Journal
/
Genetics
/
Metyl-binding DNA-fangst Sekvense for Pasientservietter
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues

Metyl-binding DNA-fangst Sekvense for Pasientservietter

DOI:
10.3791/54131-v

•

08:40 min

•

October 31, 2016

•

, , , , , , ,
1Department of Molecular Medicine,University of Texas Health Science Center at San Antonio, 2Greehey Children’s Cancer Research Institute,University of Texas Health Science Center at San Antonio

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:18Methyl-binding DNA Capture
  • 02:10Single Fraction Elution
  • 03:08Ethanol Precipitation
  • 04:29Sequencing
  • 05:58Results: Sequencing of Methyl-binding DNA Capture
  • 07:15Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her presenterer vi en protokoll for å undersøke genome wide DNA metylering i storskala klinisk pasientscreeningstudier ved hjelp av metyl-Binding DNA Capture sekvensering (MBDCap-seq eller MBD-seq) teknologi og påfølgende bioinformatikk analyse rørledning.

Tags

DNA MethylationEpigeneticsPatient CohortsBiomarkersMethyl-binding DNA CaptureSequencingGenome-wide AnalysisCost-effectiveSonicationFragment SizeElutionMagnetic Beads

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/54131?article_type=v

Påvisning av Kopier nummer Endringer Bruke enkelt celle Sequencing
check_url/54131?article_type=v

Rensing av High Molecular Weight Genomisk DNA fra meldugg for Long-Les Sekvense
check_url/54131?article_type=v

Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering
check_url/54131?article_type=v

Omfattende DNA-metyleringsanalyse ved bruk av en metyl-CpG-bindende domene-fangstbasert metode i kroniske lymfocytiske leukemi-pasienter
check_url/54131?article_type=v

Robust DNA isolasjon og høy gjennomstrømming sekvensering biblioteket konstruksjon for Herbarium prøver
check_url/54131?article_type=v

Retrospektiv MicroRNA sekvensering: Komplementære DNA biblioteket forberedelse protokollen bruker Formalin-fast parafin-embedded RNA prøver
check_url/54131?article_type=v

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering
check_url/54131?article_type=v

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)
check_url/54131?article_type=v

Semiconductor sekvensering for Preimplantation genetisk testing for avvik
check_url/54131?article_type=v

Sekvensering av mRNA fra hele Blood bruke Nanopore sekvensering

Read Article