/
/
Förstärka och kvantifiera HIV-1 RNA i hiv-infekterade individer med virusnivåer under gränsen för upptäckt med vanliga kliniska analyser
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 02:00Extraction of RNA from Large Volumes of Plasma
- 04:58The Single Copy Assay
- 08:42Single Genome Sequencing
- 11:24Representative Single Copy Assay and Single Genome Sequencing Results
- 13:27Conclusion
Kvantifiering nivåer av HIV-1 RNA i plasma och sekvensering enstaka HIV-1-genomet från individer med virusbelastning under detektionsgränsen (50-75 kopior / ml) är svårt. Här beskriver vi hur du extraherar och kvantifiera plasma RNA med hjälp av en i realtid PCR-analys som tillförlitligt åtgärder HIV-1 RNA ner till 0,3 kopior / ml och hur man kan förstärka virus arvsmassa genom en enda genomet sekvensering, från prov med mycket låg virusnivåer.
Tags
AmplifyingQuantifyingHIV-1 RNAViral LoadsLimit Of DetectionStandard Clinical AssaysViral GenesInsightViral DynamicsVirus Host InteractionsPatientsNatural ControlCombination Antiretroviral Therapy (cART)Single Genome Sequencing (SGS Protocol)Single-copy Assay (SCA Protocol)Real-time PCR AssaySensitivityVolume Of PlasmaRNA Copy NumberInternal Control TestingDNA ContaminationTriplicate MeasurementsSingle-genome Sequencing Assay (SGS)Non-labor IntensiveLimiting Dilution AssayEndpoint Diluted CDNA Product
