45天开始逐渐形成稳定集落。hFib-iPSC集落则在重编程第15天即开始形成。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
为了促进利用iPSC重编程技术研究癌症进展,目前已建立了一种用于重编程胰腺癌细胞的稳健方案。迄今为止,将癌细胞重编程为多能状态已被证明极具挑战性,仅有少数研究成功地从癌细胞中生成了iPSC32,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
作者声明无利益冲突。
A.S 和 J.K 感谢癌症研究英国(Cancer Research UK)和俄勒冈健康与科学大学(OHSU)提供的资助(CRUK-OHSU 项目奖 C65925/A26986)。A.S 受英国医学研究理事会(MRC)职业发展奖(MR/N024028/1)支持。A.A 受沙特阿拉伯阿卜杜勒-阿齐兹国王科技城提供的博士奖学金资助(奖学金编号 1078107040)。J.K 受 MRF 新研究者资助(GCNCR1042A)以及奈特 CEDAR 资助(68182-933-000,68182-939-000)支持。我们感谢Keisuke Kaji教授慷慨提供重编程载体pSIN4-EF1a-O2S和pSIN4-CMV-K2M。为了开放获取的目的,作者已对本提交所产生的任何作者接受稿版本应用了知识共享署名(CC BY)许可。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 2-巯基乙醇(50 mM) | Thermo Fisher | 31350010 | |
| Alexa Fluor 488 抗人 TRA-1-60-R | BioLegend | 330613 | |
| 牛垂体提取物(BPE) | Thermo Fisher | 13028014 | |
| BxPc3 | ATCC | CRL-1687 | |
| 霍乱弧菌来源的霍乱毒素 | Merck | C8052-1MG | |
| 大鼠尾胶原,I型溶液 | Merck | C3867 | |
| 完全配制的定义型K-SFM培养基 | Thermo Fisher | 10744-019 | |
| Corning Costar 经组织培养处理的多孔板 | Merck | CLS3516 | |
| Corning 注射器滤器 | Merck | CLS431231 | |
| Corning 经组织培养处理的培养皿 | Merck | CLS430599 | |
| Day Impex Virkon 杀病毒消毒片 | Thermo Fisher | 12328667 | |
| Dulbecco′s 磷酸盐缓冲液(PBS) | Merck | D8537 | |
| 胎牛血清(FCS) | Thermo Fisher | 10270-106 | |
| Fugene HD 转染试剂 | Promega | E2312 | |
| 明胶溶液,B型,2% 溶于 H2O | Merck | G1393-100ML | |
| 格拉斯哥最低必需培养基(GMEM) | Merck | G5154 | |
| 人 EGF 重组蛋白 | Thermo Fisher | PHG0311 | |
| 人碱性成纤维细胞生长因子(FGF-2/bFGF)(154个氨基酸)重组蛋白,PeproTech | Thermo Fisher | 100-18B | |
| 人胰腺导管上皮细胞系(H6c7) | Kerafast | ECA001-FP | |
| iMEF 饲养层细胞 | iXcells Biotechnologies | 10MU-001-1V | |
| 角质形成细胞无血清培养基(KSFM) | Thermo Fisher | 17005-042 | |
| KnockOut DMEM | Thermo Fisher | 10829018 | |
| KnockOut 血清替代物 | Thermo Fisher | 10828028 | |
| L-谷氨酰胺(200 mM) | Thermo Fisher | 25030-024 | |
| MEM 非必需氨基酸溶液(100倍浓缩) | Thermo Fisher | 11140050 | |
| Millex-HP 0.45 μm 注射器滤器单元(无菌) | Merck | SLHP033RS | |
| Opti-MEM 减血清培养基 | Thermo Fisher | 31985062 | |
| pMDG | AddGene | 187440 | |
| 聚凝胺(Hexadimethrine bromide) | Merck | H9268-5G | |
| pSIN4-CMV-K2M | AddGene | 21164 | |
| pSIN4-EF2-O2S | AddGene | 21162 | |
| psPAX2 | AddGene | 12260 | |
| pWPT-GFP | AddGene | 12255 | |
| RPMI 1640 培养基(ATCC 改良型) | Thermo Fisher | A1049101 | |
| 丙酮酸钠 | Thermo Fisher | 11360-039 | |
| 一次性无菌注射器(60 mL) | Thermo Fisher | 15899152 | |
| TrypLE Express 酶(1倍浓度),含酚红 | Thermo Fisher | 12605036 | |
| UltraPure 0.5 M EDTA,pH 8.0 | Thermo Fisher | 15575020 | |
| Y-27632(盐酸二氢盐) | STEMCELL Technologies | 72304 |
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。