Vi presenterar ett protokoll för analys av kranskärlen i hela embryonala murina hjärtan upp till E15.5, användning av standardimmunologiska färgningsmetoder följt av optisk clearance och konfokalmikroskopi. Denna teknik möjliggör visualisering av blodkärl i hela hjärtat utan behov av tidsödande analys av seriella sektioner.